MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 17531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008258	GGT	2	6	1479480	1479485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_008258	GGA	2	6	1479496	1479501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_008258	CA	3	6	1480299	1480304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5504	NC_008258	A	8	8	1481234	1481241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_008258	CCA	2	6	1482287	1482292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5506	NC_008258	AATC	2	8	1482379	1482386	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5507	NC_008258	GACT	2	8	1482406	1482413	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5508	NC_008258	TCA	2	6	1482497	1482502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_008258	TCG	2	6	1482522	1482527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_008258	ACA	2	6	1482543	1482548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_008258	CAA	2	6	1483393	1483398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_008258	CGACC	2	10	1483426	1483435	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5513	NC_008258	CCA	2	6	1483560	1483565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5514	NC_008258	TGT	2	6	1483634	1483639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_008258	ATG	2	6	1483679	1483684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_008258	CAAAA	2	10	1483695	1483704	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5517	NC_008258	TTC	2	6	1486077	1486082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_008258	CCA	2	6	1486119	1486124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5519	NC_008258	AATA	2	8	1486181	1486188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_008258	ATT	2	6	1486251	1486256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_008258	CAG	2	6	1486258	1486263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_008258	AGA	2	6	1486280	1486285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_008258	TTAC	2	8	1486609	1486616	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5524	NC_008258	TGG	2	6	1486654	1486659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_008258	ATGC	2	8	1486677	1486684	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5526	NC_008258	AAG	2	6	1486713	1486718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_008258	ATT	2	6	1486722	1486727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_008258	TGA	2	6	1486750	1486755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_008258	CGT	2	6	1486796	1486801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_008258	TTA	2	6	1486855	1486860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_008258	GCG	2	6	1486986	1486991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_008258	TTG	2	6	1487004	1487009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_008258	CAAT	2	8	1487031	1487038	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5534	NC_008258	AATC	2	8	1487047	1487054	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5535	NC_008258	TTC	2	6	1487119	1487124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_008258	ACA	2	6	1487179	1487184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_008258	AAC	2	6	1487204	1487209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_008258	ATT	2	6	1487219	1487224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_008258	TTA	2	6	1487232	1487237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_008258	ATTA	2	8	1487247	1487254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_008258	TGA	2	6	1490089	1490094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_008258	GGC	2	6	1490189	1490194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_008258	ATT	2	6	1490966	1490971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_008258	ATG	2	6	1490994	1490999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_008258	TAA	2	6	1491139	1491144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_008258	TTA	2	6	1491156	1491161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_008258	GTC	2	6	1491189	1491194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_008258	ATGG	2	8	1491214	1491221	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_008258	AAT	2	6	1491225	1491230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_008258	GCC	2	6	1491240	1491245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5551	NC_008258	TGG	2	6	1491290	1491295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_008258	ACT	2	6	1491307	1491312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_008258	GCG	2	6	1491317	1491322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_008258	TCT	2	6	1491341	1491346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_008258	TCG	2	6	1491349	1491354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_008258	TGC	2	6	1491359	1491364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_008258	TTTC	2	8	1491404	1491411	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5558	NC_008258	CG	3	6	1491506	1491511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5559	NC_008258	TTG	2	6	1491520	1491525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_008258	GCG	2	6	1491549	1491554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_008258	GTG	2	6	1491561	1491566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_008258	T	7	7	1491575	1491581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_008258	AAT	2	6	1491590	1491595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_008258	TCT	2	6	1491599	1491604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_008258	GGT	2	6	1491606	1491611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_008258	TC	3	6	1491635	1491640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5567	NC_008258	AGC	2	6	1491724	1491729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_008258	ACG	2	6	1492619	1492624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_008258	TTA	2	6	1492750	1492755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_008258	ATTA	2	8	1492790	1492797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_008258	TCG	2	6	1492811	1492816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_008258	ATT	2	6	1492817	1492822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_008258	CTTA	2	8	1492832	1492839	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5574	NC_008258	TTA	3	9	1492837	1492845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_008258	TGA	2	6	1492912	1492917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5577	NC_008258	ATGT	2	8	1492932	1492939	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_008258	CGG	2	6	1492951	1492956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_008258	CGGA	2	8	1493021	1493028	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5580	NC_008258	TCG	2	6	1493029	1493034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_008258	ATT	2	6	1493063	1493068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_008258	TC	3	6	1493135	1493140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5583	NC_008258	CCCG	2	8	1494921	1494928	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5584	NC_008258	TGATAT	2	12	1494959	1494970	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_008258	TA	3	6	1494994	1494999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_008258	AGG	2	6	1495008	1495013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_008258	TCG	2	6	1495071	1495076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_008258	A	6	6	1495081	1495086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_008258	CGA	2	6	1495096	1495101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_008258	CAG	2	6	1497060	1497065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_008258	AATA	2	8	1497115	1497122	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_008258	T	8	8	1500892	1500899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_008258	TAA	2	6	1500931	1500936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_008258	ATG	2	6	1501655	1501660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_008258	TTCCAT	2	12	1501685	1501696	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_008258	TCCT	2	8	1501703	1501710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5597	NC_008258	GTG	2	6	1501728	1501733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_008258	TAA	2	6	1502405	1502410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_008258	GCG	2	6	1502445	1502450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_008258	GAT	2	6	1502462	1502467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_008258	GAA	3	9	1502505	1502513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_008258	CTGGC	2	10	1502514	1502523	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5603	NC_008258	TA	3	6	1502526	1502531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_008258	TGCT	2	8	1502533	1502540	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5605	NC_008258	GTT	2	6	1502558	1502563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_008258	GAA	2	6	1502571	1502576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_008258	A	7	7	1502584	1502590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_008258	CTG	2	6	1502621	1502626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_008258	CAT	2	6	1502743	1502748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_008258	GCGCT	2	10	1502787	1502796	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5611	NC_008258	TA	3	6	1504240	1504245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_008258	TGT	2	6	1504264	1504269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_008258	A	7	7	1504329	1504335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_008258	TAA	2	6	1504354	1504359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_008258	AC	3	6	1505112	1505117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5616	NC_008258	ATA	2	6	1505140	1505145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_008258	T	6	6	1505802	1505807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_008258	GCT	2	6	1505813	1505818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_008258	GCC	2	6	1505831	1505836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5620	NC_008258	TTC	2	6	1505853	1505858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_008258	GCGT	2	8	1505870	1505877	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5622	NC_008258	CG	3	6	1505894	1505899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5623	NC_008258	ATC	2	6	1505972	1505977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_008258	ACGA	2	8	1506121	1506128	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5625	NC_008258	GCA	2	6	1506157	1506162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_008258	GCC	2	6	1506296	1506301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5627	NC_008258	CAG	2	6	1506305	1506310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_008258	GTG	2	6	1506393	1506398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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