MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 17531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008258	TGCGC	2	10	819642	819651	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3002	NC_008258	CG	3	6	819710	819715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_008258	CAC	2	6	819770	819775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_008258	GTG	2	6	819796	819801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_008258	A	6	6	819822	819827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_008258	GGTT	2	8	821304	821311	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_008258	GTA	2	6	821360	821365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_008258	TTG	2	6	821401	821406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_008258	CGG	2	6	821472	821477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_008258	GATGC	2	10	821636	821645	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3011	NC_008258	ATA	2	6	821680	821685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_008258	ATTT	2	8	821748	821755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_008258	T	8	8	821775	821782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_008258	TGG	2	6	821831	821836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_008258	ATG	2	6	822257	822262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_008258	CGG	2	6	825263	825268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_008258	T	7	7	825386	825392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_008258	CGTTGT	2	12	825433	825444	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3019	NC_008258	CAG	2	6	825487	825492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_008258	AGA	2	6	825495	825500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_008258	CTC	2	6	825525	825530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_008258	GGA	2	6	825626	825631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_008258	T	6	6	825667	825672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_008258	GCG	2	6	825680	825685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_008258	TAA	2	6	825722	825727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_008258	TGT	2	6	827163	827168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_008258	GTG	2	6	827179	827184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_008258	AAT	2	6	827187	827192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_008258	TAAT	2	8	827204	827211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_008258	T	6	6	828056	828061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_008258	AT	3	6	828096	828101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_008258	A	6	6	828103	828108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_008258	ATT	2	6	828245	828250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_008258	TGA	2	6	828263	828268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_008258	A	6	6	828268	828273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_008258	TG	3	6	828292	828297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_008258	ATG	2	6	828298	828303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_008258	A	6	6	828311	828316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_008258	GATG	2	8	828342	828349	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_008258	CAAAA	2	10	828378	828387	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3041	NC_008258	CCT	2	6	828391	828396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3042	NC_008258	TAA	2	6	829080	829085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_008258	AT	3	6	829102	829107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_008258	TTAT	2	8	829123	829130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_008258	AATA	2	8	829152	829159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_008258	AT	3	6	829177	829182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_008258	A	6	6	830219	830224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_008258	AAT	2	6	830286	830291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_008258	ATGA	2	8	830296	830303	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_008258	AT	3	6	830446	830451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_008258	GGT	2	6	830485	830490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_008258	AAG	2	6	832758	832763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_008258	GCC	2	6	832773	832778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3054	NC_008258	ACT	2	6	832789	832794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_008258	T	7	7	832843	832849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_008258	GCG	2	6	832891	832896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_008258	CGC	2	6	832905	832910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3058	NC_008258	TGC	2	6	832932	832937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_008258	TGT	2	6	832942	832947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_008258	AG	3	6	832967	832972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_008258	TCAT	2	8	833031	833038	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3062	NC_008258	CCT	2	6	833043	833048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3063	NC_008258	GAT	2	6	833077	833082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_008258	TACA	2	8	833088	833095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3065	NC_008258	TATAT	2	10	833110	833119	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_008258	T	6	6	833140	833145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_008258	TATG	2	8	833193	833200	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_008258	A	6	6	834819	834824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_008258	T	6	6	835898	835903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_008258	GAG	2	6	835932	835937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_008258	TCT	2	6	835943	835948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_008258	GAC	2	6	837628	837633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_008258	TGA	2	6	837637	837642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_008258	AT	3	6	837697	837702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_008258	CGC	2	6	837741	837746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_008258	ACC	2	6	839103	839108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3077	NC_008258	TGATG	2	10	839191	839200	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_008258	AAG	2	6	839214	839219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_008258	AG	3	6	839246	839251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_008258	TAA	2	6	840107	840112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_008258	TGA	2	6	840164	840169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_008258	CGC	2	6	840192	840197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3083	NC_008258	CT	3	6	843558	843563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3084	NC_008258	AG	3	6	843625	843630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_008258	TGA	2	6	844373	844378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_008258	TGCC	2	8	844397	844404	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3087	NC_008258	CGC	2	6	844451	844456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3088	NC_008258	TAT	2	6	846543	846548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_008258	TGG	2	6	846737	846742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_008258	CG	3	6	846760	846765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3091	NC_008258	GTAC	2	8	852106	852113	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3092	NC_008258	CGA	2	6	852133	852138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_008258	CCG	2	6	852164	852169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3094	NC_008258	ATT	2	6	852171	852176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_008258	TTATT	2	10	852179	852188	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_008258	TGG	2	6	852194	852199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_008258	ATT	2	6	852239	852244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_008258	CTT	2	6	852272	852277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_008258	GCA	2	6	852279	852284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_008258	TGGT	2	8	852332	852339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_008258	GGC	2	6	852354	852359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_008258	TTG	2	6	852409	852414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_008258	TGG	2	6	852433	852438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_008258	TGT	2	6	852504	852509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_008258	T	6	6	852557	852562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_008258	CCTG	2	8	852681	852688	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3107	NC_008258	TCT	2	6	852697	852702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_008258	GTG	2	6	852707	852712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_008258	T	6	6	852713	852718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_008258	GCC	2	6	852750	852755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3111	NC_008258	GCC	2	6	852785	852790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3112	NC_008258	CGC	2	6	852844	852849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3113	NC_008258	TTG	2	6	852903	852908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_008258	ATT	2	6	852997	853002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_008258	CTG	2	6	853027	853032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_008258	ATT	2	6	856818	856823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3118	NC_008258	CAGGG	2	10	858219	858228	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3119	NC_008258	GAA	2	6	858315	858320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_008258	A	6	6	858345	858350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_008258	CAA	2	6	858370	858375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_008258	AGG	2	6	858386	858391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_008258	TCC	2	6	858849	858854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_008258	TCTT	2	8	858932	858939	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3125	NC_008258	CT	3	6	858943	858948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3126	NC_008258	GGC	2	6	858950	858955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_008258	GCG	3	9	859054	859062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_008258	CTG	2	6	859146	859151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3130	NC_008258	GAT	2	6	859218	859223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_008258	CTG	2	6	859237	859242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_008258	TGA	2	6	859262	859267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_008258	TC	3	6	859268	859273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3134	NC_008258	GGCG	2	8	859338	859345	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3135	NC_008258	GACC	2	8	859451	859458	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3137	NC_008258	GC	4	8	859503	859510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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