MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 6645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008319	CTT	2	6	1050939	1050944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_008319	GGTT	2	8	1050966	1050973	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_008319	TGA	2	6	1059255	1059260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_008319	CAT	2	6	1061405	1061410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_008319	CTGA	2	8	1061421	1061428	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3006	NC_008319	A	6	6	1061478	1061483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_008319	ATG	2	6	1061504	1061509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_008319	GAA	2	6	1062734	1062739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_008319	GTTT	2	8	1062790	1062797	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_008319	TGAAA	2	10	1064339	1064348	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_008319	CTGAT	2	10	1064458	1064467	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3012	NC_008319	CT	3	6	1064500	1064505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3013	NC_008319	T	6	6	1064554	1064559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_008319	GCC	2	6	1064616	1064621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3015	NC_008319	AGC	2	6	1064626	1064631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_008319	GACG	2	8	1064730	1064737	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3017	NC_008319	TAAC	2	8	1064806	1064813	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3018	NC_008319	ATG	2	6	1064814	1064819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_008319	GGA	2	6	1064822	1064827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_008319	GAT	2	6	1069557	1069562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_008319	GAG	2	6	1069636	1069641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_008319	CAA	2	6	1069648	1069653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_008319	TTA	2	6	1069656	1069661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_008319	TCA	2	6	1069745	1069750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_008319	TCA	2	6	1069882	1069887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_008319	CAGG	2	8	1071538	1071545	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_008319	CTG	2	6	1071645	1071650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_008319	TCG	2	6	1071846	1071851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_008319	GTTG	2	8	1071892	1071899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_008319	CCT	2	6	1072429	1072434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_008319	TCT	3	9	1072485	1072493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_008319	TTA	2	6	1072536	1072541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_008319	TGA	2	6	1072552	1072557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_008319	TCC	2	6	1072889	1072894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_008319	T	6	6	1072924	1072929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_008319	TGT	2	6	1072943	1072948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_008319	ATGG	2	8	1072983	1072990	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_008319	ATTC	2	8	1073007	1073014	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3039	NC_008319	TCA	2	6	1073095	1073100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_008319	GT	3	6	1073125	1073130	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_008319	G	6	6	1073136	1073141	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_008319	AAC	2	6	1073143	1073148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_008319	TCAC	2	8	1073158	1073165	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3044	NC_008319	ACT	2	6	1073182	1073187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_008319	TGG	2	6	1073247	1073252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_008319	A	6	6	1073257	1073262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_008319	GCTAAT	2	12	1073294	1073305	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3048	NC_008319	TGA	2	6	1073331	1073336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_008319	GTT	2	6	1073347	1073352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_008319	TTG	2	6	1073429	1073434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_008319	CTA	2	6	1073464	1073469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_008319	GTG	2	6	1073487	1073492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_008319	GGT	2	6	1074842	1074847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_008319	CAA	2	6	1074873	1074878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_008319	GAAC	2	8	1074904	1074911	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3056	NC_008319	AATC	2	8	1076114	1076121	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3057	NC_008319	GT	3	6	1076382	1076387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_008319	GGT	2	6	1076395	1076400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_008319	C	6	6	1076419	1076424	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3060	NC_008319	GAT	2	6	1078408	1078413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_008319	TTGA	2	8	1078422	1078429	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_008319	ATG	2	6	1078508	1078513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_008319	GTA	2	6	1078525	1078530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_008319	AGGAG	2	10	1078575	1078584	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_008319	GGA	2	6	1078608	1078613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_008319	GCTT	2	8	1078633	1078640	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3067	NC_008319	TGA	2	6	1078661	1078666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_008319	T	6	6	1078722	1078727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_008319	TGCT	2	8	1078759	1078766	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3070	NC_008319	GA	3	6	1078810	1078815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_008319	A	6	6	1078826	1078831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_008319	TGG	2	6	1078857	1078862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_008319	G	7	7	1078864	1078870	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_008319	CGA	2	6	1078904	1078909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_008319	AAG	2	6	1079976	1079981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_008319	TGA	2	6	1081552	1081557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_008319	TGC	2	6	1084951	1084956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_008319	CTAT	2	8	1087084	1087091	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3079	NC_008319	TAA	2	6	1087099	1087104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_008319	TTC	2	6	1087110	1087115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_008319	GTTG	2	8	1087467	1087474	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_008319	GCT	2	6	1089469	1089474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_008319	TGAT	2	8	1091498	1091505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_008319	ATG	2	6	1091535	1091540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_008319	CAA	2	6	1091753	1091758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_008319	AAT	2	6	1091783	1091788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_008319	GA	3	6	1092517	1092522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_008319	TGA	2	6	1092524	1092529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_008319	A	7	7	1092569	1092575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_008319	