MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10270 chromosome

Total Repeats: 299

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008022	ACATT	2	10	16492	16501	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008022	TCGTG	2	10	18111	18120	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_008022	GTTAA	2	10	19007	19016	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008022	GGGAG	2	10	19526	19535	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008022	AGGGA	2	10	21737	21746	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008022	GCTTA	2	10	22103	22112	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_008022	TCGTG	2	10	24112	24121	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_008022	GTTAA	2	10	25008	25017	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008022	GGGAG	2	10	25527	25536	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008022	AGGGA	2	10	27738	27747	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008022	GCTTA	2	10	28104	28113	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008022	TTTTC	2	10	29936	29945	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_008022	CTTTT	2	10	30044	30053	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008022	TATAA	2	10	32482	32491	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008022	AGCGA	2	10	40606	40615	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008022	ATTTT	2	10	61360	61369	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008022	AAATA	2	10	62627	62636	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008022	TATAT	2	10	62712	62721	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008022	AAGGA	2	10	70570	70579	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008022	GTTTC	2	10	77838	77847	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_008022	TCGTG	2	10	81098	81107	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008022	GTTAA	2	10	81994	82003	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008022	GGGAG	2	10	82513	82522	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008022	AGGGA	2	10	84724	84733	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008022	GCTTA	2	10	85090	85099	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_008022	ATTAT	2	10	85380	85389	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008022	TATAT	2	10	85463	85472	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008022	AGAAA	2	10	110706	110715	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008022	TTTAG	2	10	110975	110984	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008022	TTAAG	2	10	115636	115645	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008022	TTGGC	2	10	140053	140062	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008022	AAGCA	2	10	159412	159421	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008022	ATTAT	2	10	160353	160362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008022	ATATT	2	10	160378	160387	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008022	CGTCA	2	10	165798	165807	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_008022	AAAAG	2	10	182025	182034	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008022	TCTAA	2	10	196267	196276	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_008022	TTAAA	2	10	201049	201058	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008022	TGTCT	2	10	210166	210175	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_008022	TAAGA	2	10	211684	211693	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008022	GTAAA	2	10	214826	214835	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008022	GTTCA	2	10	232043	232052	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_008022	TCATT	2	10	261649	261658	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_008022	TTGTA	2	10	268272	268281	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008022	TCGTG	2	10	270277	270286	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_008022	GTTAA	2	10	271173	271182	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008022	GGGAG	2	10	271692	271701	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008022	AGGGA	2	10	273903	273912	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008022	AAAAG	2	10	274577	274586	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008022	TTATC	2	10	275377	275386	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_008022	GTTAT	2	10	283754	283763	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008022	TAGCA	2	10	283896	283905	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_008022	ATTAT	2	10	288333	288342	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008022	ATTAT	2	10	288470	288479	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008022	TGTGT	2	10	301722	301731	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008022	AAAAG	2	10	310119	310128	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008022	TGCTA	2	10	321352	321361	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_008022	CAGGG	2	10	321372	321381	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_008022	TAAAA	2	10	327020	327029	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008022	ACAAG	2	10	344740	344749	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_008022	TTGAT	2	10	351469	351478	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008022	TGAAA	2	10	360465	360474	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008022	TGAAA	2	10	363030	363039	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008022	TTTAT	2	10	366712	366721	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008022	TTTAG	2	10	366874	366883	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008022	TATAG	2	10	366941	366950	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008022	TGAGA	2	10	369515	369524	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008022	TTGAT	2	10	369538	369547	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008022	TTTAT	2	10	379100	379109	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008022	AAATC	2	10	382856	382865	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_008022	AGAAA	2	10	384641	384650	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008022	AAGGA	2	10	393306	393315	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008022	ACTCT	2	10	395553	395562	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_008022	AAGTA	2	10	396233	396242	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008022	AAAGC	2	10	401823	401832	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_008022	CTAAT	2	10	421086	421095	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_008022	AGCTT	2	10	426466	426475	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_008022	TTTTC	2	10	426510	426519	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_008022	AATCA	2	10	446354	446363	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_008022	TTATT	2	10	454494	454503	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008022	TCCTT	2	10	473635	473644	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_008022	GTTAT	2	10	476879	476888	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008022	