MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 10839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008258	AGC	2	6	65	70	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008258	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008258	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_008258	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_008258	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008258	GAA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008258	AAC	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008258	CGT	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008258	CGC	2	6	5656	5661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_008258	CAT	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008258	GTT	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008258	AGA	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008258	ATC	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008258	TGC	2	6	7077	7082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008258	CGC	2	6	7269	7274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_008258	GCC	2	6	7275	7280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_008258	TTA	2	6	7349	7354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008258	CAG	2	6	7452	7457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008258	AAT	2	6	7473	7478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008258	GGA	2	6	7492	7497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008258	GCA	2	6	7729	7734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008258	CGG	2	6	7766	7771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008258	CAA	2	6	7945	7950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008258	TAA	2	6	8000	8005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008258	AAG	2	6	8084	8089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008258	TGG	2	6	8151	8156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008258	CGG	2	6	8216	8221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008258	CGT	2	6	8236	8241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008258	ATC	2	6	8245	8250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008258	ATC	3	9	10572	10580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008258	AAT	2	6	10594	10599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008258	ATA	2	6	10635	10640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008258	CTG	2	6	11902	11907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008258	AGA	2	6	11914	11919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008258	TTA	2	6	11943	11948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008258	TGA	2	6	12080	12085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008258	TAG	2	6	12105	12110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008258	ATG	2	6	12196	12201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008258	CCG	2	6	15455	15460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_008258	GCC	2	6	15555	15560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_008258	CGG	2	6	15565	15570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008258	ATC	2	6	15597	15602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008258	TGC	2	6	15609	15614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008258	CGC	2	6	15769	15774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_008258	TAT	2	6	15775	15780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008258	ATT	2	6	15867	15872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008258	ATT	2	6	15899	15904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008258	GAC	2	6	15905	15910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008258	ATT	2	6	15918	15923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008258	ACA	2	6	15958	15963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008258	TTC	2	6	16091	16096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008258	ATT	2	6	16116	16121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008258	GAT	2	6	16146	16151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008258	ATT	2	6	18409	18414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008258	AGT	2	6	18500	18505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008258	CAT	2	6	18539	18544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008258	ATG	2	6	18714	18719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008258	AGC	2	6	19773	19778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008258	CTT	2	6	20163	20168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008258	GCA	2	6	20286	20291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008258	TTC	2	6	20302	20307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008258	CTT	2	6	20339	20344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008258	TGA	2	6	21410	21415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008258	AGC	2	6	26217	26222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008258	GAA	2	6	26267	26272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008258	TAT	2	6	28191	28196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008258	TCT	2	6	28312	28317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008258	TGT	2	6	28323	28328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008258	TCT	2	6	28388	28393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008258	TGC	2	6	28394	28399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008258	GAT	2	6	28424	28429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008258	ATA	2	6	28473	28478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008258	GCC	2	6	28528	28533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_008258	TCG	2	6	28547	28552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008258	TCA	2	6	28578	28583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008258	TGA	2	6	33083	33088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008258	TGA	2	6	33140	33145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008258	TGT	2	6	33721	33726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008258	GCG	2	6	38140	38145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008258	ATT	3	9	40988	40996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008258	TTA	2	6	41112	41117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008258	ACC	2	6	41340	41345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_008258	ACG	2	6	41353	41358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008258	TGA	2	6	42228	42233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008258	ATG	2	6	42279	42284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008258	GAT	2	6	42355	42360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008258	GGC	2	6	42454	42459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008258	GCG	2	6	42482	42487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008258	CGG	2	6	42553	42558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008258	GAA	2	6	42572	42577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008258	CAG	2	6	42610	42615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008258	TGG	2	6	42759	42764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008258	GCA	2	6	42786	42791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008258	TTG	2	6	43056	43061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008258	TAA	2	6	46225	46230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008258	GCG	2	6	48677	48682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008258	CAG	2	6	48709	48714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008258	CAT	2	6	48734	48739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008258	CGA	2	6	48752	48757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008258	CAA	2	6	53734	53739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008258	CAT	2	6	56114	56119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008258	GTG	2	6	56204	56209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008258	GCG	2	6	57235	57240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008258	ACC	2	6	60896	60901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_008258	GTG	2	6	60923	60928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008258	AAT	2	6	67685	67690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008258	TAA	2	6	67778	67783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008258	TCT	2	6	67867	67872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008258	CGC	2	6	69718	69723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_008258	AAT	2	6	74864	74869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008258	AGG	2	6	74886	74891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008258	CAT	2	6	75038	75043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008258	CAG	2	6	75076	75081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008258	CTG	2	6	75089	75094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008258	CGC	2	6	75109	75114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_008258	ATG	2	6	75200	75205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008258	GTG	2	6	75545	75550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008258	GCC	2	6	75659	75664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_008258	ATT	2	6	75833	75838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008258	CTA	2	6	75946	75951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008258	GCG	2	6	75970	75975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008258	ATG	2	6	75977	75982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008258	GTG	2	6	75992	75997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008258	TGA	2	6	76050	76055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008258	TTG	2	6	76089	76094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008258	ACC	2	6	76151	76156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_008258	ATT	2	6	76259	76264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008258	TGT	2	6	76267	76272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008258	ATT	2	6	76276	76281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008258	TGA	2	6	76307	76312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008258	AGA	2	6	81168	81173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008258	TAG	4	12	81180	81191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008258	GGT	2	6	81349	81354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008258	TGA	2	6	81484	81489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008258	ATT	2	6	81543	81548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008258	GAT	2	6	81625	81630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008258	CAA	2	6	81667	81672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008258	ATT	2	6	81684	81689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008258	TAT	2	6	82973	82978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008258	GGA	2	6	82998	83003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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