MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_FPR3757 chromosome

Total Repeats: 662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007793	TGAAC	2	10	7002	7011	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007793	AGGAA	2	10	14369	14378	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007793	GTAGG	2	10	14429	14438	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007793	TCGAT	2	10	23837	23846	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_007793	ATATT	2	10	24375	24384	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007793	TTTCA	2	10	34333	34342	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007793	TAAAA	2	10	35786	35795	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007793	ATGAG	2	10	37660	37669	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007793	TTTGT	2	10	44066	44075	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007793	TATAA	2	10	57952	57961	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007793	ATGTA	2	10	58709	58718	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007793	ACTAT	2	10	61565	61574	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007793	GATTT	2	10	62052	62061	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007793	TTTCA	2	10	62535	62544	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007793	CTTAT	2	10	74537	74546	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_007793	AAATG	2	10	78183	78192	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007793	AATGA	2	10	79699	79708	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007793	TTTTA	2	10	91200	91209	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007793	TAATA	2	10	96747	96756	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007793	GTGTT	2	10	96830	96839	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007793	AGAAA	2	10	103865	103874	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007793	TAAAG	2	10	103906	103915	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007793	ATTCA	2	10	104178	104187	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_007793	GTAAT	2	10	125445	125454	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007793	ATTTT	2	10	148200	148209	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007793	ATTTT	2	10	169787	169796	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007793	GATTT	2	10	169841	169850	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007793	GGGGC	2	10	170063	170072	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
29	NC_007793	TAATT	2	10	177875	177884	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007793	CAAAA	2	10	193508	193517	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007793	AAAGC	2	10	193858	193867	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_007793	CGTTT	2	10	195077	195086	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_007793	TATCA	2	10	203653	203662	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_007793	ATCAT	2	10	211785	211794	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_007793	CAACT	2	10	223916	223925	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_007793	GCTTT	2	10	228428	228437	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007793	TGAAG	2	10	228630	228639	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007793	AAAAT	2	10	228701	228710	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007793	TGATT	2	10	228774	228783	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007793	TAACA	2	10	235000	235009	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_007793	TAATG	2	10	243298	243307	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007793	AATAT	2	10	254181	254190	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007793	TATTT	2	10	260172	260181	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007793	AACAT	2	10	268382	268391	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_007793	GATAA	2	10	272335	272344	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007793	ATAAC	2	10	276982	276991	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_007793	TGAAT	2	10	277093	277102	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007793	ATTAA	2	10	277234	277243	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007793	AAAGT	2	10	280978	280987	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007793	TAAAA	2	10	282691	282700	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007793	AAATT	2	10	284007	284016	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007793	TAAAA	2	10	298154	298163	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007793	GAAAA	2	10	305945	305954	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007793	ATAAA	2	10	306063	306072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007793	TCATA	2	10	314472	314481	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_007793	ATTTA	2	10	330297	330306	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007793	AAATG	2	10	347683	347692	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007793	TAAAT	2	10	365111	365120	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007793	AAATT	2	10	368804	368813	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007793	ATTTT	2	10	370669	370678	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007793	ATAGA	2	10	376906	376915	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007793	TGACA	2	10	377098	377107	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_007793	GATAA	2	10	389401	389410	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007793	GTAAT	2	10	424207	424216	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007793	AGATA	2	10	425192	425201	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007793	AGAAT	2	10	425433	425442	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007793	TAAGG	2	10	425497	425506	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007793	TAAAT	2	10	432942	432951	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007793	ACAGT	2	10	435515	435524	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_007793	CATAA	2	10	445992	446001	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_007793	TAAAA	2	10	446216	446225	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007793	AATAT	2	10	448361	448370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007793	AAAGT	2	10	460318	460327	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007793	AAATT	2	10	463507	463516	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007793	GTATT	2	10	465488	465497	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007793	TTAAA	2	10	468519	468528	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007793	CTCAC	2	10	476562	476571	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
78	NC_007793	CAAAG	2	10	476587	476596	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_007793	TTGTA	2	10	484588	484597	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007793	ATTAT	2	10	484755	484764	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007793	CTTAA	2	10	494296	494305	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_007793	TGGTG	2	10	512113	512122	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007793	CAACT	2	10	512678	512687	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_007793	GGTAA	2	10	513151	513160	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007793	TCGTG	2	10	513970	513979	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_007793	GATTG	2	10	516304	516313	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007793	GATTT	2	10	521215	521224	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007793	ATATA	2	10	523633	523642	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007793	CAAAG	2	10	530182	530191	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_007793	TTGAT	2	10	533343	533352	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007793	AGACA	2	10	547304	547313	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_007793	AAGTA	2	10	549739	549748	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007793	TTAAA	2	10	551863	551872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007793	GATAA	2	10	551902	551911	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007793	GGTAA	2	10	556782	556791	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007793	TCGTG	2	10	557601	557610	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_007793	GATTG	2	10	559907	559916	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007793	ATATA	2	10	566523	566532	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007793	AAAAT	2	10	571298	571307	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007793	TTTAT	2	10	571407	571416	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007793	TTATG	2	10	574413	574422	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007793	ATTTA	2	10	574558	574567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007793	TGAAT	2	10	580830	580839	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007793	GTATA	2	10	580887	580896	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007793	TATAA	2	10	584604	584613	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007793	GTTTA	2	10	600771	600780	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007793	TAAAG	2	10	604966	604975	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007793	GAAGC	2	10	606321	606330	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_007793	ATATT	2	10	611102	611111	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007793	TTAAC	2	10	613996	614005	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_007793	AATTT	2	10	614081	614090	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007793	ATAAA	2	10	622430	622439	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007793	TAAAA	2	10	636374	636383	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007793	TTATA	2	10	636807	636816	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007793	CACAT	2	10	637203	637212	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_007793	ATGAT	2	10	646227	646236	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007793	TAATT	2	10	649714	649723	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007793	TAAGT	2	10	654699	654708	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007793	TATTG	2	10	656159	656168	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007793	ATTAT	2	10	656980	656989	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007793	AGTTC	2	10	658707	658716	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_007793	TTTAA	2	10	659256	659265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007793	AAATT	2	10	662500	662509	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007793	TAAAT	2	10	665093	665102	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007793	AAATT	2	10	667097	667106	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007793	TAAAA	2	10	674235	674244	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007793	ATTAA	2	10	676423	676432	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007793	TTATT	2	10	676472	676481	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007793	CAATA	2	10	676538	676547	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_007793	TTAAT	2	10	679163	679172	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007793	ATTTT	2	10	681450	681459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007793	ATATA	2	10	681506	681515	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007793	ATAAA	2	10	688142	688151	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007793	TTTTA	2	10	690408	690417	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007793	AAAGG	2	10	690729	690738	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007793	ATATA	2	10	694099	694108	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007793	AAACT	2	10	697624	697633	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_007793	TTCAC	2	10	702837	702846	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_007793	TTTGT	2	10	706745	706754	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007793	AATGA	2	10	706818	706827	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007793	GGTTG	2	10	713820	713829	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007793	AGTAG	2	10	723528	723537	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007793	AAGTT	2	10	723977	723986	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007793	AATTG	2	10	724009	724018	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007793	AAACT	2	10	725884	725893	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_007793	ATTTA	2	10	726275	726284	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007793	AAAGT	2	10	728523	728532	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007793	AATTT	2	10	731131	731140	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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