CCA	2	6	1105116	1105121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3091	NC_008319	TGT	2	6	1105130	1105135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_008319	TCT	2	6	1105152	1105157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_008319	TAT	2	6	1105782	1105787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_008319	GATCT	2	10	1105804	1105813	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3095	NC_008319	TGA	2	6	1105826	1105831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_008319	AAG	2	6	1109872	1109877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_008319	TCA	2	6	1113723	1113728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_008319	GTTGT	2	10	1113757	1113766	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_008319	TTG	2	6	1113816	1113821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_008319	TGAT	2	8	1113850	1113857	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_008319	GTG	2	6	1113860	1113865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_008319	TGT	2	6	1113901	1113906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_008319	TGC	2	6	1113912	1113917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_008319	TC	3	6	1113939	1113944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3105	NC_008319	TGT	2	6	1113985	1113990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_008319	TC	3	6	1113992	1113997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3107	NC_008319	CCT	2	6	1114040	1114045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_008319	TTG	2	6	1114103	1114108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_008319	CAG	2	6	1114118	1114123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_008319	GCT	2	6	1114124	1114129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_008319	GT	3	6	1114147	1114152	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_008319	TTGA	2	8	1114175	1114182	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_008319	AT	3	6	1115445	1115450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_008319	GCA	2	6	1116578	1116583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_008319	AGA	2	6	1116636	1116641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_008319	TGA	2	6	1116675	1116680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_008319	TTG	2	6	1116730	1116735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_008319	GTG	2	6	1116773	1116778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_008319	TTC	2	6	1116784	1116789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_008319	T	6	6	1118936	1118941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_008319	TCG	2	6	1119049	1119054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_008319	CTT	2	6	1119981	1119986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_008319	CAG	3	9	1120038	1120046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_008319	ATT	2	6	1120362	1120367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_008319	CCAGGA	2	12	1120400	1120411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_008319	G	6	6	1120488	1120493	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_008319	TTG	2	6	1120539	1120544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_008319	TGGC	2	8	1121246	1121253	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3129	NC_008319	TCT	2	6	1121675	1121680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_008319	AGC	2	6	1121687	1121692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_008319	AG	3	6	1121698	1121703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_008319	GTTG	2	8	1121729	1121736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_008319	GCT	2	6	1121743	1121748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_008319	GCC	2	6	1121981	1121986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3135	NC_008319	GCT	2	6	1122082	1122087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_008319	TGA	2	6	1122097	1122102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3140	NC_008319	TC	3	6	1122323	1122328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3141	NC_008319	TGT	2	6	1122388	1122393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3142	NC_008319	TGA	2	6	1122417	1122422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3153	NC_008319	T	6	6	1124810	1124815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3163	NC_008319	T	6	6	1127363	1127368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3164	NC_008319	TAA	2	6	1127388	1127393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3202	NC_008319	TATT	2	8	1129890	1129897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3231	NC_008319	CCCGC	2	10	1134995	1135004	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3232	NC_008319	TTTTG	2	10	1135026	1135035	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3241	NC_008319	CTG	2	6	1135416	1135421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3246	NC_008319	TGA	2	6	1135651	1135656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3249	NC_008319	TTG	2	6	1135717	1135722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3250	NC_008319	CTG	2	6	1135883	1135888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3251	NC_008319	GTT	2	6	1135910	1135915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_008319	CTG	2	6	1135972	1135977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3253	NC_008319	TCCA	2	8	1136008	1136015	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3254	NC_008319	AGCTT	2	10	1136063	1136072	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3255	NC_008319	GCAA	2	8	1136094	1136101	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3256	NC_008319	T	8	8	1136205	1136212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3257	NC_008319	TAT	2	6	1136220	1136225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3258	NC_008319	AGA	2	6	1136252	1136257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3259	NC_008319	GAT	2	6	1136328	1136333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_008319	CTTT	2	8	1136400	1136407	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3262	NC_008319	T	7	7	1136437	1136443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3390	NC_008319	TGCC	2	8	1175516	1175523	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3395	NC_008319	TTGCT	2	10	1177608	1177617	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3396	NC_008319	TGATTT	2	12	1177646	1177657	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3397	NC_008319	G	6	6	1178457	1178462	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3398	NC_008319	GAG	2	6	1182741	1182746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3399	NC_008319	GGT	2	6	1185602	1185607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3400	NC_008319	GTCA	2	8	1186736	1186743	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3401	NC_008319	GATC	2	8	1187060	1187067	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3402	NC_008319	TGA	2	6	1187080	1187085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3408	NC_008319	CT	3	6	1192014	1192019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3413	NC_008319	A	6	6	1202745	1202750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3414	NC_008319	ATC	2	6	1202785	1202790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3426	NC_008319	GCC	2	6	1221536	1221541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3432	NC_008319	TTGA	2	8	1221770	1221777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3433	NC_008319	CAG	2	6	1221904	1221909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3435	NC_008319	CTTC	2	8	1222036	1222043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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