MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Sphingopyxis alaskensis RB2256 chromosome

Total Repeats: 7053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008048	TGG	2	6	422254	422259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_008048	GGC	2	6	422276	422281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_008048	GCG	2	6	422303	422308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_008048	AGA	2	6	422317	422322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_008048	CTG	2	6	422470	422475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_008048	GCA	2	6	422493	422498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_008048	AGA	2	6	422612	422617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_008048	AGAC	2	8	422759	422766	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_008048	TGA	2	6	422838	422843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_008048	TTC	2	6	422944	422949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_008048	CGA	2	6	422970	422975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_008048	GAA	2	6	423084	423089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_008048	GAC	2	6	423099	423104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_008048	ACAG	2	8	423636	423643	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_008048	GC	3	6	423668	423673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_008048	GTC	2	6	423903	423908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_008048	AGC	2	6	423916	423921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_008048	CGA	2	6	423926	423931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_008048	CGA	2	6	423991	423996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_008048	GGT	2	6	424018	424023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_008048	GCTAA	2	10	424044	424053	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1022	NC_008048	GGCA	2	8	424410	424417	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_008048	ACCC	2	8	426765	426772	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1024	NC_008048	CCA	2	6	427111	427116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_008048	GCG	2	6	427130	427135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_008048	CACT	2	8	427215	427222	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_008048	CTTGGC	2	12	427235	427246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_008048	GAGCT	2	10	427263	427272	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1029	NC_008048	GAT	2	6	427624	427629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_008048	ATG	2	6	427713	427718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_008048	GCA	2	6	427735	427740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_008048	CGG	3	9	428244	428252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_008048	CAG	2	6	428256	428261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_008048	TCC	2	6	428293	428298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_008048	GCG	2	6	428379	428384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_008048	TGG	2	6	428424	428429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_008048	CGT	2	6	428435	428440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_008048	GGC	3	9	428851	428859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_008048	CGC	3	9	428878	428886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_008048	AAAAG	2	10	428900	428909	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_008048	GTG	2	6	429451	429456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_008048	G	6	6	429517	429522	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_008048	CCT	2	6	430558	430563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_008048	TCC	2	6	431634	431639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_008048	TGAC	2	8	431640	431647	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_008048	CAGG	2	8	431706	431713	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_008048	GCCC	2	8	431795	431802	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1048	NC_008048	GGC	2	6	431823	431828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_008048	CT	3	6	431840	431845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_008048	TCC	2	6	432357	432362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_008048	AGG	3	9	433464	433472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_008048	AC	3	6	435465	435470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_008048	TCAA	2	8	435516	435523	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_008048	GATC	2	8	435582	435589	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_008048	CGA	2	6	435739	435744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_008048	TCT	2	6	435777	435782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_008048	CAT	2	6	435827	435832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_008048	TCA	2	6	435835	435840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_008048	TTCG	2	8	440529	440536	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_008048	ACG	2	6	440541	440546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_008048	GGTC	2	8	440553	440560	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_008048	GCG	2	6	440573	440578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_008048	CGC	2	6	440625	440630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_008048	CTGCA	2	10	440641	440650	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1065	NC_008048	AAG	2	6	440653	440658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_008048	GC	3	6	440712	440717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_008048	TGG	2	6	440740	440745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_008048	GCT	2	6	440773	440778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_008048	GGC	2	6	440779	440784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_008048	AGGG	2	8	440787	440794	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_008048	CAG	2	6	440815	440820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_008048	CTGG	2	8	440836	440843	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_008048	CAC	2	6	443083	443088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_008048	CTG	2	6	443663	443668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_008048	CAT	2	6	444888	444893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_008048	AT	3	6	444892	444897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_008048	AAT	2	6	444902	444907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_008048	GTT	2	6	453941	453946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_008048	TTTC	2	8	456076	456083	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_008048	GGA	2	6	456139	456144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_008048	GCT	2	6	456180	456185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_008048	CTG	2	6	456191	456196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_008048	GCC	2	6	456216	456221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_008048	AGGC	2	8	456244	456251	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_008048	TCG	2	6	456252	