MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 11878

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008321	GGC	2	6	329914	329919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_008321	GGT	2	6	329982	329987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_008321	GCT	2	6	330002	330007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_008321	A	6	6	330111	330116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_008321	AAT	2	6	330137	330142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_008321	T	6	6	330181	330186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_008321	TTTG	2	8	330236	330243	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_008321	TGG	2	6	332074	332079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_008321	CA	3	6	332100	332105	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_008321	TGA	2	6	332177	332182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008321	GAA	2	6	332277	332282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_008321	GAACCA	2	12	332357	332368	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_008321	CTACG	2	10	332434	332443	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1014	NC_008321	GAT	2	6	333520	333525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_008321	ATC	2	6	333535	333540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_008321	TAA	2	6	333557	333562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_008321	AAC	2	6	334380	334385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_008321	GTCC	2	8	336008	336015	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_008321	GCC	2	6	336022	336027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_008321	T	6	6	336043	336048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_008321	CTG	2	6	336222	336227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_008321	GT	3	6	336283	336288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_008321	GC	3	6	336306	336311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_008321	TAAA	2	8	336331	336338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_008321	TTA	2	6	341788	341793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_008321	A	7	7	341844	341850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_008321	AAGC	2	8	341928	341935	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_008321	GTT	2	6	344024	344029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_008321	CCA	2	6	344032	344037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_008321	A	6	6	346560	346565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_008321	T	7	7	346593	346599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_008321	T	6	6	346601	346606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_008321	TAA	2	6	346613	346618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_008321	ATA	2	6	347289	347294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_008321	A	6	6	347294	347299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_008321	GCA	2	6	347330	347335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_008321	GGCG	2	8	347918	347925	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_008321	A	7	7	348553	348559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_008321	TAAT	2	8	348622	348629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_008321	GAT	2	6	348635	348640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_008321	G	8	8	349836	349843	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_008321	CAA	2	6	351269	351274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_008321	GAG	2	6	351285	351290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_008321	CTT	2	6	351982	351987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_008321	ATTA	2	8	352038	352045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_008321	GTC	2	6	352054	352059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_008321	TTAAG	2	10	352139	352148	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_008321	GCGCA	2	10	352168	352177	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1049	NC_008321	TGT	2	6	352699	352704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_008321	CAT	2	6	352713	352718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_008321	GTT	2	6	352735	352740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_008321	GAT	2	6	352800	352805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_008321	GCAA	2	8	352833	352840	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_008321	TTTTA	2	10	352932	352941	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_008321	TTA	2	6	353421	353426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_008321	AAAT	2	8	354952	354959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_008321	AC	3	6	354964	354969	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_008321	GAC	2	6	355186	355191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_008321	TG	3	6	355239	355244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_008321	TCG	2	6	355245	355250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_008321	CAC	2	6	355254	355259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_008321	TGA	3	9	355952	355960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_008321	AG	3	6	355973	355978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_008321	GAT	2	6	355990	355995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_008321	TGA	3	9	358794	358802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_008321	T	6	6	358804	358809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_008321	GTA	2	6	358835	358840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_008321	TGC	2	6	360664	360669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_008321	CTAA	2	8	374373	374380	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_008321	TTA	2	6	374451	374456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_008321	TAA	2	6	374515	374520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_008321	TTA	2	6	374540	374545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_008321	CTG	2	6	374626	374631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_008321	A	6	6	374648	374653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_008321	GCC	2	6	375654	375659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_008321	ATTT	2	8	375731	375738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_008321	AT	3	6	377872	377877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_008321	ATT	2	6	377996	378001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_008321	TCA	2	6	378014	378019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_008321	T	6	6	378052	378057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_008321	T	6	6	378071	378076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_008321	ATT	2	6	378077	378082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_008321	ATA	2	6	378158	378163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_008321	GAG	2	6	378206	378211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_008321	AATA	2	8	379251	379258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_008321	GGCGC	2	10	381133	381142	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1087	NC_008321	ATTT	