MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 6645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008319	A	7	7	2109847	2109853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_008319	AAGCC	2	10	2109869	2109878	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5503	NC_008319	TGA	2	6	2109965	2109970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_008319	ACC	2	6	2110359	2110364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_008319	AAGTGG	2	12	2110407	2110418	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_008319	ATCA	2	8	2110946	2110953	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5507	NC_008319	GA	3	6	2111115	2111120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_008319	AATTT	2	10	2111190	2111199	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_008319	GAACA	2	10	2111261	2111270	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5510	NC_008319	TGAA	2	8	2111289	2111296	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_008319	AAG	2	6	2111644	2111649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_008319	CAA	2	6	2111672	2111677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_008319	CAG	2	6	2111711	2111716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_008319	CTT	2	6	2111747	2111752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_008319	GCTG	2	8	2111773	2111780	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5516	NC_008319	CAAA	2	8	2111788	2111795	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5517	NC_008319	A	7	7	2111793	2111799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_008319	CGAC	2	8	2111993	2112000	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5519	NC_008319	CAA	2	6	2112099	2112104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_008319	AAC	2	6	2112123	2112128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_008319	TCCT	2	8	2112132	2112139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5522	NC_008319	AAAGC	2	10	2112196	2112205	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5523	NC_008319	CA	4	8	2112249	2112256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5524	NC_008319	AGGA	2	8	2112377	2112384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_008319	A	6	6	2112487	2112492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_008319	GAA	2	6	2112558	2112563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_008319	ACA	2	6	2112647	2112652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_008319	AAAAT	2	10	2112681	2112690	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_008319	GAT	2	6	2112699	2112704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_008319	ACA	2	6	2112722	2112727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_008319	CAT	2	6	2113085	2113090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_008319	GTGGC	2	10	2113091	2113100	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5533	NC_008319	CTT	2	6	2113409	2113414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_008319	TGG	2	6	2113459	2113464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_008319	TAG	2	6	2113504	2113509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_008319	CAA	2	6	2113571	2113576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_008319	AGGGG	2	10	2113589	2113598	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_008319	CTT	2	6	2113638	2113643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_008319	ATC	2	6	2113674	2113679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_008319	TGC	2	6	2114130	2114135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_008319	CCA	2	6	2114149	2114154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5542	NC_008319	A	6	6	2114181	2114186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_008319	AT	3	6	2114229	2114234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_008319	T	7	7	2114238	2114244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_008319	ACAA	2	8	2114278	2114285	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5546	NC_008319	ACAA	2	8	2114349	2114356	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5547	NC_008319	TA	3	6	2114367	2114372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_008319	CTG	2	6	2114440	2114445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_008319	AGA	2	6	2115259	2115264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_008319	TCA	2	6	2115271	2115276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_008319	CATT	2	8	2115385	2115392	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5552	NC_008319	AGC	2	6	2115409	2115414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_008319	GCT	2	6	2115434	2115439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_008319	ACA	2	6	2115510	2115515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_008319	AGA	2	6	2115545	2115550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_008319	TTC	2	6	2115621	2115626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_008319	ATT	2	6	2115628	2115633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_008319	TCT	2	6	2115634	2115639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_008319	CATT	2	8	2115669	2115676	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5560	NC_008319	AAG	2	6	2115752	2115757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_008319	AAG	2	6	2115798	2115803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_008319	GAG	2	6	2115889	2115894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_008319	A	6	6	2116117	2116122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_008319	CAA	2	6	2116208	2116213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_008319	AGAT	2	8	2116256	2116263	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_008319	TC	3	6	2116269	2116274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5567	NC_008319	TTTC	2	8	2116280	2116287	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5568	NC_008319	TGGT	2	8	2116400	2116407	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_008319	GAC	2	6	2116466	2116471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_008319	CAC	2	6	2116493	2116498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_008319	GTC	2	6	2116499	2116504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_008319	GTA	2	6	2116505	2116510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_008319	GAA	2	6	2116542	2116547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_008319	AGA	2	6	2116558	2116563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_008319	GT	3	6	2116578	2116583	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_008319	GCA	3	9	2116645	2116653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_008319	CAG	2	6	2116660	2116665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_008319	AGAGGC	2	12	2116680	2116691	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5579	NC_008319	GAA	2	6	2116769	2116774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_008319	AAG	2	6	2116903	2116908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_008319	AGG	2	6	2116973	2116978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_008319	ACAA	2	8	2117689	2117696	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5583	NC_008319	CTT	2	6	2117741	2117746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_008319	GA	3	6	2117826	2117831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_008319	AGA	2	6	2117864	2117869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_008319	AGG	3	9	2117893	2117901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_008319	TGG	2	6	2118476	2118481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_008319	CA	3	6	2118785	2118790	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5589	NC_008319	TTA	2	6	2118806	2118811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_008319	TC	3	6	2118836	2118841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5591	NC_008319	TGGT	2	8	2118848	2118855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_008319	AGC	2	6	2118923	2118928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_008319	GTT	2	6	2119028	2119033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_008319	CTT	2	6	2119037	2119042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_008319	ACCTT	2	10	2119075	2119084	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5596	NC_008319	GA	4	8	2119097	2119104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_008319	CGAG	2	8	2119117	2119124	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5598	NC_008319	TGG	2	6	2119184	2119189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_008319	GTC	2	6	2119199	2119204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_008319	TGG	2	6	2119690	2119695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_008319	CT	3	6	2119717	2119722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5602	NC_008319	TC	3	6	2119773	2119778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5603	NC_008319	GAG	2	6	2119819	2119824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_008319	CTT	2	6	2119890	2119895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_008319	CTC	2	6	2119896	2119901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5606	NC_008319	CTT	2	6	2119953	2119958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_008319	GAC	2	6	2120542	2120547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_008319	TGA	2	6	2120570	2120575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_008319	A	6	6	2122497	2122502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_008319	ATTA	2	8	2122539	2122546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_008319	CGC	2	6	2122566	2122571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5612	NC_008319	CTG	2	6	2122605	2122610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_008319	TTC	2	6	2122639	2122644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_008319	TCGAT	2	10	2122646	2122655	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5615	NC_008319	ACTG	2	8	2122959	2122966	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5616	NC_008319	TGC	2	6	2122980	2122985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_008319	GTT	2	6	2123018	2123023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_008319	TAAT	2	8	2123090	2123097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_008319	CCT	2	6	2123185	2123190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5620	NC_008319	CGG	2	6	2123249	2123254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_008319	C	6	6	2123260	2123265	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5622	NC_008319	GGCC	2	8	2123268	2123275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5623	NC_008319	CGA	2	6	2123488	2123493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_008319	CGT	2	6	2123497	2123502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_008319	CTG	2	6	2123521	2123526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_008319	TCA	2	6	2123542	2123547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_008319	ATC	2	6	2123634	2123639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_008319	CGTC	2	8	2123685	2123692	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5629	NC_008319	AGGCA	2	10	2123755	2123764	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5630	NC_008319	GCAA	2	8	2124103	2124110	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5632	NC_008319	GCT	2	6	2125696	2125701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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