MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_FPR3757 plasmid pUSA03

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007792	TCA	2	6	37	42	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007792	TCT	2	6	1171	1176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007792	CTA	2	6	2005	2010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007792	AGT	2	6	2025	2030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007792	TAT	2	6	2034	2039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007792	AGG	2	6	2146	2151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007792	TAG	2	6	5258	5263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007792	TCT	2	6	5726	5731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007792	AGA	2	6	6508	6513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007792	GAT	2	6	6545	6550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007792	CAT	2	6	7358	7363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007792	AAT	2	6	7748	7753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007792	TCA	2	6	7787	7792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007792	AGG	2	6	7839	7844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007792	CTT	2	6	8684	8689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007792	AGC	2	6	8729	8734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007792	TCT	2	6	8888	8893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007792	CCT	2	6	9878	9883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_007792	ACA	2	6	11350	11355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007792	AGG	2	6	19518	19523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007792	GGT	2	6	21702	21707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007792	TCT	2	6	23291	23296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007792	AAC	2	6	24070	24075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007792	AAT	2	6	24083	24088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007792	AGG	2	6	24091	24096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007792	AAT	2	6	26058	26063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007792	TAT	2	6	26580	26585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007792	TAT	2	6	26664	26669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007792	ATA	2	6	26705	26710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007792	TAC	2	6	27452	27457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007792	AGG	2	6	27598	27603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007792	AGA	2	6	30272	30277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007792	GTA	2	6	30374	30379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007792	AAG	2	6	32107	32112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007792	CTT	2	6	32123	32128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007792	TGA	2	6	32213	32218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007792	TTA	2	6	32289	32294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007792	TTG	2	6	32305	32310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007792	ATT	2	6	32323	32328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007792	CTA	2	6	32343	32348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007792	AAT	2	6	32474	32479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007792	TTA	2	6	32522	32527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007792	AAC	2	6	32549	32554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007792	TCA	2	6	32585	32590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007792	GTT	2	6	32673	32678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007792	TCA	2	6	32720	32725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007792	AAT	2	6	32732	32737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007792	CAT	2	6	32751	32756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007792	AAT	2	6	32757	32762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007792	TAA	2	6	32810	32815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007792	CAT	2	6	32862	32867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007792	ATT	2	6	33031	33036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007792	CAT	2	6	33090	33095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007792	AAT	2	6	34660	34665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007792	AGT	2	6	34690	34695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007792	AGG	2	6	34711	34716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007792	TAT	2	6	34720	34725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007792	TAT	2	6	34731	34736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007792	TAT	2	6	34795	34800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007792	TTC	2	6	34860	34865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007792	TAT	2	6	34903	34908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007792	TAA	2	6	34993	34998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007792	AAG	2	6	35021	35026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007792	GTT	2	6	35051	35056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007792	TTA	2	6	35169	35174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007792	ATA	2	6	35199	35204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007792	CAA	2	6	36950	36955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007792	GTT	2	6	37022	37027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007792	ATA	2	6	37047	37052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007792	TAT	2	6	37087	37092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007792	CAA	2	6	37125	37130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.