MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS2096 chromosome

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008023	AGTGTA	2	12	21855	21866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008023	ACTAAT	2	12	21883	21894	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_008023	AGTGTA	2	12	27856	27867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008023	ACTAAT	2	12	27884	27895	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_008023	TATTTT	2	12	64473	64484	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008023	AGTGTA	2	12	84441	84452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008023	ACTAAT	2	12	84469	84480	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_008023	TTCGGG	2	12	85411	85422	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_008023	ATAAAA	2	12	112554	112565	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008023	AGATAA	2	12	127257	127268	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008023	AGATAA	2	12	140077	140088	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008023	AAGGCT	2	12	160032	160043	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_008023	CTCTTT	2	12	168578	168589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008023	CAGTTC	2	12	201405	201416	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008023	TTTAAA	2	12	203254	203265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008023	AGTGTA	2	12	277363	277374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008023	ACTAAT	2	12	277391	277402	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_008023	TTAAAA	2	12	297761	297772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008023	TTTAAT	2	12	314839	314850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008023	TTTTAG	2	12	326196	326207	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008023	AAGACC	2	12	341341	341352	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008023	AGCTTA	2	12	365028	365039	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008023	ATTTAA	2	12	377895	377906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008023	AGAAAT	2	12	410898	410909	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008023	ATTTTA	2	12	442056	442067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008023	GAGTAA	2	12	447845	447856	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008023	AGGACT	2	12	463842	463853	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_008023	TAAAAA	2	12	483262	483273	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008023	AAAAGA	2	12	483445	483456	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008023	CAAAGA	2	12	548182	548193	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_008023	CCTTGT	2	12	598563	598574	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008023	TAAATA	2	12	712570	712581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008023	TTCGGG	2	12	759417	759428	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008023	CAATAG	2	12	801241	801252	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_008023	GAAAAA	2	12	812971	812982	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008023	TTATCA	2	12	846594	846605	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_008023	TTAAAA	2	12	892531	892542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008023	TTTAAA	2	12	994632	994643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008023	ATATGA	2	12	1050569	1050580	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008023	TTTGCG	2	12	1097665	1097676	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008023	AGTCTT	2	12	1129541	1129552	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_008023	TCTTTT	2	12	1158140	1158151	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_008023	CCTTGG	2	12	1190141	1190152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008023	TGACTT	2	12	1213269	1213280	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008023	ATGATA	2	12	1219775	1219786	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008023	TAGAAT	2	12	1229619	1229630	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008023	TCCTTC	2	12	1299199	1299210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008023	TATTAG	2	12	1304712	1304723	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008023	TACACT	2	12	1304741	1304752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008023	GAAAAA	2	12	1310208	1310219	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008023	CAATTC	2	12	1329295	1329306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008023	TATTTT	2	12	1330369	1330380	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008023	AATACC	2	12	1339385	1339396	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008023	ATATTT	2	12	1432085	1432096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008023	GGTTTT	2	12	1432247	1432258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008023	ATTCCA	2	12	1481500	1481511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008023	CTAGTC	2	12	1532779	1532790	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008023	AATATT	2	12	1551290	1551301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008023	TTGCTT	2	12	1567038	1567049	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_008023	TAACAA	2	12	1580981	1580992	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_008023	TTTTTC	2	12	1583367	1583378	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_008023	AGAAAA	2	12	1586058	1586069	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008023	TATTAG	2	12	1592387	1592398	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008023	TACACT	2	12	1592416	1592427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008023	GTTAAA	2	12	1607550	1607561	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008023	AAAACA	2	12	1700640	1700651	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_008023	ATTTTA	2	12	1789095	1789106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008023	TTTTCA	2	12	1796289	1796300	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_008023	AAAATA	2	12	1802013	1802024	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008023	TAAAAA	2	12	1808272	1808283	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008023	AATTTA	3	18	1819639	1819656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008023	TTTTAT	2	12	1832076	1832087	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008023	GAAAAA	2	12	1856073	1856084	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.