MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 17531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008258	AGC	2	6	1098666	1098671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_008258	GCA	2	6	1098676	1098681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_008258	GTT	2	6	1098712	1098717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_008258	CGG	4	12	1098726	1098737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_008258	GGT	2	6	1098745	1098750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_008258	TCCT	2	8	1098784	1098791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4007	NC_008258	ACA	2	6	1099138	1099143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_008258	TTA	2	6	1099192	1099197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_008258	CAGA	2	8	1099221	1099228	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4010	NC_008258	TGA	2	6	1099237	1099242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_008258	TGACT	2	10	1099991	1100000	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4012	NC_008258	GGT	2	6	1100016	1100021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_008258	GGT	2	6	1100148	1100153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_008258	TGC	2	6	1100162	1100167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_008258	CTC	2	6	1100189	1100194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_008258	AAC	2	6	1100223	1100228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_008258	TCA	2	6	1100237	1100242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_008258	CAT	2	6	1100252	1100257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_008258	T	8	8	1100288	1100295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_008258	GAA	2	6	1100301	1100306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_008258	TTA	2	6	1100317	1100322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_008258	CCAG	2	8	1100339	1100346	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4023	NC_008258	ATT	2	6	1100386	1100391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_008258	TTACTC	2	12	1100399	1100410	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_008258	GTT	2	6	1100569	1100574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_008258	CAA	2	6	1100608	1100613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_008258	TTG	2	6	1100642	1100647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_008258	GA	3	6	1100673	1100678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_008258	CTG	2	6	1100684	1100689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_008258	AAC	2	6	1101080	1101085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_008258	CTG	2	6	1101126	1101131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_008258	AAG	2	6	1101146	1101151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_008258	AGG	2	6	1101157	1101162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_008258	TGC	2	6	1101724	1101729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_008258	GCC	2	6	1101795	1101800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4036	NC_008258	GCA	2	6	1101903	1101908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_008258	TTG	2	6	1101930	1101935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_008258	GAC	2	6	1101939	1101944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_008258	GAC	2	6	1101963	1101968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_008258	GCTT	2	8	1101976	1101983	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4041	NC_008258	AT	3	6	1102052	1102057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_008258	GGA	2	6	1102131	1102136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_008258	T	6	6	1102180	1102185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_008258	GAT	2	6	1102233	1102238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_008258	CAG	2	6	1102278	1102283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_008258	CCT	2	6	1102333	1102338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4047	NC_008258	ATC	2	6	1102399	1102404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_008258	TGA	2	6	1102454	1102459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_008258	GGCAA	2	10	1102476	1102485	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4050	NC_008258	GTC	2	6	1102668	1102673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_008258	CG	3	6	1102685	1102690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_008258	A	6	6	1102698	1102703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_008258	AG	3	6	1102903	1102908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_008258	AAAG	2	8	1103020	1103027	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_008258	A	6	6	1103039	1103044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_008258	CCA	2	6	1103052	1103057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4057	NC_008258	TTG	2	6	1104343	1104348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_008258	CAT	2	6	1104406	1104411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_008258	ATAA	2	8	1104453	1104460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_008258	GATCG	2	10	1104615	1104624	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4061	NC_008258	CA	3	6	1104632	1104637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4062	NC_008258	ATG	2	6	1104678	1104683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_008258	AAC	2	6	1108861	1108866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_008258	CAGT	2	8	1108902	1108909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4065	NC_008258	ACTG	2	8	1108916	1108923	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4066	NC_008258	TCGA	2	8	1108974	1108981	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4067	NC_008258	A	7	7	1109007	1109013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_008258	CAC	2	6	1109014	1109019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4069	NC_008258	TTC	2	6	1109031	1109036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_008258	CGA	2	6	1109067	1109072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_008258	TGAT	2	8	1109089	1109096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_008258	T	6	6	1109115	1109120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_008258	ACC	2	6	1110261	1110266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4074	NC_008258	GGAC	2	8	1110267	1110274	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4075	NC_008258	GTT	2	6	1110286	1110291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_008258	CCAG	2	8	1110295	1110302	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4077	NC_008258	CTG	2	6	1110320	1110325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_008258	ACC	2	6	1110721	1110726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4079	NC_008258	TA	3	6	1112382	1112387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_008258	AAC	2	6	1113144	1113149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_008258	TCTT	2	8	1113206	1113213	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4082	NC_008258	GAT	2	6	1113255	1113260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_008258	CAG	2	6	1113352	1113357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_008258	GAT	2	6	1113830	1113835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_008258	GAA	2	6	1113868	1113873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_008258	ACA	2	6	1113962	1113967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_008258	AAGG	2	8	1113968	1113975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_008258	AAC	2	6	1114103	1114108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_008258	GCA	2	6	1114484	1114489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_008258	AAG	2	6	1114596	1114601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_008258	CAG	2	6	1114690	1114695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_008258	GTG	2	6	1114715	1114720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_008258	TAACGC	2	12	1115337	1115348	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_008258	CAT	2	6	1115490	1115495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_008258	GTA	2	6	1115498	1115503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_008258	GTCC	2	8	1115507	1115514	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4097	NC_008258	GCT	2	6	1115519	1115524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_008258	TAA	2	6	1115631	1115636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_008258	GTC	2	6	1115641	1115646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_008258	AAT	2	6	1115677	1115682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_008258	CCA	2	6	1115727	1115732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_008258	TTA	2	6	1115735	1115740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_008258	TAC	2	6	1115757	1115762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_008258	ACCA	2	8	1117106	1117113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4105	NC_008258	ACCAC	2	10	1117116	1117125	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4106	NC_008258	CATTA	2	10	1117151	1117160	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4107	NC_008258	CAT	2	6	1117202	1117207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_008258	AT	3	6	1117388	1117393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_008258	CTG	2	6	1117819	1117824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_008258	CAT	2	6	1117915	1117920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_008258	GAA	2	6	1117962	1117967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_008258	GTT	2	6	1118027	1118032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_008258	CCA	2	6	1118882	1118887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4114	NC_008258	TAG	2	6	1118895	1118900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_008258	TCCT	2	8	1118945	1118952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4116	NC_008258	ACA	2	6	1119299	1119304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_008258	TTA	2	6	1119353	1119358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_008258	CAGA	2	8	1119382	1119389	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4119	NC_008258	TGA	2	6	1119398	1119403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_008258	ATG	2	6	1121111	1121116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_008258	GCT	2	6	1121188	1121193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_008258	AAG	2	6	1121208	1121213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_008258	GGC	2	6	1121231	1121236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_008258	CGA	2	6	1121263	1121268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_008258	GTTTC	2	10	1121273	1121282	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4126	NC_008258	AAG	2	6	1121355	1121360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_008258	AC	3	6	1121370	1121375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4128	NC_008258	AG	3	6	1121410	1121415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_008258	AAT	2	6	1122524	1122529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_008258	TG	3	6	1122556	1122561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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