MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10750 chromosome

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008024	AGTGTA	2	12	21851	21862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008024	ACTAAT	2	12	21879	21890	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_008024	AGTGTA	2	12	27852	27863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008024	ACTAAT	2	12	27880	27891	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_008024	AAGAGT	2	12	29957	29968	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008024	TATACT	2	12	30683	30694	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_008024	TATTTT	2	12	65973	65984	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008024	AAAGGT	2	12	66443	66454	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008024	AGTGTA	2	12	87028	87039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008024	ACTAAT	2	12	87056	87067	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_008024	TTCGGG	2	12	87998	88009	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_008024	ATAAAA	2	12	116414	116425	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008024	AGATAA	2	12	142862	142873	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008024	CTTTAT	2	12	168493	168504	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_008024	CTCTTT	2	12	170357	170368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008024	TGACAC	2	12	189111	189122	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008024	AAATTA	2	12	191010	191021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008024	TTTAAA	2	12	195605	195616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008024	AGTGTA	2	12	270111	270122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008024	ACTAAT	2	12	270139	270150	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_008024	TTAAAA	2	12	290743	290754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008024	TTTAAT	2	12	307821	307832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008024	TTTTAG	2	12	319177	319188	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008024	AAGACC	2	12	335868	335879	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008024	ATTTAA	2	12	371557	371568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008024	TGACAA	2	12	395859	395870	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_008024	AGAAAT	2	12	416154	416165	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008024	ATTTTA	2	12	451840	451851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008024	GAGTAA	2	12	457629	457640	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008024	TAAAAA	2	12	473477	473488	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008024	AGGACT	2	12	478600	478611	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_008024	TAAAAA	2	12	498016	498027	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008024	TTAATA	2	12	557810	557821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008024	CCTTGT	2	12	617450	617461	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008024	TAAATA	2	12	736492	736503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008024	AGGTAA	2	12	747295	747306	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008024	TTCGGG	2	12	783922	783933	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_008024	GAAAAA	2	12	875606	875617	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008024	TTATCA	2	12	907805	907816	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_008024	TCTGAT	2	12	936892	936903	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008024	TTAAAA	2	12	953748	953759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008024	TTTAAA	2	12	1068157	1068168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008024	TTGTTT	2	12	1097578	1097589	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008024	ATATGA	2	12	1131143	1131154	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008024	AGTCTT	2	12	1151104	1151115	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008024	TCTTTT	2	12	1181519	1181530	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_008024	TTTTAA	2	12	1222046	1222057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008024	TATTGC	2	12	1224716	1224727	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_008024	CTAAAA	2	12	1248324	1248335	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_008024	TCTGCT	2	12	1251370	1251381	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008024	TGACTT	2	12	1272227	1272238	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_008024	ATGATA	2	12	1278734	1278745	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008024	TAGAAT	2	12	1288577	1288588	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008024	GAGATA	2	12	1306484	1306495	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008024	TCCTTC	2	12	1357852	1357863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008024	TATTAG	2	12	1363368	1363379	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008024	TACACT	2	12	1363397	1363408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008024	GAAAAA	2	12	1368863	1368874	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008024	CAATTC	2	12	1387952	1387963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008024	TATTTT	2	12	1389024	1389035	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008024	AATACC	2	12	1398041	1398052	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008024	AACAAT	2	12	1470590	1470601	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_008024	AATATT	2	12	1569300	1569311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008024	TTTGCT	2	12	1584574	1584585	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_008024	TATAAT	2	12	1587420	1587431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008024	TAACAA	2	12	1598521	1598532	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_008024	TTTTTC	2	12	1600906	1600917	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_008024	AGAAAA	2	12	1603602	1603613	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008024	TATTAG	2	12	1609934	1609945	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008024	TACACT	2	12	1609963	1609974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008024	ATTTTT	2	12	1648774	1648785	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008024	TAATTA	2	12	1655725	1655736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008024	TGTCAA	2	12	1665121	1665132	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_008024	GTTAAA	2	12	1673945	1673956	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008024	ATTTTA	2	12	1855684	1855695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008024	CGGTAA	2	12	1864817	1864828	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_008024	AAAAAC	2	12	1871684	1871695	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008024	TTTTCA	2	12	1876745	1876756	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_008024	GTAAAA	2	12	1888724	1888735	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008024	AATTTA	3	18	1900189	1900206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008024	GAAAAA	2	12	1932583	1932594	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.