MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 11878

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008321	GGT	2	6	2438270	2438275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_008321	T	6	6	2438275	2438280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_008321	AATT	2	8	2441274	2441281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_008321	TTAAA	2	10	2441294	2441303	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_008321	A	6	6	2441390	2441395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_008321	TCA	2	6	2441406	2441411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_008321	A	6	6	2441422	2441427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_008321	ACA	2	6	2441460	2441465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_008321	AACG	2	8	2443465	2443472	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6010	NC_008321	CTC	2	6	2444110	2444115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_008321	AC	3	6	2444152	2444157	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6012	NC_008321	AAT	2	6	2444227	2444232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_008321	TAT	2	6	2444817	2444822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_008321	GATT	2	8	2445367	2445374	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_008321	CTG	2	6	2447638	2447643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_008321	TG	3	6	2447657	2447662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_008321	CGG	2	6	2447664	2447669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_008321	ATT	2	6	2447690	2447695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_008321	TTG	2	6	2447697	2447702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_008321	CTAT	2	8	2447715	2447722	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6021	NC_008321	TTA	2	6	2447750	2447755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_008321	CT	3	6	2448088	2448093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6023	NC_008321	CAT	2	6	2448129	2448134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_008321	TTA	2	6	2448142	2448147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_008321	TTA	2	6	2448188	2448193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_008321	CAA	2	6	2448226	2448231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_008321	GAC	2	6	2448304	2448309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_008321	A	7	7	2448806	2448812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_008321	GTT	2	6	2448830	2448835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_008321	ACT	2	6	2448908	2448913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_008321	GGC	2	6	2448916	2448921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_008321	GAG	2	6	2448929	2448934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_008321	CCA	2	6	2449010	2449015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NC_008321	CCA	2	6	2449134	2449139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6035	NC_008321	CTG	2	6	2449172	2449177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_008321	GAAA	2	8	2449242	2449249	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_008321	CCA	2	6	2449335	2449340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6038	NC_008321	CTT	2	6	2449341	2449346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_008321	TCATT	2	10	2449349	2449358	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6040	NC_008321	TGCT	2	8	2449424	2449431	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6041	NC_008321	A	7	7	2449467	2449473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_008321	GGC	2	6	2450211	2450216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_008321	AGCTGC	2	12	2450233	2450244	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_008321	GCC	2	6	2451745	2451750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6045	NC_008321	GGC	2	6	2451766	2451771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_008321	CAG	2	6	2453933	2453938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_008321	A	6	6	2454140	2454145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_008321	AT	3	6	2454178	2454183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_008321	GCC	2	6	2454245	2454250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_008321	TTG	2	6	2454288	2454293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_008321	CG	3	6	2454350	2454355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6052	NC_008321	TCG	2	6	2454357	2454362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_008321	TTA	2	6	2454375	2454380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_008321	TAC	2	6	2454395	2454400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_008321	TGAT	2	8	2454430	2454437	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_008321	CTG	2	6	2454441	2454446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_008321	TCAG	2	8	2454505	2454512	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6058	NC_008321	TGC	2	6	2454878	2454883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_008321	TACC	2	8	2454890	2454897	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6060	NC_008321	ATT	2	6	2454932	2454937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_008321	GCA	2	6	2454998	2455003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_008321	TC	3	6	2455101	2455106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6063	NC_008321	AAT	2	6	2455112	2455117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_008321	TCA	2	6	2455226	2455231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_008321	CAC	2	6	2455247	2455252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6066	NC_008321	T	7	7	2455291	2455297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_008321	CGAGA	2	10	2455361	2455370	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6068	NC_008321	CGG	2	6	2455403	2455408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_008321	CGG	2	6	2455525	2455530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_008321	CGG	2	6	2455631	2455636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_008321	CAT	2	6	2455718	2455723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_008321	CGG	2	6	2455752	2455757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_008321	GAT	2	6	2455811	2455816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_008321	CGG	2	6	2455874	2455879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_008321	CCT	2	6	2455952	2455957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6076	NC_008321	ATC	2	6	2456048	2456053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_008321	GC	3	6	2458057	2458062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6078	NC_008321	TGT	2	6	2458100	2458105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_008321	ATA	2	6	2458126	2458131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_008321	AAT	2	6	2462942	2462947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_008321	AGT	2	6	2464292	2464297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_008321	ACT	2	6	2464316	2464321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_008321	TAAC	2	8	2465006	2465013	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6084	NC_008321	TTA	2	6	2465081	2465086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_008321	TGT	2	6	2465091	2465096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_008321	TTTTAA	2	12	2465419	2465430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_008321	GTTA	2	8	2465481	2465488	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_008321	TCAATA	2	12	2465507	2465518	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6089	NC_008321	TTATC	2	10	2466494	2466503	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6090	NC_008321	ATA	2	6	2466519	2466524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_008321	ATG	2	6	2466553	2466558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_008321	AAGT	2	8	2466571	2466578	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_008321	AAATTG	2	12	2466625	2466636	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_008321	AAG	2	6	2466653	2466658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_008321	AGT	2	6	2470283	2470288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_008321	TATTT	2	10	2470382	2470391	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_008321	AAAC	2	8	2470476	2470483	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6098	NC_008321	ATA	2	6	2472202	2472207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_008321	TAA	2	6	2472275	2472280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_008321	AAT	2	6	2473219	2473224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_008321	TAA	2	6	2473296	2473301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_008321	TTA	2	6	2473332	2473337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_008321	CA	3	6	2475332	2475337	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6104	NC_008321	ATAA	2	8	2475343	2475350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_008321	TTTA	2	8	2475424	2475431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_008321	TCA	2	6	2475432	2475437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_008321	TGT	2	6	2475462	2475467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_008321	AC	3	6	2477705	2477710	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6109	NC_008321	TAA	2	6	2477717	2477722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_008321	AT	3	6	2477831	2477836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_008321	TGC	3	9	2477892	2477900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_008321	ATC	2	6	2478004	2478009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_008321	TAAA	2	8	2478041	2478048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_008321	CT	3	6	2478051	2478056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6115	NC_008321	GCGA	2	8	2478114	2478121	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6116	NC_008321	CTT	2	6	2478139	2478144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_008321	GCC	2	6	2478279	2478284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6118	NC_008321	AAC	2	6	2478331	2478336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_008321	TCT	2	6	2483168	2483173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_008321	TTA	2	6	2483343	2483348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_008321	CTG	3	9	2484968	2484976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_008321	TG	3	6	2484978	2484983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_008321	T	6	6	2484991	2484996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_008321	TAA	2	6	2485017	2485022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_008321	TAA	2	6	2485043	2485048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_008321	T	6	6	2485081	2485086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_008321	TGAC	2	8	2485123	2485130	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6128	NC_008321	TCAG	2	8	2486966	2486973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6129	NC_008321	ACT	2	6	2486977	2486982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6131	NC_008321	CCA	2	6	2487033	2487038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6259	NC_008321	GTCA	2	8	2535783	2535790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6390	NC_008321	AAG	2	6	2583101	2583106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6391	NC_008321	TGCTC	2	10	2583120	2583129	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6392	NC_008321	TGCA	2	8	2583140	2583147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6393	NC_008321	CTTT	2	8	2583166	2583173	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6396	NC_008321	CATA	2	8	2583308	2583315	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6401	NC_008321	GCGGA	2	10	2583870	2583879	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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