TTTCC	2	10	478446	478455	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_008022	AAAAT	2	10	478529	478538	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008022	AGAAA	2	10	478584	478593	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008022	TTAGT	2	10	483107	483116	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008022	TATAA	2	10	484134	484143	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008022	CTTTT	2	10	493424	493433	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_008022	ATGGG	2	10	496830	496839	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008022	TTTAG	2	10	496873	496882	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008022	TAGAA	2	10	498572	498581	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008022	TAAAA	2	10	499178	499187	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008022	AGCTG	2	10	513678	513687	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_008022	ATAAA	2	10	515056	515065	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008022	TTTTG	2	10	517925	517934	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008022	AAGCC	2	10	518912	518921	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_008022	TGATA	2	10	528544	528553	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008022	TACTA	2	10	530111	530120	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_008022	AGTTT	2	10	531849	531858	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008022	AGAAA	2	10	533638	533647	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008022	TTATA	2	10	548623	548632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008022	ACGTA	2	10	582270	582279	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_008022	TAAAT	2	10	582939	582948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008022	AAAAG	2	10	599403	599412	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008022	ATAAA	2	10	603239	603248	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008022	GAATA	2	10	606594	606603	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008022	CGACA	2	10	615210	615219	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_008022	ATAGA	2	10	615718	615727	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008022	AGCAC	2	10	622351	622360	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_008022	TATAA	2	10	623436	623445	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008022	AGCAT	2	10	632116	632125	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_008022	GAAAG	2	10	635369	635378	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008022	ATTTA	2	10	669051	669060	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008022	GGAAG	2	10	669707	669716	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008022	AAAGA	2	10	672133	672142	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008022	AAATA	2	10	673540	673549	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008022	TTCGG	2	10	684643	684652	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_008022	AAAAG	2	10	686540	686549	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008022	TTTTA	2	10	705573	705582	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008022	ATGTT	2	10	710465	710474	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008022	AAAGG	2	10	734252	734261	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008022	ATTGA	2	10	734279	734288	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008022	ATGTT	2	10	739344	739353	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008022	CTAAT	2	10	752699	752708	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_008022	CATCT	2	10	755068	755077	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_008022	ATAAA	2	10	757088	757097	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008022	TAAAA	3	15	768871	768885	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008022	TACTA	2	10	774094	774103	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_008022	CAAAA	2	10	785762	785771	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_008022	ATTAT	2	10	810260	810269	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008022	GGAAA	2	10	810887	810896	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008022	TAAGG	2	10	824175	824184	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008022	CACCT	2	10	826398	826407	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
134	NC_008022	ATGAT	2	10	836585	836594	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008022	TAGAA	2	10	844050	844059	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008022	ATTTA	2	10	844412	844421	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008022	TAAAA	2	10	866518	866527	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008022	AATGT	2	10	867188	867197	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008022	AATAA	2	10	888575	888584	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008022	TTAAA	2	10	922705	922714	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008022	AAAGG	2	10	922762	922771	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008022	CAAAA	2	10	939072	939081	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_008022	TAAGA	2	10	945028	945037	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008022	CTTGT	2	10	952181	952190	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_008022	AGTTG	2	10	957589	957598	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008022	ATAAA	2	10	964537	964546	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008022	CATAA	2	10	972705	972714	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_008022	TTTAG	2	10	973401	973410	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_008022	CTTAG	2	10	1339614	1339623	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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280	NC_008022	AACTT	2	10	1869417	1869426	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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285	NC_008022	CCTAT	2	10	1888193	1888202	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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289	NC_008022	TGTTT	2	10	1900148	1900157	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
290	NC_008022	CAATT	2	10	1908104	1908113	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
291	NC_008022	TACTT	2	10	1911863	1911872	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
292	NC_008022	TAAAT	2	10	1914793	1914802	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_008022	CTTTT	2	10	1916299	1916308	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
294	NC_008022	TATCA	2	10	1916350	1916359	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
295	NC_008022	TTATC	2	10	1916555	1916564	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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297	NC_008022	GTCAA	2	10	1923979	1923988	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
298	NC_008022	AAAAG	2	10	1926025	1926034	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
299	NC_008022	CTTTT	2	10	1926056	1926065	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.