MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 17531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008258	CCG	2	6	203834	203839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_008258	TGG	2	6	203856	203861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_008258	CGG	2	6	203932	203937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_008258	GCGT	2	8	204004	204011	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
505	NC_008258	TGC	2	6	204028	204033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_008258	CGG	2	6	204050	204055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_008258	GAA	2	6	204065	204070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_008258	GCC	2	6	204092	204097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_008258	CTG	2	6	204120	204125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_008258	GCG	2	6	204147	204152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_008258	AAG	2	6	204172	204177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_008258	CCT	2	6	204734	204739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_008258	CCT	2	6	204869	204874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_008258	AAAC	2	8	206599	206606	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
515	NC_008258	TGCGC	2	10	206621	206630	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
516	NC_008258	CGC	2	6	206701	206706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_008258	GGCT	2	8	206727	206734	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
518	NC_008258	A	6	6	207579	207584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_008258	A	7	7	209386	209392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008258	CTT	2	6	211495	211500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_008258	ATT	2	6	211503	211508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_008258	TGT	2	6	211511	211516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_008258	ATT	2	6	213205	213210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_008258	TAT	2	6	213211	213216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_008258	ATCA	2	8	213303	213310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
526	NC_008258	TTA	2	6	213370	213375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_008258	CGG	2	6	214049	214054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_008258	CA	3	6	214068	214073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
529	NC_008258	CGGTT	2	10	214080	214089	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
530	NC_008258	A	6	6	214096	214101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_008258	TG	3	6	214212	214217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
532	NC_008258	GGC	2	6	214366	214371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_008258	ACT	2	6	214480	214485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_008258	TAG	2	6	214577	214582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_008258	CGA	2	6	214605	214610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_008258	GCA	2	6	214679	214684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_008258	GAA	2	6	214738	214743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_008258	GGA	2	6	214774	214779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_008258	AGA	2	6	214821	214826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_008258	CAG	2	6	214847	214852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_008258	G	6	6	214994	214999	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
542	NC_008258	GGA	2	6	215038	215043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_008258	GGC	2	6	215058	215063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_008258	GAA	2	6	215301	215306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_008258	TGC	2	6	215377	215382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_008258	GTC	2	6	215389	215394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_008258	TTG	2	6	215450	215455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_008258	CCGG	2	8	215464	215471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_008258	GGA	2	6	215502	215507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_008258	TCA	2	6	215527	215532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_008258	AC	3	6	215553	215558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_008258	CGT	2	6	215621	215626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_008258	AC	3	6	215722	215727	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_008258	GTAG	2	8	215763	215770	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_008258	CCT	2	6	215863	215868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_008258	AAG	2	6	215876	215881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_008258	CA	3	6	215898	215903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
558	NC_008258	CGG	2	6	215994	215999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_008258	AAC	2	6	216147	216152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_008258	GTT	2	6	216157	216162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_008258	TC	3	6	216169	216174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_008258	GAT	2	6	216190	216195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_008258	GAAA	2	8	216201	216208	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
564	NC_008258	GCG	2	6	216469	216474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_008258	AGC	2	6	216486	216491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_008258	GT	5	10	216507	216516	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_008258	G	6	6	216630	216635	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
568	NC_008258	TCC	2	6	216640	216645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_008258	CTGA	2	8	216660	216667	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
570	NC_008258	GTAC	2	8	216744	216751	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
571	NC_008258	GGA	2	6	216949	216954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_008258	AC	3	6	217167	217172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
573	NC_008258	AAC	2	6	217204	217209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_008258	AGC	2	6	217294	217299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_008258	CAT	2	6	217300	217305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_008258	AAAG	2	8	217308	217315	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
577	NC_008258	GTT	2	6	217403	217408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_008258	G	6	6	217645	217650	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
579	NC_008258	TGA	2	6	217744	217749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_008258	CAA	2	6	217771	217776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_008258	GGT	2	6	217843	217848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_008258	GA	3	6	217873	217878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
583	NC_008258	GCTG	2	8	217987	217994	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
584	NC_008258	TTA	2	6	218002	218007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_008258	CGG	2	6	218126	218131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_008258	ATG	2	6	218202	218207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_008258	ACC	2	6	218397	218402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_008258	TGG	2	6	218457	218462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_008258	TCC	2	6	218483	218488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_008258	GGA	2	6	218500	218505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_008258	AGG	2	6	218538	218543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_008258	GGT	2	6	218620	218625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_008258	CGG	2	6	218707	218712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_008258	TCA	2	6	218735	218740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_008258	CGT	2	6	218815	218820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_008258	G	6	6	218864	218869	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
597	NC_008258	GAC	3	9	219046	219054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_008258	GT	3	6	219068	219073	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_008258	GA	3	6	219156	219161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_008258	GGC	2	6	219227	219232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_008258	GGT	2	6	219241	219246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_008258	GGT	2	6	219372	219377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_008258	CCTG	2	8	219421	219428	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
604	NC_008258	CCGT	2	8	219456	219463	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
605	NC_008258	TTA	2	6	219472	219477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_008258	TAT	2	6	219523	219528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_008258	CT	3	6	220439	220444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_008258	CTC	2	6	220450	220455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_008258	ATTT	2	8	222822	222829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_008258	AAT	2	6	222879	222884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_008258	ACA	2	6	223885	223890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_008258	A	6	6	224677	224682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_008258	TAT	2	6	224708	224713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_008258	GAC	2	6	226105	226110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_008258	GCA	2	6	228967	228972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_008258	CCTG	2	8	229083	229090	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
617	NC_008258	CCGT	2	8	229118	229125	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
618	NC_008258	TCG	2	6	229170	229175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_008258	A	6	6	229225	229230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_008258	CAGC	2	8	230965	230972	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
621	NC_008258	TGA	2	6	230975	230980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_008258	GGCG	2	8	231402	231409	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
623	NC_008258	CTT	2	6	231462	231467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_008258	ACGCC	2	10	231491	231500	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
625	NC_008258	AGT	2	6	231509	231514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_008258	CGG	2	6	231530	231535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_008258	CAG	2	6	231616	231621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_008258	GCC	2	6	231637	231642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_008258	GCCAT	2	10	231702	231711	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
630	NC_008258	CAGC	2	8	231720	231727	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
631	NC_008258	GCG	2	6	231735	231740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_008258	GGCG	2	8	231746	231753	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
633	NC_008258	CGCC	2	8	231765	231772	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
634	NC_008258	GTGATG	2	12	231857	231868	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_008258	CGG	2	6	231959	231964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_008258	GCG	2	6	231979	231984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_008258	TCA	2	6	232025	232030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_008258	GTG	2	6	232073	232078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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