MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 6645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008319	GAT	2	6	721659	721664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_008319	GTT	2	6	721687	721692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_008319	T	6	6	721715	721720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_008319	GT	4	8	721728	721735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_008319	TG	3	6	723267	723272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_008319	CAT	2	6	723291	723296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_008319	TGT	2	6	723349	723354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_008319	GGA	2	6	723356	723361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_008319	TC	3	6	723982	723987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_008319	TG	3	6	724092	724097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_008319	CAA	2	6	724104	724109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_008319	TGA	2	6	727173	727178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_008319	CAA	2	6	727360	727365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_008319	GTT	2	6	727373	727378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_008319	GC	3	6	727399	727404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1516	NC_008319	CGAG	2	8	727597	727604	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1517	NC_008319	GGC	2	6	727631	727636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_008319	CAG	2	6	728159	728164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_008319	ATTT	2	8	728167	728174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_008319	TGTT	2	8	728182	728189	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_008319	AGGC	2	8	728268	728275	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1522	NC_008319	TCA	2	6	728332	728337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_008319	GGA	2	6	728346	728351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_008319	GA	3	6	728465	728470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_008319	TTGT	2	8	728536	728543	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_008319	TGA	2	6	728547	728552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_008319	T	6	6	728553	728558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_008319	CTTT	2	8	728593	728600	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1529	NC_008319	GCT	2	6	728691	728696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_008319	TTTG	2	8	728714	728721	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_008319	GTT	2	6	728897	728902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_008319	GTGA	2	8	728910	728917	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_008319	GA	3	6	732391	732396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_008319	CAT	2	6	732412	732417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_008319	AGGTG	2	10	732487	732496	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_008319	CAG	2	6	732927	732932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_008319	TGT	2	6	733055	733060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_008319	TTC	2	6	733151	733156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_008319	AGG	2	6	733384	733389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_008319	GTG	2	6	733392	733397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_008319	TGT	2	6	733488	733493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_008319	TG	3	6	733547	733552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_008319	CATC	2	8	733569	733576	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_008319	AGA	2	6	733628	733633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_008319	AGT	2	6	733638	733643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_008319	TCT	2	6	733684	733689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_008319	GTC	2	6	733722	733727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_008319	T	6	6	733747	733752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_008319	CTG	2	6	733753	733758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_008319	TTGT	2	8	733759	733766	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_008319	AGA	2	6	733847	733852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_008319	AGG	2	6	733915	733920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_008319	GTT	2	6	733930	733935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_008319	ATTG	2	8	733937	733944	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_008319	GCT	2	6	734028	734033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_008319	TC	3	6	734080	734085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_008319	TTTC	2	8	734087	734094	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1558	NC_008319	TTTG	2	8	734174	734181	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_008319	CTTGG	2	10	734279	734288	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1560	NC_008319	AAG	2	6	734308	734313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_008319	TGCT	2	8	734332	734339	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1562	NC_008319	TGC	2	6	734357	734362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_008319	TGA	3	9	734369	734377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_008319	A	6	6	734393	734398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_008319	AGC	2	6	734554	734559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_008319	CTC	2	6	734579	734584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_008319	GAG	2	6	734593	734598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_008319	G	6	6	734629	734634	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_008319	GAC	2	6	736802	736807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_008319	CCT	2	6	736811	736816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_008319	CAC	2	6	737406	737411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_008319	GTTG	2	8	738231	738238	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_008319	TCTT	2	8	739305	739312	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1574	NC_008319	AATC	2	8	740957	740964	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_008319	TGT	2	6	741023	741028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_008319	GTGC	2	8	741052	741059	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1577	NC_008319	ATC	2	6	741108	741113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_008319	TAT	2	6	741149	741154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_008319	GTA	2	6	741168	741173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_008319	TTG	2	6	741741	741746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_008319	GTA	2	6	741776	741781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_008319	T	6	6	741809	741814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_008319	ATGT	2	8	741909	741916	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_008319	AAG	2	6	741947	741952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_008319	TGCA	2	8	742052	742059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1586	NC_008319	T	6	6	742083	742088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_008319	TCGAT	2	10	742259	742268	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1588	NC_008319	ACT	2	6	742361	742366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_008319	GT	3	6	742417	742422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1591	NC_008319	ATG	2	6	742476	742481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_008319	CT	3	6	742497	742502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_008319	TCT	2	6	742510	742515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_008319	ACG	2	6	742641	742646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_008319	ATG	2	6	742877	742882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_008319	TGA	2	6	743196	743201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_008319	CTG	2	6	743243	743248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1599	NC_008319	TGG	3	9	746590	746598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_008319	A	6	6	746614	746619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_008319	GCT	2	6	746629	746634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_008319	TGG	2	6	748729	748734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_008319	TGC	2	6	750225	750230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_008319	GCG	2	6	750267	750272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_008319	GAGT	2	8	750282	750289	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_008319	GCG	2	6	750306	750311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_008319	ACG	2	6	751403	751408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_008319	TGC	2	6	751499	751504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_008319	T	7	7	753588	753594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_008319	TGC	2	6	753600	753605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_008319	TGG	2	6	754112	754117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_008319	ATC	2	6	758674	758679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_008319	A	6	6	758829	758834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_008319	AGC	2	6	758838	758843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1616	NC_008319	GGA	2	6	759119	759124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_008319	TTG	2	6	759147	759152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_008319	CAA	2	6	762626	762631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_008319	GGT	2	6	762657	762662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_008319	GCA	2	6	762734	762739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_008319	TCC	2	6	762949	762954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_008319	CAG	2	6	762955	762960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_008319	AAC	2	6	762977	762982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1625	NC_008319	G	6	6	764969	764974	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_008319	T	6	6	764978	764983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1629	NC_008319	GTT	2	6	768445	768450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_008319	GCATG	2	10	768483	768492	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1631	NC_008319	TGAA	2	8	768528	768535	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_008319	AAC	2	6	768591	768596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_008319	ATT	2	6	768602	768607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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