MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Sphingopyxis alaskensis RB2256 chromosome

Total Repeats: 7053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008048	GCCTT	2	10	185182	185191	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
502	NC_008048	CCG	2	6	185194	185199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_008048	CCTG	2	8	185201	185208	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
504	NC_008048	CCG	2	6	185209	185214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_008048	TCC	2	6	187953	187958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_008048	GGC	2	6	187967	187972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_008048	CAT	2	6	187989	187994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_008048	TTG	2	6	187996	188001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_008048	GGCG	2	8	195034	195041	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
510	NC_008048	ATT	2	6	195150	195155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_008048	CGC	2	6	195181	195186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_008048	GCC	2	6	195205	195210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_008048	CCG	2	6	198837	198842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_008048	CTT	2	6	200377	200382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_008048	GAGCG	2	10	200417	200426	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
516	NC_008048	GGC	2	6	200434	200439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_008048	GCCA	2	8	200445	200452	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
518	NC_008048	TCG	2	6	200496	200501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_008048	CGA	2	6	204176	204181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_008048	GGA	2	6	209007	209012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_008048	TTGCC	2	10	213978	213987	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
522	NC_008048	C	6	6	213990	213995	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
523	NC_008048	CG	3	6	213999	214004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
524	NC_008048	GA	3	6	214028	214033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
525	NC_008048	GAG	2	6	215057	215062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_008048	CGA	2	6	215068	215073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_008048	GCTTC	2	10	215118	215127	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
528	NC_008048	CGG	2	6	215759	215764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_008048	CGAAC	2	10	217425	217434	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
530	NC_008048	TCC	2	6	218839	218844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_008048	AGGGGG	2	12	218850	218861	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_008048	ACC	2	6	218862	218867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_008048	GTG	2	6	218874	218879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_008048	CCA	2	6	218927	218932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_008048	GGA	2	6	218960	218965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_008048	GGC	2	6	219839	219844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_008048	GTC	3	9	219851	219859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_008048	TCG	2	6	219893	219898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_008048	CG	4	8	219897	219904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
540	NC_008048	GAT	2	6	220957	220962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_008048	C	6	6	221302	221307	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
542	NC_008048	GCCCC	2	10	221310	221319	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
543	NC_008048	T	6	6	221330	221335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_008048	GCG	2	6	222712	222717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_008048	AGGAA	2	10	223664	223673	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
546	NC_008048	GGC	2	6	226186	226191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_008048	ATC	2	6	226279	226284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_008048	GC	3	6	227212	227217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_008048	GCG	2	6	227722	227727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_008048	AGC	2	6	227742	227747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_008048	TGGGG	2	10	227753	227762	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
552	NC_008048	GGC	2	6	227763	227768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_008048	GCA	2	6	227832	227837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_008048	TC	3	6	227856	227861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_008048	GA	3	6	227872	227877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
556	NC_008048	CGC	3	9	229511	229519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_008048	CCTT	2	8	229525	229532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
558	NC_008048	GCTT	2	8	229603	229610	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
559	NC_008048	GAT	2	6	229669	229674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_008048	GGAG	2	8	232697	232704	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
561	NC_008048	ATA	2	6	234236	234241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_008048	TCG	2	6	234556	234561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_008048	AAG	2	6	234564	234569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_008048	CGC	2	6	234608	234613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_008048	CGG	2	6	234618	234623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_008048	CGG	2	6	234644	234649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_008048	TCG	2	6	234677	234682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_008048	CGC	2	6	234702	234707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_008048	GCT	2	6	236196	236201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_008048	TCG	2	6	236237	236242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_008048	CAG	2	6	236248	236253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_008048	CGC	2	6	236320	236325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_008048	CGC	2	6	236344	236349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_008048	TGTC	2	8	236359	236366	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
575	NC_008048	ACG	2	6	237596	237601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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577	NC_008048	CAG	2	6	238774	238779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_008048	GGC	2	6	238788	238793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_008048	GCG	2	6	238812	238817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_008048	GC	3	6	238819	238824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
581	NC_008048	TCC	2	6	239065	239070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_008048	TGA	2	6	239072	239077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_008048	GAA	2	6	239167	239172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_008048	AGGA	2	8	239175	239182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
585	NC_008048	GGT	2	6	240195	240200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_008048	GCG	2	6	240247	240252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_008048	CG	3	6	240251	240256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
588	NC_008048	ACG	2	6	240391	240396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_008048	GCG	3	9	240403	240411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_008048	CG	3	6	240421	240426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
591	NC_008048	CGG	2	6	241727	241732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_008048	GGA	2	6	241733	241738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_008048	CCG	2	6	242501	242506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_008048	CGA	2	6	243389	243394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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596	NC_008048	GGA	2	6	243402	243407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_008048	GCG	2	6	243414	243419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_008048	TC	3	6	243951	243956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
599	NC_008048	CAC	2	6	245912	245917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_008048	GCC	2	6	246529	246534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_008048	GC	5	10	246545	246554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
602	NC_008048	GTC	2	6	247573	247578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_008048	ATCGGG	2	12	247588	247599	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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605	NC_008048	CGA	2	6	247645	247650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_008048	GGC	2	6	247654	247659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_008048	CG	3	6	248764	248769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
608	NC_008048	GGC	2	6	248819	248824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_008048	GTTT	2	8	248828	248835	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
610	NC_008048	AGG	2	6	249898	249903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_008048	GCC	2	6	249919	249924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_008048	GAG	2	6	250808	250813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_008048	TTG	2	6	250859	250864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_008048	TAAT	2	8	250876	250883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_008048	CGC	2	6	250912	250917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_008048	GCC	2	6	250981	250986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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618	NC_008048	GCC	2	6	251646	251651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_008048	TGC	2	6	251703	251708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_008048	GC	3	6	251774	251779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_008048	GCC	2	6	251792	251797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_008048	GAG	2	6	251825	251830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_008048	GGC	2	6	252736	252741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_008048	GGCG	2	8	253682	253689	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
625	NC_008048	TTG	2	6	253851	253856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_008048	TTC	2	6	255078	255083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_008048	GCG	2	6	255105	255110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_008048	CG	3	6	255154	255159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
629	NC_008048	GCG	2	6	255210	255215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_008048	CGC	2	6	255222	255227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_008048	CACC	2	8	255230	255237	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
632	NC_008048	AGGG	2	8	255257	255264	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
633	NC_008048	GGA	2	6	256880	256885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_008048	GC	3	6	256936	256941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
635	NC_008048	GAG	2	6	256968	256973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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637	NC_008048	CGC	2	6	259310	259315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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