MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 6645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008319	TCT	2	6	1405204	1405209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_008319	G	6	6	1405243	1405248	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_008319	ACG	2	6	1405283	1405288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_008319	AGG	2	6	1405317	1405322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_008319	CAT	2	6	1405330	1405335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_008319	TAAT	2	8	1405550	1405557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_008319	GTC	2	6	1408130	1408135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_008319	AAT	2	6	1409386	1409391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_008319	AAT	2	6	1409401	1409406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_008319	CGC	2	6	1410473	1410478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4011	NC_008319	GCT	2	6	1410510	1410515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_008319	AGG	2	6	1413156	1413161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_008319	TGC	2	6	1415512	1415517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_008319	AAC	2	6	1417933	1417938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_008319	GCAA	2	8	1417969	1417976	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4016	NC_008319	A	6	6	1417989	1417994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_008319	CAA	2	6	1418018	1418023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_008319	GAA	2	6	1419502	1419507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_008319	CCG	2	6	1419527	1419532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_008319	CAA	2	6	1419669	1419674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_008319	CGG	2	6	1419700	1419705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_008319	CCA	2	6	1419713	1419718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_008319	ACA	2	6	1419751	1419756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_008319	ACAAG	2	10	1419780	1419789	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4025	NC_008319	ACA	2	6	1420814	1420819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_008319	CAA	2	6	1420925	1420930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_008319	TTGAAG	2	12	1423575	1423586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_008319	A	8	8	1423612	1423619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_008319	CAG	2	6	1423637	1423642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_008319	AAC	2	6	1423660	1423665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_008319	ACT	2	6	1423695	1423700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_008319	TCAT	3	12	1423738	1423749	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4033	NC_008319	CCTC	2	8	1423799	1423806	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4034	NC_008319	ATG	2	6	1423843	1423848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_008319	GAAA	2	8	1423892	1423899	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_008319	ATTGC	2	10	1423903	1423912	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4037	NC_008319	T	6	6	1424564	1424569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_008319	T	7	7	1424597	1424603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_008319	GACT	2	8	1424668	1424675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4040	NC_008319	GAC	2	6	1424721	1424726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_008319	AAT	2	6	1424742	1424747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_008319	GCT	2	6	1425412	1425417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_008319	TCT	2	6	1425458	1425463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_008319	ATC	2	6	1425479	1425484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_008319	TC	3	6	1425483	1425488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4046	NC_008319	GA	3	6	1425500	1425505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_008319	GAG	2	6	1428337	1428342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_008319	T	8	8	1428356	1428363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_008319	A	6	6	1428381	1428386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_008319	CCT	2	6	1428404	1428409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4051	NC_008319	ATA	2	6	1428422	1428427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_008319	A	6	6	1428706	1428711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_008319	TAA	2	6	1429487	1429492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_008319	ACGC	2	8	1432091	1432098	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4055	NC_008319	GCA	3	9	1439412	1439420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_008319	CTT	2	6	1439942	1439947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_008319	GCA	2	6	1441168	1441173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_008319	CGAG	2	8	1441217	1441224	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4059	NC_008319	ACC	2	6	1442030	1442035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4060	NC_008319	TGTTT	2	10	1442037	1442046	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_008319	GTT	2	6	1442113	1442118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_008319	TCGA	2	8	1442456	1442463	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4063	NC_008319	CAG	2	6	1442816	1442821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_008319	TGG	2	6	1442824	1442829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_008319	G	6	6	1450879	1450884	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_008319	CGT	2	6	1450889	1450894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_008319	CAAT	2	8	1450913	1450920	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4068	NC_008319	GCA	2	6	1450923	1450928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_008319	TTGC	2	8	1450967	1450974	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4070	NC_008319	A	6	6	1451676	1451681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_008319	T	6	6	1453244	1453249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_008319	CAA	2	6	1455340	1455345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_008319	CCA	2	6	1455394	1455399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4074	NC_008319	CCG	2	6	1455927	1455932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4075	NC_008319	ATC	2	6	1455952	1455957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_008319	ATT	2	6	1455958	1455963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_008319	AAAC	2	8	1455976	1455983	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4078	NC_008319	CAC	2	6	1455986	1455991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4079	NC_008319	CAA	2	6	1456274	1456279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_008319	TCC	2	6	1456320	1456325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4081	NC_008319	CTA	2	6	1456391	1456396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_008319	CCT	2	6	1456638	1456643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4083	NC_008319	ATCA	2	8	1456668	1456675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4084	NC_008319	AATT	2	8	1456697	1456704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_008319	A	8	8	1456764	1456771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_008319	AGC	2	6	1456778	1456783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_008319	GTT	2	6	1456804	1456809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_008319	T	6	6	1456808	1456813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_008319	ACA	2	6	1456817	1456822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_008319	GCT	2	6	1456849	1456854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_008319	TC	3	6	1456866	1456871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4092	NC_008319	CAT	2	6	1456883	1456888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_008319	GAAT	2	8	1456901	1456908	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_008319	ACA	2	6	1456990	