MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS2096 chromosome

Total Repeats: 5791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008023	GA	3	6	227303	227308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_008023	TAAA	2	8	229066	229073	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_008023	ATAG	2	8	229120	229127	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_008023	TTTG	2	8	229182	229189	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_008023	GAC	2	6	231834	231839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_008023	AAC	2	6	231853	231858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_008023	CTA	2	6	232740	232745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_008023	GTA	2	6	232826	232831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_008023	A	6	6	232877	232882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_008023	AATAA	2	10	234355	234364	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008023	A	6	6	234398	234403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_008023	AAG	2	6	234428	234433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_008023	A	7	7	235355	235361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_008023	GTTCA	2	10	235386	235395	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1015	NC_008023	T	6	6	235449	235454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_008023	A	6	6	235465	235470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_008023	TCT	2	6	235535	235540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_008023	A	6	6	235566	235571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_008023	TCA	2	6	235572	235577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_008023	T	6	6	235664	235669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_008023	ATA	2	6	235721	235726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_008023	TTA	2	6	235730	235735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_008023	TAG	2	6	235736	235741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_008023	TGA	2	6	240163	240168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_008023	ATG	2	6	240190	240195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_008023	TTA	2	6	240227	240232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_008023	TAA	2	6	240297	240302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_008023	A	7	7	240307	240313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_008023	T	6	6	240340	240345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_008023	TC	3	6	243941	243946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_008023	TTG	2	6	243973	243978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_008023	A	7	7	244031	244037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_008023	ATA	2	6	244462	244467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_008023	CAAA	2	8	244975	244982	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_008023	TAA	2	6	245071	245076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_008023	GAA	2	6	245122	245127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_008023	CA	3	6	245158	245163	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_008023	CAA	2	6	245229	245234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_008023	A	7	7	245304	245310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_008023	T	6	6	247438	247443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_008023	A	6	6	247525	247530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_008023	TGG	2	6	247550	247555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_008023	AGA	2	6	247568	247573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_008023	AAG	2	6	247574	247579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_008023	ATTT	2	8	247602	247609	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_008023	T	6	6	247613	247618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_008023	TA	3	6	247629	247634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_008023	GTT	2	6	247651	247656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_008023	TAGG	2	8	247687	247694	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_008023	ATA	2	6	247710	247715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_008023	AG	3	6	248773	248778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_008023	TAA	2	6	248894	248899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_008023	T	7	7	248941	248947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_008023	GA	3	6	248964	248969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_008023	T	6	6	248987	248992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_008023	AAT	2	6	249014	249019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_008023	T	6	6	249040	249045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_008023	TCT	2	6	249064	249069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_008023	T	6	6	249090	249095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_008023	TCC	2	6	249107	249112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_008023	ATT	2	6	249122	249127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_008023	A	6	6	249202	249207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_008023	AT	3	6	251610	251615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_008023	AAT	2	6	251653	251658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_008023	GCT	2	6	253674	253679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_008023	TAA	2	6	253720	253725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_008023	AGA	2	6	254641	254646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_008023	TAA	2	6	254687	254692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_008023	TA	3	6	257600	257605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_008023	AAAG	2	8	258920	258927	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_008023	GTA	2	6	262094	262099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_008023	T	7	7	263434	263440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_008023	TAAA	2	8	263472	263479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_008023	GTCA	2	8	263506	263513	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_008023	GTT	2	6	263929	263934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_008023	TAT	2	6	264795	264800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_008023	T	7	7	264800	264806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_008023	AGT	2	6	264851	264856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_008023	TAA	2	6	264861	264866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_008023	GA	3	6	264878	264883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_008023	TTA	2	6	264894	264899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_008023	A	6	6	264919	264924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_008023	TCATT	2	10	264995	265004	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1084	NC_008023	A	6	6	265069	265074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_008023	TGT	2	6	271622	271627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_008023	TTG	2	6	271667	271672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_008023	AAT	2	6	271674	271679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1089	NC_008023	TAG	2	6	271689	271694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_008023	TAT	2	6	272065	272070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_008023	TGG	2	6	272086	272091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_008023	TAG	2	6	272093	272098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_008023	T	7	7	272102	272108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_008023	TCA	2	6	272137	272142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_008023	A	6	6	272154	272159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_008023	T	7	7	272176	272182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_008023	T	6	6	272219	272224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_008023	A	6	6	272255	272260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_008023	A	7	7	272265	272271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_008023	A	7	7	272274	272280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_008023	TAA	2	6	272313	272318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_008023	AAAT	2	8	272502	272509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_008023	AG	3	6	272553	272558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_008023	GGC	2	6	272585	272590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_008023	ACCT	2	8	272676	272683	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_008023	AG	3	6	272728	272733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_008023	CGA	2	6	272830	272835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_008023	GCA	2	6	272904	272909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_008023	CGC	2	6	272951	272956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_008023	GTGA	2	8	272957	272964	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_008023	TGT	2	6	272990	272995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_008023	AGA	2	6	272999	273004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_008023	ATG	2	6	273005	273010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_008023	CCA	2	6	273026	273031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_008023	TAAC	2	8	273040	273047	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_008023	CAG	2	6	273073	273078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_008023	AGCG	2	8	273128	273135	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_008023	T	6	6	273143	273148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_008023	AT	3	6	273257	273262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_008023	GGA	2	6	273263	273268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_008023	CT	3	6	273288	273293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_008023	GAA	2	6	273527	273532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_008023	GGT	2	6	273601	273606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_008023	GTC	2	6	273615	273620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_008023	TCGTG	2	10	273624	273633	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1126	NC_008023	CAT	2	6	273683	273688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_008023	TAA	2	6	273718	273723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_008023	GGA	2	6	273727	273732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_008023	ATC	2	6	273751	273756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_008023	AC	3	6	273778	273783	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_008023	TGGT	2	8	273793	273800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_008023	CGC	2	6	273917	273922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_008023	AC	3	6	273947	273952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_008023	CAC	2	6	273962	273967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_008023	AGCC	2	8	274010	274017	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_008023	GAT	2	6	274033	274038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_008023	AGG	2	6	274188	274193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1272	NC_008023	A	6	6	291226	291231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1414	NC_008023	GTT	2	6	341264	341269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_008023	AGC	2	6	341332	341337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1418	NC_008023	TCG	2	6	341423	341428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1423	NC_008023	TGA	2	6	341603	341608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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