MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS9429 chromosome

Total Repeats: 698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008021	ATTT	2	8	91	98	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008021	ACTA	2	8	117	124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008021	TTTA	2	8	1633	1640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008021	TAAA	2	8	3130	3137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008021	TTGA	2	8	3420	3427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008021	GAAC	2	8	8754	8761	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008021	TACT	2	8	16548	16555	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008021	GATA	2	8	16665	16672	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008021	AAAT	2	8	16992	16999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008021	ACCT	2	8	17166	17173	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008021	GTGA	2	8	17447	17454	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008021	TAAC	2	8	17530	17537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008021	AGCG	2	8	17618	17625	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008021	TGGT	2	8	18283	18290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008021	AGCC	2	8	18500	18507	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008021	AGCG	2	8	18846	18853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008021	GTAA	2	8	19096	19103	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008021	ACTA	2	8	19138	19145	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008021	GAAG	2	8	19178	19185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008021	GCGA	2	8	19252	19259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008021	ATTC	2	8	20118	20125	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008021	CTAA	2	8	20474	20481	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008021	TAGG	2	8	21129	21136	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008021	TTGG	2	8	21312	21319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008021	AATC	2	8	21321	21328	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008021	AAAT	2	8	22993	23000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008021	ACCT	2	8	23167	23174	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008021	GTGA	2	8	23448	23455	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008021	TAAC	2	8	23531	23538	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008021	AGCG	2	8	23619	23626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008021	TGGT	2	8	24284	24291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008021	AGCC	2	8	24501	24508	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008021	AGCG	2	8	24847	24854	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008021	GTAA	2	8	25097	25104	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008021	ACTA	2	8	25139	25146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008021	GAAG	2	8	25179	25186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008021	GCGA	2	8	25253	25260	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008021	ATTC	2	8	26119	26126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008021	CTAA	2	8	26475	26482	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008021	TAGG	2	8	27130	27137	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008021	TTGG	2	8	27313	27320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008021	AATC	2	8	27322	27329	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008021	GCGT	2	8	29169	29176	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008021	GTTA	2	8	30063	30070	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008021	ATTC	2	8	30538	30545	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008021	ATTA	2	8	33323	33330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008021	GGAA	2	8	36404	36411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008021	AGAA	2	8	40299	40306	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008021	TAGT	2	8	42966	42973	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008021	AAAG	2	8	43720	43727	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008021	AGAA	2	8	48145	48152	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008021	GATT	2	8	55290	55297	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008021	AAAG	2	8	58082	58089	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008021	TATT	2	8	67104	67111	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008021	TAAA	2	8	70767	70774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008021	TTAA	2	8	71007	71014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008021	TATT	2	8	75519	75526	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008021	AAAT	2	8	79604	79611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008021	ACCT	2	8	79778	79785	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008021	GTGA	2	8	80059	80066	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008021	TAAC	2	8	80142	80149	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008021	AGCG	2	8	80230	80237	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008021	TGGT	2	8	80895	80902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008021	AGCC	2	8	81112	81119	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008021	AGCG	2	8	81458	81465	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008021	GTAA	2	8	81708	81715	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008021	ACTA	2	8	81750	81757	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_008021	GAAG	2	8	81790	81797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008021	GCGA	2	8	81864	81871	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008021	ATTC	2	8	82730	82737	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008021	CTAA	2	8	83086	83093	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008021	TAGG	2	8	83741	83748	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008021	TTGG	2	8	83924	83931	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008021	AATC	2	8	83933	83940	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008021	GCGT	2	8	85162	85169	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008021	TGAT	2	8	86503	86510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008021	GTTC	2	8	86515	86522	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008021	AAAT	2	8	86542	86549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008021	CAAT	2	8	86677	86684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008021	CAAT	2	8	97546	97553	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008021	GTTA	2	8	107861	107868	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008021	TAAG	2	8	110323	110330	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008021	TCTT	2	8	117120	117127	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008021	AATC	2	8	119403	119410	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_008021	AAAT	2	8	120505	120512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008021	CTTG	2	8	125843	125850	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008021	TGAT	2	8	125901	125908	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008021	AAAG	2	8	127342	127349	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008021	AAAT	2	8	127390	127397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008021	ATCG	2	8	131067	131074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008021	CTTT	2	8	131949	131956	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008021	GTCA	2	8	137349	137356	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008021	TATC	2	8	138116	138123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008021	