MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10270 chromosome

Total Repeats: 6045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008022	TCA	2	6	1923442	1923447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_008022	A	6	6	1923479	1923484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_008022	ATC	2	6	1923523	1923528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_008022	AGAAC	2	10	1923540	1923549	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6005	NC_008022	TAA	2	6	1923606	1923611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_008022	TAAA	2	8	1923650	1923657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_008022	A	7	7	1923655	1923661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_008022	CAT	2	6	1923720	1923725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_008022	CTA	2	6	1923742	1923747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_008022	GAAAAA	2	12	1923765	1923776	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_008022	A	7	7	1923772	1923778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_008022	CCG	2	6	1923829	1923834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_008022	GGA	2	6	1923881	1923886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_008022	TAT	2	6	1923907	1923912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_008022	GATT	2	8	1923917	1923924	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_008022	T	8	8	1923923	1923930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_008022	A	12	12	1923942	1923953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_008022	T	8	8	1923959	1923966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_008022	GTCAA	2	10	1923979	1923988	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6020	NC_008022	T	6	6	1925104	1925109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_008022	T	6	6	1925154	1925159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_008022	AAAT	2	8	1925162	1925169	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_008022	ATG	2	6	1925199	1925204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_008022	CTG	2	6	1925274	1925279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_008022	A	6	6	1925291	1925296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_008022	T	7	7	1925312	1925318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_008022	T	7	7	1925361	1925367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_008022	TAT	2	6	1925394	1925399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_008022	TAA	2	6	1925401	1925406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_008022	AGTT	2	8	1925416	1925423	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_008022	CT	3	6	1925437	1925442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6032	NC_008022	TGA	2	6	1925518	1925523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_008022	T	7	7	1925564	1925570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_008022	AAT	2	6	1925571	1925576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_008022	AAT	2	6	1925601	1925606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_008022	T	7	7	1925723	1925729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_008022	ACT	2	6	1925985	1925990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_008022	TTA	2	6	1926016	1926021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_008022	AAAAG	2	10	1926025	1926034	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_008022	CTTTT	2	10	1926056	1926065	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6041	NC_008022	T	8	8	1926062	1926069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_008022	GGA	2	6	1926121	1926126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_008022	TTG	2	6	1928223	1928228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_008022	T	6	6	1928237	1928242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_008022	T	6	6	1928244	1928249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.