1456995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_008319	CA	3	6	1456994	1456999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4096	NC_008319	CAA	2	6	1458891	1458896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_008319	AGA	2	6	1459241	1459246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_008319	TGC	2	6	1468550	1468555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_008319	TGA	2	6	1471933	1471938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_008319	AAC	2	6	1472613	1472618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_008319	ATC	2	6	1474058	1474063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_008319	ATCA	2	8	1474066	1474073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4103	NC_008319	CAG	2	6	1475218	1475223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_008319	ACT	2	6	1475507	1475512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_008319	CCT	2	6	1476302	1476307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4106	NC_008319	CCT	2	6	1476330	1476335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4107	NC_008319	GAC	2	6	1476547	1476552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_008319	ACA	2	6	1476636	1476641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_008319	CGT	2	6	1477144	1477149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_008319	A	6	6	1478443	1478448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_008319	CAAA	2	8	1478482	1478489	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4112	NC_008319	AGA	2	6	1479660	1479665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_008319	ATGC	2	8	1479778	1479785	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4114	NC_008319	CAA	2	6	1479820	1479825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_008319	GAA	2	6	1481434	1481439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_008319	CGT	2	6	1481517	1481522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_008319	GCT	2	6	1481525	1481530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_008319	AAC	2	6	1481783	1481788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_008319	A	8	8	1481818	1481825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_008319	CTG	2	6	1481829	1481834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_008319	CAG	2	6	1481836	1481841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_008319	A	6	6	1481847	1481852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_008319	AT	3	6	1481914	1481919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_008319	AGC	2	6	1482066	1482071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_008319	TGC	2	6	1482087	1482092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_008319	CAA	2	6	1482098	1482103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_008319	GAA	2	6	1482136	1482141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_008319	A	7	7	1482162	1482168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_008319	CAT	2	6	1482177	1482182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_008319	CAT	2	6	1482219	1482224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_008319	CGA	2	6	1482261	1482266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_008319	CAG	2	6	1485998	1486003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_008319	A	6	6	1486013	1486018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_008319	GCT	2	6	1486036	1486041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4135	NC_008319	GTG	2	6	1486263	1486268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_008319	CAA	2	6	1486797	1486802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4137	NC_008319	GTT	2	6	1486810	1486815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_008319	GC	3	6	1486836	1486841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4139	NC_008319	CGAG	2	8	1487034	1487041	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4140	NC_008319	GGC	2	6	1487068	1487073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4143	NC_008319	TTG	2	6	1487119	1487124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4144	NC_008319	TCG	2	6	1487717	1487722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4146	NC_008319	CTC	2	6	1487805	1487810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4147	NC_008319	ACTC	2	8	1488054	1488061	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4148	NC_008319	CAAT	2	8	1488156	1488163	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4149	NC_008319	CTT	2	6	1488167	1488172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4152	NC_008319	CAT	2	6	1488324	1488329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4154	NC_008319	AAGC	2	8	1488828	1488835	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4158	NC_008319	AAAT	2	8	1489111	1489118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4159	NC_008319	AGT	2	6	1489154	1489159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4162	NC_008319	CAG	2	6	1489301	1489306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4163	NC_008319	TAA	2	6	1489495	1489500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4164	NC_008319	GA	5	10	1489561	1489570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4165	NC_008319	GA	3	6	1489667	1489672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4201	NC_008319	AAAG	2	8	1506990	1506997	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4203	NC_008319	TTCA	3	12	1507879	1507890	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4204	NC_008319	CTTTT	2	10	1507906	1507915	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4213	NC_008319	GAT	2	6	1508953	1508958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4215	NC_008319	GTT	2	6	1509020	1509025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4217	NC_008319	AATA	2	8	1509048	1509055	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4233	NC_008319	C	6	6	1512937	1512942	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4234	NC_008319	CAG	2	6	1512974	1512979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4240	NC_008319	CTT	2	6	1513702	1513707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4241	NC_008319	AG	3	6	1513750	1513755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4242	NC_008319	CGT	2	6	1513776	1513781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4243	NC_008319	GCT	2	6	1513785	1513790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4244	NC_008319	CCA	2	6	1513832	1513837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4245	NC_008319	TCCA	2	8	1513905	1513912	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4246	NC_008319	CAG	2	6	1513921	1513926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4247	NC_008319	AATCCT	2	12	1513934	1513945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4250	NC_008319	ACA	2	6	1514004	1514009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4251	NC_008319	CTTTG	2	10	1514039	1514048	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4252	NC_008319	GCAGG	2	10	1514143	1514152	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4253	NC_008319	AACA	2	8	1514351	1514358	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4254	NC_008319	CGC	3	9	1514389	1514397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4255	NC_008319	CTG	2	6	1514401	1514406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4256	NC_008319	TAG	2	6	1514407	1514412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_008319	G	6	6	1514463	1514468	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_008319	GAC	2	6	1514487	1514492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4259	NC_008319	TC	3	6	1514539	1514544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4261	NC_008319	TGT	2	6	1514689	1514694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4389	NC_008319	A	7	7	1585607	1585613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4390	NC_008319	CTC	2	6	1585614	1585619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4391	NC_008319	TTTTG	2	10	1586101	1586110	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4499	NC_008319	TACAT	2	10	1611980	1611989	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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