TTAG	2	8	145088	145095	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008021	GCTT	2	8	149072	149079	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008021	GAAA	2	8	151343	151350	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008021	CCTG	2	8	151563	151570	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008021	TAGT	2	8	153057	153064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008021	AAAG	2	8	160217	160224	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008021	ATTA	2	8	160262	160269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008021	TAGC	2	8	160330	160337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_008021	AAAT	2	8	161169	161176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008021	AAAT	2	8	161238	161245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008021	GGAT	2	8	170815	170822	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008021	AGTC	2	8	172634	172641	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008021	ATAG	2	8	180216	180223	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008021	CGTG	2	8	180697	180704	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008021	TAAA	2	8	181217	181224	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008021	ATCA	2	8	181341	181348	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008021	ATAA	2	8	181712	181719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008021	TTAG	2	8	186620	186627	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008021	AACT	2	8	187716	187723	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008021	GTTT	2	8	187914	187921	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008021	AATC	2	8	187948	187955	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008021	ATGG	2	8	189415	189422	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008021	ATCA	2	8	192858	192865	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_008021	AAGA	2	8	194176	194183	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008021	CTTC	2	8	197646	197653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008021	TTTA	2	8	197689	197696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008021	AGTA	2	8	198502	198509	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008021	TAGA	2	8	198841	198848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008021	GATT	2	8	202242	202249	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008021	AGGG	2	8	202370	202377	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008021	ATCA	2	8	202620	202627	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008021	AGTG	2	8	204793	204800	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008021	CTTT	2	8	211124	211131	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008021	AGCA	2	8	211148	211155	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008021	GGGA	2	8	212574	212581	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008021	ACCG	2	8	214034	214041	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008021	TAAA	2	8	220961	220968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008021	CAAT	2	8	220996	221003	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008021	TCAA	2	8	221011	221018	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_008021	CAGA	2	8	221074	221081	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008021	TTTG	2	8	221100	221107	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008021	TAGT	2	8	223507	223514	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008021	GTTT	2	8	223552	223559	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008021	TAAA	2	8	228118	228125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008021	ATAG	2	8	228172	228179	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008021	TTTG	2	8	228234	228241	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008021	CAAA	2	8	244053	244060	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_008021	ATTT	2	8	246681	246688	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008021	TAGG	2	8	246766	246773	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008021	AAAG	2	8	257996	258003	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008021	TAAA	2	8	262548	262555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008021	GTCA	2	8	262582	262589	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_008021	AAAT	2	8	271579	271586	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008021	ACCT	2	8	271753	271760	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_008021	GTGA	2	8	272034	272041	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008021	TAAC	2	8	272117	272124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_008021	AGCG	2	8	272205	272212	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_008021	TGGT	2	8	272870	272877	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008021	AGCC	2	8	273087	273094	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_008021	AGCG	2	8	273433	273440	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
154	NC_008021	GTAA	2	8	273683	273690	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_008021	ACTA	2	8	273725	273732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_008021	GAAG	2	8	273765	273772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008021	GCGA	2	8	273839	273846	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
158	NC_008021	ATTC	2	8	274705	274712	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
159	NC_008021	CTAA	2	8	275061	275068	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
160	NC_008021	TAGG	2	8	275716	275723	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_008021	AATC	2	8	275908	275915	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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172	NC_008021	AAAT	2	8	296897	296904	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_008021	TTTC	2	8	297679	297686	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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177	NC_008021	GAAA	2	8	302739	302746	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_008021	TAGT	2	8	314369	314376	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_008021	ATAG	2	8	316669	316676	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
184	NC_008021	TAAG	2	8	325385	325392	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_008021	TGAT	2	8	1115029	1115036	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
452	NC_008021	TCAG	2	8	1117509	1117516	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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470	NC_008021	TGCA	2	8	1173250	1173257	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
471	NC_008021	TAAA	2	8	1176037	1176044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_008021	CTTA	2	8	1183748	1183755	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
473	NC_008021	TAAA	2	8	1191798	1191805	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_008021	ACTT	2	8	1201832	1201839	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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477	NC_008021	CTTT	2	8	1205872	1205879	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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483	NC_008021	TCTT	2	8	1231370	1231377	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
484	NC_008021	AGCA	2	8	1234663	1234670	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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499	NC_008021	AGTT	2	8	1279954	1279961	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
500	NC_008021	GATT	2	8	1281435	1281442	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

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