MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 11878

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008321	AGAT	2	8	194489	194496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
502	NC_008321	CAT	3	9	196780	196788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_008321	CCA	2	6	196801	196806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_008321	GGC	2	6	196812	196817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_008321	TAT	2	6	198057	198062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_008321	CCGC	2	8	199979	199986	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
507	NC_008321	CT	3	6	201320	201325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_008321	ATAA	2	8	201343	201350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_008321	ATT	2	6	201379	201384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_008321	A	6	6	201482	201487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_008321	ATG	2	6	201493	201498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_008321	GAA	2	6	201522	201527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_008321	A	6	6	201531	201536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_008321	CTG	2	6	201555	201560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_008321	CCT	2	6	201633	201638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_008321	AAAG	2	8	201649	201656	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
517	NC_008321	ACT	2	6	201665	201670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_008321	TG	3	6	201773	201778	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
519	NC_008321	AATG	2	8	201845	201852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008321	TACA	2	8	201871	201878	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
521	NC_008321	CTT	2	6	201904	201909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_008321	A	7	7	201968	201974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_008321	GGC	2	6	202016	202021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_008321	GCA	2	6	202047	202052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_008321	GCG	2	6	202080	202085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_008321	AGG	2	6	202175	202180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_008321	CGA	2	6	202255	202260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_008321	GAT	2	6	202280	202285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_008321	GCA	2	6	202329	202334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_008321	GT	3	6	202382	202387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_008321	GAA	2	6	202388	202393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_008321	GGA	2	6	202424	202429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_008321	AGA	2	6	202471	202476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_008321	CAG	2	6	202497	202502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_008321	G	6	6	202644	202649	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
536	NC_008321	GGA	2	6	202688	202693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_008321	GGC	2	6	202708	202713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_008321	GAA	2	6	202951	202956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_008321	TGC	2	6	203027	203032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_008321	GTC	2	6	203039	203044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_008321	GGA	2	6	203153	203158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_008321	GAC	2	6	203166	203171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_008321	TCA	2	6	203178	203183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_008321	AC	3	6	203204	203209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
545	NC_008321	TCG	2	6	203271	203276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_008321	AC	3	6	203373	203378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
547	NC_008321	AAG	2	6	203409	203414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_008321	CAC	2	6	203443	203448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_008321	CCT	2	6	203514	203519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_008321	CA	3	6	203604	203609	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
551	NC_008321	AGA	2	6	203622	203627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_008321	GGT	2	6	203690	203695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_008321	CCA	2	6	203712	203717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_008321	GCCT	2	8	203788	203795	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
555	NC_008321	AGG	2	6	203803	203808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_008321	CCA	2	6	203833	203838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_008321	T	6	6	203893	203898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_008321	TAAT	2	8	203933	203940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_008321	ATG	2	6	203944	203949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_008321	A	6	6	203970	203975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_008321	TCT	2	6	204033	204038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_008321	ACG	2	6	204076	204081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_008321	GTA	2	6	204169	204174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_008321	CAG	2	6	204241	204246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_008321	TAGTG	2	10	204275	204284	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
566	NC_008321	TAG	2	6	204349	204354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_008321	GCGA	2	8	204357	204364	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
568	NC_008321	TGA	2	6	204460	204465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_008321	G	6	6	204506	204511	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
570	NC_008321	TCC	2	6	204516	204521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_008321	CTGA	2	8	204536	204543	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
572	NC_008321	GGA	2	6	204826	204831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_008321	CGG	2	6	205048	205053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_008321	CGTC	2	8	205061	205068	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
575	NC_008321	AAC	2	6	205080	205085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_008321	AGC	2	6	205170	205175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_008321	CAT	2	6	205176	205181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_008321	AAAG	2	8	205184	205191	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
579	NC_008321	AGTCG	2	10	205206	205215	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
580	NC_008321	ACC	2	6	205248	205253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_008321	TGAAGG	2	12	205311	205322	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_008321	GA	3	6	205523	205528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