456257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_008048	CCGATG	2	12	456891	456902	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_008048	ACG	2	6	456916	456921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_008048	ATCT	2	8	459840	459847	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_008048	GCC	2	6	459886	459891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_008048	GCG	2	6	459895	459900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_008048	AT	3	6	460293	460298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_008048	TAAT	2	8	460358	460365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_008048	C	6	6	460417	460422	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1097	NC_008048	CGA	2	6	460425	460430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_008048	TA	4	8	460451	460458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_008048	AT	4	8	460466	460473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_008048	TAT	4	12	460482	460493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_008048	CAGG	2	8	460495	460502	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_008048	CTC	2	6	460509	460514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_008048	GTC	2	6	460522	460527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_008048	GCT	2	6	460533	460538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_008048	ATC	2	6	460555	460560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1107	NC_008048	CTAG	2	8	462822	462829	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1108	NC_008048	CCGG	2	8	462874	462881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_008048	GAAG	2	8	462952	462959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_008048	A	6	6	462961	462966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_008048	ACTTT	2	10	464709	464718	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1112	NC_008048	CGG	2	6	464732	464737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_008048	GGC	2	6	464738	464743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_008048	GAC	2	6	464744	464749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_008048	G	6	6	465123	465128	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_008048	GTCAA	2	10	465138	465147	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1117	NC_008048	GC	3	6	465165	465170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_008048	GGCG	2	8	466630	466637	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_008048	GC	3	6	466663	466668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_008048	GCC	2	6	466718	466723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_008048	CGC	2	6	466727	466732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_008048	ACG	2	6	466842	466847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_008048	CGAG	2	8	466866	466873	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1124	NC_008048	TCAA	2	8	466884	466891	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_008048	CG	3	6	466932	466937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_008048	CCCG	2	8	467711	467718	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1127	NC_008048	CCG	2	6	467816	467821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_008048	TGA	2	6	467843	467848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_008048	GC	3	6	467865	467870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_008048	TTCG	2	8	467879	467886	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1131	NC_008048	GGGGA	2	10	469798	469807	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_008048	T	6	6	469819	469824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_008048	TGG	2	6	469828	469833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_008048	GTG	2	6	469861	469866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_008048	TCC	2	6	469882	469887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1136	NC_008048	GTG	2	6	469929	469934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1176	NC_008048	CGGA	2	8	483158	483165	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1262	NC_008048	ATCC	2	8	538016	538023	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1263	NC_008048	CAG	2	6	538040	538045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1266	NC_008048	CCCCT	2	10	539842	539851	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1267	NC_008048	AGGGG	2	10	539854	539863	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1268	NC_008048	TGC	2	6	539873	539878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1270	NC_008048	ATCT	2	8	543215	543222	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1403	NC_008048	CG	3	6	593109	593114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1404	NC_008048	TC	4	8	594061	594068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1405	NC_008048	ACGTAA	2	12	594119	594130	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1406	NC_008048	GA	3	6	594173	594178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1407	NC_008048	GCGCC	2	10	594232	594241	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1408	NC_008048	CCG	2	6	594259	594264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1409	NC_008048	CATT	2	8	594269	594276	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1410	NC_008048	TC	4	8	598893	598900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1411	NC_008048	CCG	2	6	598916	598921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1412	NC_008048	GCCG	2	8	598949	598956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1413	NC_008048	CGGC	2	8	598981	598988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1431	NC_008048	GC	3	6	602309	602314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1432	NC_008048	CAGCG	2	10	602321	602330	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1436	NC_008048	CG	5	10	605326	605335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1442	NC_008048	GGA	2	6	605467	605472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1444	NC_008048	CGC	2	6	605496	605501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1446	NC_008048	CAT	2	6	606581	606586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1448	NC_008048	CTC	2	6	607485	607490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1453	NC_008048	GCGCG	2	10	611755	611764	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1454	NC_008048	CGG	2	6	611799	611804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1471	NC_008048	CAT	2	6	618402	618407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1472	NC_008048	GGCCG	2	10	618432	618441	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1473	NC_008048	CCG	2	6	618495	618500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1494	NC_008048	TCG	2	6	630814	630819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1496	NC_008048	TCCC	2	8	631772	631779	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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1498	NC_008048	GCG	5	15	633097	633111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1500	NC_008048	CGC	3	9	633138	633146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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