MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Sphingopyxis alaskensis RB2256 chromosome

Total Repeats: 7053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008048	GCC	2	6	2307195	2307200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5002	NC_008048	CG	4	8	2307226	2307233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5003	NC_008048	T	6	6	2307331	2307336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_008048	CTGGG	2	10	2307347	2307356	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5005	NC_008048	GA	3	6	2307386	2307391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_008048	CG	3	6	2308063	2308068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5007	NC_008048	GC	3	6	2308078	2308083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5008	NC_008048	CGA	2	6	2310384	2310389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_008048	CCG	2	6	2310404	2310409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_008048	AGG	2	6	2310423	2310428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_008048	CGA	2	6	2312025	2312030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_008048	AAC	2	6	2312082	2312087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_008048	ATC	2	6	2312097	2312102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_008048	GGA	2	6	2312815	2312820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_008048	CGAC	2	8	2314534	2314541	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5016	NC_008048	A	6	6	2314560	2314565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_008048	GCG	2	6	2314616	2314621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5019	NC_008048	CCA	2	6	2314660	2314665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_008048	CGG	2	6	2314681	2314686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_008048	GCG	2	6	2314692	2314697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_008048	GTC	2	6	2314718	2314723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5024	NC_008048	CCGCCT	2	12	2314738	2314749	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5025	NC_008048	CG	4	8	2314757	2314764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_008048	CG	4	8	2314798	2314805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5029	NC_008048	CG	3	6	2318423	2318428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5030	NC_008048	GCC	2	6	2319854	2319859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5032	NC_008048	CG	3	6	2320206	2320211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_008048	GCCCG	2	10	2320212	2320221	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5034	NC_008048	GGCG	2	8	2320273	2320280	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5035	NC_008048	GCCC	2	8	2320315	2320322	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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5039	NC_008048	CG	3	6	2322645	2322650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_008048	AAATG	2	10	2322704	2322713	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_008048	GCGA	2	8	2324110	2324117	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5042	NC_008048	CTC	2	6	2324187	2324192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_008048	GGCA	2	8	2325743	2325750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5044	NC_008048	TCG	2	6	2325758	2325763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5047	NC_008048	TC	3	6	2325792	2325797	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_008048	CAT	2	6	2325800	2325805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5050	NC_008048	AAGG	2	8	2326748	2326755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5052	NC_008048	TC	3	6	2328161	2328166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5053	NC_008048	GACGA	2	10	2328176	2328185	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5054	NC_008048	GAT	2	6	2328213	2328218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_008048	CCGCG	2	10	2329381	2329390	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5056	NC_008048	CG	4	8	2329387	2329394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_008048	GCG	3	9	2329399	2329407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_008048	CG	3	6	2329406	2329411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_008048	GC	3	6	2329433	2329438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5060	NC_008048	CGC	2	6	2329445	2329450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5063	NC_008048	AGGGG	2	10	2330585	2330594	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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5065	NC_008048	GTG	2	6	2330608	2330613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5071	NC_008048	ACCG	2	8	2331703	2331710	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5072	NC_008048	CGCC	2	8	2331726	2331733	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5073	NC_008048	C	6	6	2333770	2333775	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5076	NC_008048	GCG	2	6	2335759	2335764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5088	NC_008048	GCGATC	2	12	2344512	2344523	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5097	NC_008048	AGA	2	6	2355620	2355625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5099	NC_008048	CAA	2	6	2357332	2357337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_008048	A	6	6	2357336	2357341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_008048	CTG	2	6	2359495	2359500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5109	NC_008048	GCG	2	6	2363313	2363318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_008048	GC	3	6	2363338	2363343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5111	NC_008048	CGGCG	2	10	2368216	2368225	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5112	NC_008048	GCC	2	6	2369786	2369791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_008048	ATC	2	6	2369800	2369805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_008048	GA	3	6	2369821	2369826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_008048	GCGG	2	8	2370592	2370599	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5116	NC_008048	GCG	2	6	2370634	2370639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5122	NC_008048	GCC	2	6	2376732	2376737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5123	NC_008048	GC	4	8	2376753	2376760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_008048	CG	3	6	2376777	2376782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5125	NC_008048	ATT	2	6	2376793	2376798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5128	NC_008048	CG	3	6	2378329	2378334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5129	NC_008048	CGG	2	6	2378344	2378349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_008048	G	6	6	2378357	2378362	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_008048	TA	3	6	2378390	2378395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_008048	TGCGC	2	10	2378399	2378408	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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5136	NC_008048	CG	3	6	2379191	2379196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5264	NC_008048	GGAGG	2	10	2427271	2427280	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5265	NC_008048	TTGC	2	8	2427398	2427405	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5266	NC_008048	TGA	2	6	2427414	2427419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5270	NC_008048	A	6	6	2428997	2429002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5283	NC_008048	CT	3	6	2435754	2435759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5284	NC_008048	GGAA	2	8	2435768	2435775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5288	NC_008048	GC	5	10	2437871	2437880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5293	NC_008048	GAAA	2	8	2441017	2441024	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5321	NC_008048	CGC	2	6	2455096	2455101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5323	NC_008048	CGG	3	9	2455124	2455132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5325	NC_008048	T	8	8	2455186	2455193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5326	NC_008048	GC	3	6	2455264	2455269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5333	NC_008048	CATT	2	8	2457854	2457861	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5372	NC_008048	C	6	6	2469038	2469043	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5386	NC_008048	TTTCC	2	10	2473660	2473669	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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5388	NC_008048	CG	3	6	2473701	2473706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5390	NC_008048	GC	3	6	2473728	2473733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5391	NC_008048	AAT	2	6	2475131	2475136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5392	NC_008048	G	6	6	2476030	2476035	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5393	NC_008048	TGT	2	6	2476069	2476074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5395	NC_008048	GC	4	8	2477241	2477248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5396	NC_008048	TTCG	2	8	2477622	2477629	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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