MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 17531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008258	GGCGC	2	10	1365955	1365964	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5002	NC_008258	CAGG	2	8	1365973	1365980	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5003	NC_008258	TGC	2	6	1367393	1367398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_008258	TAA	2	6	1367409	1367414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_008258	CAGT	2	8	1367479	1367486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5006	NC_008258	AGG	2	6	1367490	1367495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_008258	CCTC	2	8	1367509	1367516	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5008	NC_008258	ATC	2	6	1367533	1367538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_008258	CAT	2	6	1367541	1367546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_008258	GCC	2	6	1367590	1367595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_008258	AAC	2	6	1367673	1367678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_008258	TTC	2	6	1369113	1369118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_008258	GTTT	2	8	1369126	1369133	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_008258	CAT	2	6	1369167	1369172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_008258	A	6	6	1369249	1369254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_008258	CAT	2	6	1369423	1369428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_008258	GGC	2	6	1369436	1369441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_008258	TGA	2	6	1370119	1370124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_008258	GCA	3	9	1370160	1370168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_008258	CGT	2	6	1370182	1370187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_008258	GCC	2	6	1370188	1370193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5022	NC_008258	GCT	2	6	1370274	1370279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_008258	AT	3	6	1370788	1370793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_008258	AAT	2	6	1374904	1374909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_008258	TGCGC	2	10	1374916	1374925	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5026	NC_008258	ACG	2	6	1374941	1374946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_008258	TATG	2	8	1374954	1374961	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_008258	CGC	2	6	1374978	1374983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_008258	TTC	2	6	1376049	1376054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_008258	A	6	6	1376082	1376087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_008258	CAG	2	6	1376114	1376119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_008258	ACA	2	6	1376148	1376153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_008258	GGC	2	6	1376834	1376839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_008258	CGC	3	9	1376849	1376857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5035	NC_008258	GCG	2	6	1378097	1378102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_008258	T	8	8	1378114	1378121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_008258	ATT	2	6	1378150	1378155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_008258	A	6	6	1378189	1378194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_008258	AGT	2	6	1378250	1378255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_008258	ATTA	2	8	1378394	1378401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_008258	A	6	6	1378413	1378418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_008258	T	6	6	1378531	1378536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_008258	TTA	2	6	1378548	1378553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_008258	TGA	2	6	1378574	1378579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_008258	ATC	2	6	1378600	1378605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_008258	ACA	2	6	1378727	1378732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_008258	GAT	2	6	1378836	1378841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_008258	ACC	2	6	1378863	1378868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_008258	TGG	2	6	1378924	1378929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_008258	CATC	2	8	1379018	1379025	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5051	NC_008258	A	6	6	1379029	1379034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_008258	ATT	2	6	1379064	1379069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_008258	ACA	2	6	1379125	1379130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_008258	TGA	2	6	1379150	1379155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_008258	GCC	2	6	1379186	1379191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5056	NC_008258	GCTT	2	8	1379332	1379339	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5057	NC_008258	CAG	2	6	1379376	1379381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_008258	TAG	2	6	1379392	1379397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_008258	TGC	2	6	1379402	1379407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_008258	ATG	2	6	1379427	1379432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_008258	TTCCAT	2	12	1379457	1379468	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_008258	TCCT	2	8	1379475	1379482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_008258	GTG	2	6	1379500	1379505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_008258	AAT	2	6	1380182	1380187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_008258	GCC	2	6	1380243	1380248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_008258	GAA	2	6	1380263	1380268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_008258	TA	3	6	1380331	1380336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_008258	A	6	6	1380411	1380416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_008258	TCG	2	6	1380506	1380511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_008258	ATA	2	6	1380535	1380540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_008258	AAG	2	6	1380584	1380589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_008258	AT	3	6	1380694	1380699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_008258	TAAA	2	8	1380743	1380750	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_008258	AGA	2	6	1380828	1380833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_008258	TTC	2	6	1380867	1380872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_008258	ATTG	2	8	1380906	1380913	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_008258	GAA	2	6	1380964	1380969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_008258	TCA	2	6	1380989	1380994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5080	NC_008258	ATCG	2	8	1381075	1381082	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5081	NC_008258	TCA	2	6	1381100	1381105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_008258	GGC	2	6	1381204	1381209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_008258	GGA	2	6	1381248	1381253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_008258	GCT	2	6	1381272	1381277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_008258	A	6	6	1381312	1381317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_008258	GAT	2	6	1381440	1381445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_008258	TGC	2	6	1381473	1381478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_008258	CAT	2	6	1381503	1381508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_008258	AAG	2	6	1381586	1381591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_008258	GTG	2	6	1381615	1381620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_008258	CCG	2	6	1381673	1381678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_008258	AGC	2	6	1381692	1381697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_008258	ACA	2	6	1381730	1381735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_008258	TGA	2	6	1381748	1381753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_008258	TGC	2	6	1381764	1381769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_008258	ACG	2	6	1381817	1381822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_008258	TTA	2	6	1381823	1381828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_008258	TGGTG	2	10	1381938	1381947	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_008258	CAGGA	2	10	1382050	1382059	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5100	NC_008258	A	6	6	1384873	1384878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_008258	CA	3	6	1384889	1384894	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5102	NC_008258	GA	3	6	1384926	1384931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_008258	CTG	2	6	1384983	1384988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_008258	CAA	2	6	1384991	1384996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_008258	GAA	2	6	1385001	1385006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5107	NC_008258	ACC	2	6	1385043	1385048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_008258	GCG	2	6	1385053	1385058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_008258	CGT	2	6	1385094	1385099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_008258	G	8	8	1385150	1385157	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_008258	CCG	2	6	1385192	1385197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5112	NC_008258	CGC	2	6	1385205	1385210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_008258	GTGA	2	8	1385237	1385244	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_008258	CGC	2	6	1385269	1385274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5115	NC_008258	GTG	2	6	1385288	1385293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_008258	TCG	2	6	1385350	1385355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_008258	TCG	2	6	1385361	1385366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_008258	GAA	2	6	1385420	1385425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_008258	GC	3	6	1385548	1385553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5120	NC_008258	AGA	2	6	1385599	1385604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_008258	ATA	2	6	1385702	1385707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_008258	TAC	2	6	1385744	1385749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_008258	TGG	2	6	1385772	1385777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_008258	CTGT	2	8	1385778	1385785	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5125	NC_008258	GCC	2	6	1385790	1385795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5126	NC_008258	CAGGCG	2	12	1385801	1385812	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_008258	TGC	2	6	1385862	1385867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_008258	ATGTG	2	10	1385955	1385964	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_008258	CCGC	2	8	1385972	1385979	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5130	NC_008258	GAC	2	6	1385983	1385988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5132	NC_008258	GA	3	6	1386113	1386118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5136	NC_008258	CTG	2	6	1386205	1386210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5152	NC_008258	ATGG	2	8	1390910	1390917	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5163	NC_008258	GAT	2	6	1391504	1391509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5253	NC_008258	AT	3	6	1413319	1413324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_008258	TA	3	6	1413330	1413335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_008258	CAA	2	6	1413338	1413343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5257	NC_008258	AAAT	2	8	1413394	1413401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_008258	A	6	6	1413474	1413479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5259	NC_008258	TAG	2	6	1413493	1413498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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