MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 17531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008258	ATT	2	6	478990	478995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_008258	GGCGT	2	10	479003	479012	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1503	NC_008258	ATC	2	6	479106	479111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_008258	GGC	2	6	479152	479157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_008258	A	6	6	479160	479165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_008258	TGG	2	6	479169	479174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_008258	TGC	2	6	479214	479219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_008258	TGG	2	6	479301	479306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_008258	CAG	2	6	479365	479370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_008258	GAAGC	2	10	479566	479575	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1511	NC_008258	ACAG	2	8	479595	479602	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_008258	ATT	2	6	479614	479619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_008258	CG	3	6	479695	479700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_008258	CTGC	2	8	479701	479708	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_008258	GAT	2	6	479721	479726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_008258	GGT	2	6	479731	479736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_008258	GGC	2	6	479760	479765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_008258	A	6	6	479773	479778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_008258	CAA	2	6	479818	479823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_008258	GAA	3	9	479940	479948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_008258	AGCG	2	8	479971	479978	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1522	NC_008258	GTC	2	6	480089	480094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_008258	TGA	2	6	480191	480196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_008258	TGG	2	6	480278	480283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_008258	TGAT	2	8	480311	480318	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_008258	CCG	2	6	480326	480331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1527	NC_008258	CGG	2	6	480486	480491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_008258	CGC	2	6	480584	480589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_008258	AGGTG	2	10	480615	480624	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_008258	A	7	7	481174	481180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_008258	AAGC	2	8	481183	481190	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1532	NC_008258	A	8	8	481210	481217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_008258	ATA	3	9	481297	481305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_008258	A	7	7	481305	481311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_008258	GC	3	6	482180	482185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1536	NC_008258	CGC	2	6	482673	482678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_008258	CGC	2	6	482774	482779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_008258	AGC	2	6	482820	482825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_008258	TAA	2	6	485424	485429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_008258	A	6	6	485458	485463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_008258	ATTT	2	8	485491	485498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_008258	CT	3	6	487841	487846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_008258	TAT	2	6	487864	487869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_008258	TGG	2	6	487872	487877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_008258	A	7	7	487898	487904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_008258	AGG	2	6	487943	487948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_008258	CCT	2	6	489750	489755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_008258	TGC	2	6	489782	489787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_008258	AG	3	6	489819	489824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_008258	GCA	2	6	491346	491351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_008258	AAC	2	6	491381	491386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_008258	GC	4	8	492294	492301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_008258	A	6	6	493236	493241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_008258	GCA	2	6	493244	493249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_008258	GCAG	2	8	493324	493331	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1556	NC_008258	GGC	2	6	493362	493367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_008258	CAT	2	6	493433	493438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_008258	GC	3	6	493496	493501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_008258	TTG	2	6	493508	493513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_008258	CGC	2	6	493522	493527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_008258	CAA	2	6	493574	493579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_008258	CAGGC	2	10	493582	493591	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1563	NC_008258	GCA	2	6	493659	493664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_008258	CAGGAA	2	12	493682	493693	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1565	NC_008258	AT	3	6	496771	496776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_008258	CGC	2	6	496815	496820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_008258	AATA	2	8	496849	496856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_008258	T	7	7	496878	496884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_008258	AGG	2	6	496894	496899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_008258	CAG	2	6	496958	496963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_008258	TTC	2	6	497079	497084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_008258	TC	4	8	497104	497111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_008258	CAC	2	6	497134	497139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_008258	ACT	2	6	497203	497208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_008258	ACC	2	6	497307	497312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_008258	A	6	6	497326	497331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_008258	A	7	7	497333	497339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_008258	T	6	6	497356	497361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_008258	GC	3	6	498547	498552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1580	NC_008258	TGT	2	6	499651	499656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_008258	CGG	2	6	499704	499709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_008258	ATG	2	6	502994	502999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_008258	GAA	2	6	503123	503128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_008258	TAA	2	6	503149	503154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_008258	GCG	2	6	503195	503200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_008258	GAA	2	6	503234	503239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_008258	AGC	3	9	503257	503265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_008258	CAC	2	6	503933	503938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1589	NC_008258	AGGA	2	8	503956	503963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_008258	ATGGAA	2	12	503970	503981	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_008258	CAT	2	6	504006	504011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_008258	TGA	2	6	507470	507475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_008258	CGC	2	6	507575	507580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_008258	AG	3	6	509243	509248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_008258	AT	3	6	510564	510569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_008258	GTG	2	6	510573	510578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_008258	ATC	2	6	510602	510607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_008258	CG	3	6	510626	510631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1599	NC_008258	TAT	2	6	510643	510648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_008258	CA	3	6	510665	510670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_008258	CTG	2	6	513767	513772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_008258	AAT	2	6	513791	513796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_008258	TGC	2	6	513800	513805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_008258	AG	4	8	513810	513817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_008258	GC	3	6	513872	513877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_008258	GTTTC	2	10	513884	513893	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1607	NC_008258	ATG	2	6	513979	513984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_008258	ATTT	2	8	514005	514012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_008258	AT	3	6	514110	514115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_008258	CT	3	6	514144	514149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_008258	T	6	6	514151	514156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_008258	TAC	2	6	514211	514216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_008258	TAAA	2	8	514228	514235	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_008258	TA	3	6	514245	514250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_008258	GTT	2	6	514824	514829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_008258	TA	3	6	514836	514841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_008258	TGG	2	6	514886	514891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_008258	TTA	2	6	514933	514938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_008258	ATG	2	6	514951	514956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_008258	TGT	2	6	514957	514962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_008258	AAG	2	6	514963	514968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_008258	ATG	2	6	515033	515038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_008258	TTAT	2	8	515051	515058	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_008258	CAG	2	6	515142	515147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_008258	AAAAG	2	10	515154	515163	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_008258	TCAT	2	8	515164	515171	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1627	NC_008258	TAT	2	6	515223	515228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_008258	GGC	2	6	515247	515252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_008258	ATT	2	6	515361	515366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_008258	CAATT	2	10	515375	515384	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1631	NC_008258	AC	3	6	515411	515416	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1632	NC_008258	GGC	2	6	515523	515528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_008258	AGTT	2	8	515535	515542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_008258	ATC	2	6	515648	515653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1636	NC_008258	CCT	2	6	515759	515764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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