MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 6645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008319	AAAC	2	8	1885735	1885742	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5002	NC_008319	AGG	2	6	1885752	1885757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_008319	C	6	6	1888756	1888761	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5004	NC_008319	CTCTC	2	10	1892733	1892742	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5005	NC_008319	T	8	8	1893743	1893750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_008319	TCA	2	6	1893788	1893793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_008319	A	6	6	1898289	1898294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_008319	A	6	6	1900790	1900795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_008319	AAATTT	2	12	1900826	1900837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_008319	TCAAA	2	10	1900864	1900873	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5011	NC_008319	GAAG	2	8	1900921	1900928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_008319	TAGG	2	8	1903559	1903566	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_008319	AG	3	6	1903567	1903572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_008319	AGG	2	6	1903582	1903587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_008319	TCAA	2	8	1904140	1904147	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5016	NC_008319	GGGA	2	8	1905354	1905361	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_008319	CTG	2	6	1905371	1905376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_008319	TGAAC	2	10	1907805	1907814	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5019	NC_008319	GTG	2	6	1907958	1907963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_008319	TGG	2	6	1910973	1910978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_008319	GAA	2	6	1915621	1915626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_008319	CCG	2	6	1915663	1915668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5023	NC_008319	CGC	2	6	1915752	1915757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_008319	GCC	2	6	1915784	1915789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5025	NC_008319	AC	3	6	1915803	1915808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_008319	ACC	2	6	1916854	1916859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_008319	TGA	2	6	1917217	1917222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_008319	GCTT	2	8	1917238	1917245	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5029	NC_008319	GCA	2	6	1920079	1920084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_008319	CT	3	6	1920100	1920105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5031	NC_008319	GCT	2	6	1920114	1920119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_008319	CAGGAT	2	12	1920690	1920701	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5033	NC_008319	AACAAG	2	12	1921516	1921527	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5034	NC_008319	ACCA	2	8	1921548	1921555	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5035	NC_008319	AGCA	2	8	1921597	1921604	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5036	NC_008319	TGAA	2	8	1921684	1921691	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_008319	AAG	2	6	1922041	1922046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_008319	AG	3	6	1922144	1922149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_008319	ATG	2	6	1922358	1922363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_008319	AAGGA	2	10	1922556	1922565	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_008319	TTC	2	6	1922674	1922679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_008319	AAT	2	6	1922694	1922699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_008319	AAC	2	6	1922701	1922706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_008319	AAG	2	6	1923582	1923587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_008319	CAC	2	6	1924470	1924475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5046	NC_008319	AGA	2	6	1924492	1924497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_008319	AACC	2	8	1924519	1924526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_008319	CGA	2	6	1924532	1924537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_008319	CAT	2	6	1924579	1924584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_008319	AAGC	2	8	1924869	1924876	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5051	NC_008319	CTT	2	6	1924893	1924898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_008319	TAC	2	6	1924925	1924930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_008319	ATC	2	6	1924971	1924976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_008319	CAA	2	6	1927048	1927053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_008319	A	6	6	1927052	1927057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_008319	GGT	2	6	1927059	1927064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_008319	ACC	2	6	1927071	1927076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5058	NC_008319	CAT	3	9	1927078	1927086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_008319	GTG	2	6	1927385	1927390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_008319	GC	3	6	1927401	1927406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5061	NC_008319	GCGG	2	8	1928246	1928253	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5062	NC_008319	GCGG	2	8	1930339	1930346	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5063	NC_008319	CAT	2	6	1930362	1930367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_008319	CTT	2	6	1933057	1933062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_008319	AACGAA	2	12	1933076	1933087	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5066	NC_008319	AAG	2	6	1934734	1934739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_008319	CACC	2	8	1936804	1936811	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5068	NC_008319	GCT	2	6	1936824	1936829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5070	NC_008319	TCA	2	6	1936902	1936907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5073	NC_008319	AAG	2	6	1939415	1939420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_008319	AAC	2	6	1942165	1942170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_008319	ATC	2	6	1942505	1942510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5077	NC_008319	CAG	2	6	1942574	1942579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5079	NC_008319	TGAA	2	8	1942675	1942682	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_008319	G	6	6	1942723	1942728	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5084	NC_008319	GAG	2	6	1948987	1948992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_008319	GGT	2	6	1949006	1949011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_008319	CAA	2	6	1950802	1950807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_008319	C	6	6	1950868	1950873	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5090	NC_008319	CGG	2	6	1957315	1957320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5092	NC_008319	T	7	7	1958122	1958128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_008319	CA	5	10	1958566	1958575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5094	NC_008319	CAAC	2	8	1958750	1958757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5095	NC_008319	CCG	2	6	1958798	1958803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5096	NC_008319	GGT	2	6	1958805	1958810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_008319	CTA	2	6	1958826	1958831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_008319	A	7	7	1958844	1958850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5101	NC_008319	ATTT	2	8	1958985	1958992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_008319	T	6	6	1958990	1958995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_008319	ATT	2	6	1960356	1960361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5105	NC_008319	GTT	2	6	1960543	1960548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5107	NC_008319	TCAA	2	8	1960597	1960604	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5108	NC_008319	CAT	2	6	1960610	1960615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_008319	AC	3	6	1960636	1960641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5110	NC_008319	GAGCTT	2	12	1960686	1960697	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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5112	NC_008319	GTG	2	6	1960780	1960785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_008319	ATT	2	6	1960844	1960849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_008319	TCAA	2	8	1960894	1960901	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5115	NC_008319	TCT	2	6	1960902	1960907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5118	NC_008319	TAT	2	6	1962978	1962983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5122	NC_008319	AGTA	2	8	1963193	1963200	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_008319	GCTCG	2	10	1963320	1963329	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5124	NC_008319	ACC	2	6	1963481	1963486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5127	NC_008319	GGC	2	6	1963569	1963574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_008319	AT	3	6	1963734	1963739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_008319	CAA	2	6	1963778	1963783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5131	NC_008319	CATAG	2	10	1963850	1963859	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5132	NC_008319	AT	3	6	1963928	1963933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_008319	ATC	2	6	1963968	1963973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5256	NC_008319	CCTA	2	8	2014583	2014590	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5259	NC_008319	TACC	2	8	2015131	2015138	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5260	NC_008319	ATGC	2	8	2015144	2015151	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5261	NC_008319	CAA	2	6	2015152	2015157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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