MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 6645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008319	ATTG	2	8	580908	580915	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_008319	AAG	2	6	580943	580948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_008319	TC	3	6	580989	580994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_008319	TCC	2	6	581035	581040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_008319	TTG	2	6	581068	581073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_008319	GT	3	6	581222	581227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_008319	CTT	2	6	581291	581296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_008319	ATT	2	6	581306	581311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_008319	TAAT	2	8	581355	581362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_008319	TTTG	2	8	581573	581580	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008319	TGAAT	2	10	581617	581626	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_008319	GAA	2	6	581660	581665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_008319	CT	4	8	581743	581750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_008319	TCT	2	6	581769	581774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_008319	T	8	8	581808	581815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_008319	GTT	2	6	581824	581829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_008319	GGT	2	6	581940	581945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_008319	ACT	2	6	581973	581978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_008319	TTA	2	6	582081	582086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_008319	TGC	2	6	582098	582103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_008319	TTG	2	6	582119	582124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_008319	ATTTA	2	10	582167	582176	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_008319	T	8	8	582177	582184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_008319	T	6	6	582191	582196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_008319	GTA	2	6	582284	582289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_008319	T	6	6	582327	582332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_008319	T	6	6	582341	582346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_008319	T	6	6	582359	582364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_008319	TCT	2	6	582445	582450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_008319	ATC	2	6	582561	582566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_008319	ACT	2	6	582606	582611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_008319	T	6	6	582644	582649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_008319	ATT	2	6	582661	582666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_008319	TCT	3	9	582667	582675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_008319	TCA	2	6	582700	582705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_008319	CTT	2	6	582731	582736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_008319	AT	3	6	582742	582747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_008319	T	8	8	582889	582896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_008319	ATG	2	6	582914	582919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1041	NC_008319	TTG	2	6	583221	583226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_008319	TTGT	2	8	583252	583259	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_008319	CTC	2	6	583330	583335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_008319	ATTC	2	8	583367	583374	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_008319	GA	3	6	583378	583383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_008319	GTT	2	6	583425	583430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_008319	GTT	2	6	583445	583450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1049	NC_008319	TGAT	2	8	583578	583585	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_008319	A	7	7	583592	583598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1053	NC_008319	TGTT	2	8	584534	584541	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1055	NC_008319	TGT	2	6	584725	584730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_008319	A	7	7	584756	584762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_008319	CTTTGA	2	12	584784	584795	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1058	NC_008319	AG	3	6	585649	585654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_008319	TTG	2	6	585872	585877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_008319	TAAATG	2	12	585954	585965	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_008319	T	6	6	586050	586055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_008319	TAA	2	6	586165	586170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_008319	TGC	2	6	586174	586179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_008319	TCCAG	2	10	586214	586223	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1065	NC_008319	ATT	2	6	586228	586233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_008319	CGA	2	6	586258	586263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_008319	TCA	2	6	586308	586313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1069	NC_008319	CAG	2	6	586403	586408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1071	NC_008319	GTTG	3	12	586522	586533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_008319	TTG	2	6	586551	586556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_008319	AGT	2	6	586598	586603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1079	NC_008319	AGTGA	2	10	586960	586969	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_008319	CGT	2	6	586985	586990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_008319	GA	4	8	587031	587038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_008319	TCA	2	6	587080	587085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1089	NC_008319	TTA	2	6	596882	596887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1091	NC_008319	TTG	2	6	596910	596915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_008319	GC	3	6	596947	596952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_008319	GGT	2	6	596983	596988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1095	NC_008319	GAG	2	6	597047	597052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1107	NC_008319	TGG	2	6	597841	597846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_008319	GCTT	2	8	597847	597854	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_008319	TTA	2	6	597958	597963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1111	NC_008319	ATC	2	6	598041	598046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_008319	TTA	2	6	598406	598411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1115	NC_008319	GAA	2	6	598926	598931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_008319	TCTA	2	8	598970	598977	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_008319	GTT	2	6	598978	598983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_008319	TG	3	6	598997	599002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_008319	A	6	6	599080	599085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1123	NC_008319	TTG	2	6	599284	599289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_008319	CTG	2	6	599613	599618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_008319	A	6	6	599690	599695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_008319	CTG	2	6	599698	599703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_008319	GAAA	2	8	599737	599744	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_008319	AAG	2	6	600389	600394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_008319	AAT	2	6	603718	603723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_008319	ATG	2	6	607936	607941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_008319	TTG	2	6	607950	607955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_008319	GCT	2	6	608011	608016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_008319	TTC	2	6	608594	608599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_008319	T	6	6	608849	608854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1136	NC_008319	TGA	2	6	608892	608897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_008319	TTC	2	6	608910	608915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_008319	CCA	2	6	608985	608990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1139	NC_008319	GTAT	2	8	608994	609001	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1149	NC_008319	TTG	2	6	609629	609634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1163	NC_008319	TAA	2	6	613321	613326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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