2	8	381145	381152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_008321	GCC	2	6	381175	381180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_008321	T	6	6	382445	382450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_008321	AAGT	2	8	382562	382569	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_008321	CAT	2	6	383920	383925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_008321	A	6	6	383926	383931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_008321	T	6	6	383947	383952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_008321	CTA	2	6	383959	383964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_008321	TGT	2	6	384872	384877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_008321	AT	3	6	384920	384925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_008321	GGT	2	6	385025	385030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_008321	CG	3	6	386633	386638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_008321	TGT	2	6	386657	386662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_008321	T	7	7	386691	386697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_008321	T	7	7	386709	386715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_008321	TAA	2	6	386747	386752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_008321	CGG	2	6	386757	386762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_008321	AGCA	2	8	386777	386784	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_008321	ATT	2	6	386895	386900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_008321	ATT	2	6	386910	386915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_008321	GCG	2	6	386930	386935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_008321	C	6	6	386980	386985	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1109	NC_008321	G	6	6	387000	387005	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_008321	TTC	2	6	387006	387011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_008321	GA	4	8	387097	387104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_008321	GCA	2	6	389065	389070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_008321	GCTTT	2	10	392654	392663	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1114	NC_008321	AGG	2	6	392683	392688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_008321	CA	3	6	392751	392756	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_008321	T	6	6	394275	394280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_008321	CGG	2	6	394371	394376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_008321	GCC	2	6	394384	394389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_008321	AAT	2	6	394830	394835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_008321	TACT	2	8	394893	394900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_008321	TGA	2	6	394948	394953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_008321	CTTT	2	8	395001	395008	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_008321	GAA	2	6	395032	395037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_008321	TTATC	2	10	395052	395061	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1125	NC_008321	TGG	2	6	395104	395109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_008321	CTG	2	6	395111	395116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_008321	CAA	2	6	395154	395159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_008321	GCC	2	6	395186	395191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_008321	A	7	7	396061	396067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_008321	CG	3	6	397617	397622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_008321	TCGC	2	8	398324	398331	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_008321	TCT	2	6	400050	400055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_008321	A	6	6	400479	400484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_008321	GC	3	6	400887	400892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_008321	CGG	2	6	400900	400905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_008321	TAA	2	6	400908	400913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_008321	TTG	2	6	400929	400934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_008321	ATCCC	2	10	400961	400970	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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1275	NC_008321	TA	3	6	475398	475403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1279	NC_008321	T	6	6	481733	481738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1285	NC_008321	TAT	2	6	486614	486619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1286	NC_008321	ATT	2	6	486649	486654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1289	NC_008321	T	6	6	486764	486769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1317	NC_008321	CTCGG	2	10	498594	498603	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1321	NC_008321	GTAG	2	8	505962	505969	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1392	NC_008321	CT	3	6	532440	532445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1393	NC_008321	CTATA	2	10	533793	533802	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1394	NC_008321	ACTC	2	8	533803	533810	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1395	NC_008321	CATG	2	8	533883	533890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1396	NC_008321	TTTA	2	8	533897	533904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1397	NC_008321	CAAAGT	3	18	533946	533963	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1399	NC_008321	TCC	2	6	534022	534027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1400	NC_008321	GTA	2	6	534176	534181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1401	NC_008321	AGA	2	6	534182	534187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1402	NC_008321	A	6	6	534192	534197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1403	NC_008321	AT	3	6	534259	534264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1404	NC_008321	CGG	2	6	534279	534284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1405	NC_008321	GCC	2	6	534292	534297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1406	NC_008321	AGC	2	6	534358	534363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1407	NC_008321	AT	4	8	534405	534412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1408	NC_008321	CAG	2	6	537100	537105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1409	NC_008321	A	6	6	537111	537116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_008321	A	6	6	537141	537146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1412	NC_008321	CCAT	2	8	537187	537194	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1413	NC_008321	AAG	2	6	537222	537227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_008321	CCGT	2	8	537280	537287	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1415	NC_008321	CA	3	6	537309	537314	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1422	NC_008321	T	6	6	537621	537626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_008321	ATG	2	6	539876	539881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1450	NC_008321	TTG	2	6	548053	548058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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