583	NC_008321	AGGCT	2	10	205535	205544	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
584	NC_008321	GCG	2	6	205548	205553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_008321	GGT	2	6	205572	205577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_008321	GGTG	2	8	205579	205586	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
587	NC_008321	TGA	2	6	205622	205627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_008321	AGT	2	6	205647	205652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_008321	TCT	2	6	205675	205680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_008321	GGT	2	6	205721	205726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_008321	GA	3	6	205751	205756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
592	NC_008321	GCT	2	6	205809	205814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_008321	ATTG	2	8	205954	205961	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
594	NC_008321	CGG	2	6	206002	206007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_008321	ATG	2	6	206078	206083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_008321	GTC	2	6	206259	206264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_008321	ACC	2	6	206273	206278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_008321	TGG	2	6	206333	206338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_008321	TCC	2	6	206359	206364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_008321	GGA	2	6	206376	206381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_008321	GACA	2	8	206453	206460	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
602	NC_008321	GGT	2	6	206496	206501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_008321	CGG	2	6	206583	206588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_008321	TCA	2	6	206611	206616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_008321	CGT	2	6	206691	206696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_008321	GAT	2	6	206731	206736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_008321	GAAC	2	8	206773	206780	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
608	NC_008321	GT	3	6	206944	206949	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_008321	AAG	2	6	207055	207060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_008321	CTGC	2	8	207094	207101	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
611	NC_008321	GTAA	2	8	207116	207123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
612	NC_008321	ATCCC	2	10	207167	207176	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
613	NC_008321	T	6	6	207289	207294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_008321	TGT	2	6	207324	207329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_008321	TGC	2	6	207392	207397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_008321	TTGT	2	8	210457	210464	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
617	NC_008321	CCA	2	6	210777	210782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_008321	TTAG	2	8	210805	210812	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
619	NC_008321	AAT	2	6	211005	211010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_008321	T	6	6	211039	211044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_008321	TATG	2	8	211048	211055	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
622	NC_008321	TCA	2	6	211059	211064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_008321	T	6	6	212321	212326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_008321	ATT	2	6	212337	212342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_008321	TGT	2	6	212366	212371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_008321	ATT	2	6	212509	212514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_008321	TA	3	6	213531	213536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_008321	GTT	2	6	213547	213552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_008321	GC	3	6	214780	214785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
630	NC_008321	CAT	2	6	214822	214827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_008321	T	7	7	214914	214920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_008321	GCTG	2	8	215522	215529	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
633	NC_008321	TAA	2	6	215532	215537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_008321	TAT	2	6	215944	215949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_008321	T	6	6	215990	215995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_008321	T	6	6	216007	216012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_008321	T	8	8	216032	216039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_008321	AAG	2	6	216205	216210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_008321	GA	3	6	220296	220301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
640	NC_008321	T	6	6	224559	224564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_008321	CCA	2	6	224633	224638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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651	NC_008321	T	6	6	229364	229369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
652	NC_008321	AGA	2	6	229720	229725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
653	NC_008321	GAG	2	6	230380	230385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
654	NC_008321	GGA	2	6	232438	232443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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672	NC_008321	T	8	8	247635	247642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
673	NC_008321	GGAT	2	8	247678	247685	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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683	NC_008321	GCC	2	6	253026	253031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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777	NC_008321	TCCGC	2	10	258636	258645	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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781	NC_008321	AAAT	2	8	258757	258764	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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791	NC_008321	GCG	2	6	265488	265493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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892	NC_008321	TGGG	2	8	286635	286642	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
893	NC_008321	TAT	2	6	286814	286819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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905	NC_008321	GTT	3	9	290681	290689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
906	NC_008321	GCAA	2	8	292886	292893	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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909	NC_008321	TAAT	2	8	294716	294723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
910	NC_008321	CCTA	2	8	294855	294862	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
911	NC_008321	AGTC	2	8	297276	297283	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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