MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 17531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008258	TAT	2	6	332624	332629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_008258	TTG	2	6	332735	332740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_008258	AACC	2	8	332745	332752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_008258	ATT	2	6	332776	332781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_008258	T	6	6	332814	332819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_008258	CTG	2	6	332871	332876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_008258	AT	3	6	332886	332891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_008258	TAT	2	6	332942	332947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_008258	TAC	2	6	332953	332958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_008258	TAA	2	6	333006	333011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008258	TCC	2	6	333017	333022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_008258	T	6	6	333062	333067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_008258	GA	3	6	333638	333643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_008258	T	7	7	333879	333885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_008258	TCG	2	6	333987	333992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_008258	GAAA	2	8	334020	334027	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_008258	GGT	2	6	334089	334094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_008258	A	6	6	334111	334116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_008258	TGA	2	6	334132	334137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_008258	G	7	7	334151	334157	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_008258	TTCCC	2	10	337227	337236	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1022	NC_008258	CT	3	6	337267	337272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_008258	AAAAT	2	10	337969	337978	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_008258	TGT	2	6	337992	337997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_008258	A	6	6	338039	338044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_008258	CAT	2	6	338049	338054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_008258	TA	3	6	338094	338099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_008258	CCT	2	6	339847	339852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_008258	TCA	2	6	341943	341948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_008258	GTT	2	6	341951	341956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_008258	ATTG	2	8	341974	341981	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_008258	A	6	6	342037	342042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_008258	A	6	6	344150	344155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_008258	AT	3	6	344162	344167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_008258	TA	3	6	344168	344173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_008258	TGTCA	2	10	344178	344187	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1037	NC_008258	CAT	2	6	345022	345027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_008258	TTTA	2	8	345069	345076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_008258	TGC	2	6	345094	345099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_008258	T	7	7	345106	345112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_008258	ACG	2	6	347212	347217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_008258	GAT	2	6	347258	347263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_008258	T	6	6	347306	347311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_008258	ACC	2	6	347386	347391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_008258	TGCT	2	8	347405	347412	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_008258	ATC	2	6	347415	347420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_008258	TCT	2	6	347445	347450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_008258	CG	3	6	347487	347492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_008258	TAAA	2	8	347515	347522	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_008258	T	7	7	347556	347562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_008258	TATTT	2	10	347564	347573	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_008258	TAGA	2	8	347603	347610	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_008258	CTTAT	2	10	347691	347700	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1054	NC_008258	AAG	2	6	347716	347721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_008258	TGC	2	6	347722	347727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_008258	CCA	2	6	347873	347878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_008258	A	6	6	347886	347891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_008258	A	6	6	347895	347900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_008258	A	6	6	347904	347909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_008258	TGT	2	6	347949	347954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_008258	CGA	2	6	348109	348114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_008258	AG	3	6	348122	348127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_008258	TC	3	6	348154	348159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_008258	AG	3	6	348160	348165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_008258	GC	3	6	348280	348285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_008258	TATCGA	2	12	348301	348312	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1067	NC_008258	T	7	7	348389	348395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_008258	AC	3	6	348437	348442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_008258	ACA	2	6	348542	348547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_008258	AG	3	6	348558	348563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_008258	AGG	2	6	349382	349387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_008258	A	7	7	351931	351937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_008258	AAG	2	6	352999	353004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_008258	AG	3	6	353013	353018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_008258	AAT	2	6	353047	353052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_008258	TTTA	2	8	353081	353088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_008258	TTA	2	6	353099	353104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_008258	T	9	9	353105	353113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_008258	TGC	2	6	353126	353131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_008258	AAT	2	6	353141	353146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_008258	TGT	2	6	353155	353160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_008258	TA	3	6	353291	353296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_008258	AAT	2	6	353323	353328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_008258	GCA	2	6	353348	353353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_008258	ATA	2	6	353372	353377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_008258	TTA	2	6	353411	353416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_008258	GAG	2	6	353424	353429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_008258	GTA	2	6	353463	353468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_008258	ACG	2	6	353569	353574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_008258	TGA	2	6	353585	353590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_008258	ATG	2	6	353599	353604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_008258	AAC	2	6	353619	353624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_008258	TAA	2	6	353669	353674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_008258	CTAC	2	8	353698	353705	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_008258	GAC	2	6	353712	353717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_008258	TACCAA	2	12	353726	353737	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1098	NC_008258	TAA	2	6	355027	355032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_008258	CCG	2	6	355060	355065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_008258	CGA	2	6	355093	355098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_008258	A	7	7	355111	355117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_008258	CAA	2	6	356059	356064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_008258	GCA	2	6	356193	356198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_008258	TGA	2	6	356221	356226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_008258	ACG	2	6	356367	356372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_008258	AAC	2	6	356378	356383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_008258	GGT	3	9	356507	356515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_008258	TTC	2	6	356569	356574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_008258	GAA	2	6	356580	356585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_008258	GGT	2	6	358317	358322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_008258	TGAA	2	8	358333	358340	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_008258	TAC	2	6	358359	358364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_008258	AAT	2	6	358397	358402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_008258	CAG	2	6	358627	358632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_008258	AAG	2	6	358646	358651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_008258	CTTCT	2	10	361384	361393	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1117	NC_008258	ACC	2	6	362916	362921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_008258	TTG	2	6	363029	363034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_008258	TCT	2	6	363038	363043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_008258	GAA	2	6	363070	363075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_008258	ATG	2	6	363113	363118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_008258	T	7	7	363164	363170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_008258	AT	3	6	363197	363202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_008258	TAA	2	6	363220	363225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_008258	TG	3	6	363252	363257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_008258	ATT	2	6	363262	363267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_008258	CAAA	2	8	363296	363303	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1128	NC_008258	A	6	6	363301	363306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_008258	ATA	2	6	363339	363344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_008258	T	6	6	363742	363747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_008258	T	7	7	365227	365233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_008258	TAT	2	6	369572	369577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_008258	T	6	6	369646	369651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_008258	GAA	2	6	370312	370317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_008258	TAA	2	6	370591	370596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1401	NC_008258	CTT	2	6	454901	454906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1402	NC_008258	A	6	6	454940	454945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1403	NC_008258	ATT	2	6	455016	455021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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