MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Salinibacter ruber DSM 13855 chromosome

Total Repeats: 588

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007677	AAAAT	2	10	15852	15861	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007677	TCGCT	2	10	18490	18499	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_007677	CCCAT	2	10	36621	36630	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_007677	GCCTT	2	10	40927	40936	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_007677	CAAAA	2	10	49357	49366	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_007677	CGGCG	2	10	49491	49500	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_007677	GCGCC	2	10	50238	50247	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_007677	CGCCC	2	10	54088	54097	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
9	NC_007677	GTGCG	2	10	54907	54916	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_007677	GGCCG	2	10	55807	55816	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11	NC_007677	CGCGC	2	10	56030	56039	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_007677	CCGGG	2	10	56591	56600	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_007677	GGGGC	2	10	61401	61410	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007677	GGGTC	2	10	71255	71264	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007677	GCCCC	2	10	71454	71463	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
16	NC_007677	ACGGG	2	10	75101	75110	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_007677	GTATA	2	10	79443	79452	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007677	GAAGG	2	10	81146	81155	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007677	GAATT	2	10	81578	81587	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007677	GCTCC	2	10	82542	82551	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_007677	GGGGC	2	10	88295	88304	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
22	NC_007677	GCGCC	2	10	92394	92403	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_007677	CGGTG	2	10	95734	95743	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_007677	GCAAA	2	10	96135	96144	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_007677	CGGCA	2	10	97892	97901	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_007677	CCCGC	2	10	104831	104840	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
27	NC_007677	GCCGA	2	10	104934	104943	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_007677	TGCGG	2	10	109309	109318	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_007677	CCCGG	2	10	113881	113890	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_007677	CGGAG	2	10	124487	124496	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007677	CTTTC	2	10	124632	124641	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_007677	GCGTC	2	10	140154	140163	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_007677	ACTGG	2	10	144027	144036	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_007677	ACGCG	2	10	146666	146675	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_007677	CTGGT	2	10	149918	149927	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_007677	CGTCT	2	10	153112	153121	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_007677	CCGTC	2	10	155700	155709	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_007677	CCGGG	2	10	155836	155845	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
39	NC_007677	GCCCC	2	10	156140	156149	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
40	NC_007677	TTCCG	2	10	156415	156424	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_007677	ACAGA	2	10	156835	156844	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_007677	CGCAG	2	10	161074	161083	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_007677	ATTGA	2	10	162619	162628	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007677	CCTCC	2	10	164803	164812	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
45	NC_007677	CGGGG	2	10	168838	168847	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
46	NC_007677	CGTGG	2	10	173052	173061	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_007677	GGTGC	2	10	173067	173076	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_007677	GGAGC	2	10	173627	173636	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_007677	TCCAC	2	10	179990	179999	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
50	NC_007677	TGGCC	2	10	180283	180292	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_007677	ACTCT	2	10	183016	183025	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_007677	CCGGC	2	10	187781	187790	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
53	NC_007677	AGTCC	2	10	188099	188108	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_007677	GTCCG	2	10	191363	191372	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_007677	ACGGT	2	10	192598	192607	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_007677	AGCGC	2	10	201362	201371	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_007677	CTCCA	2	10	211197	211206	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
58	NC_007677	CGCAG	2	10	211295	211304	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_007677	GGTCG	2	10	212139	212148	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_007677	CCCGC	2	10	212753	212762	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
61	NC_007677	CCGGC	2	10	213127	213136	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
62	NC_007677	CGGGG	2	10	214473	214482	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
63	NC_007677	ACCGG	2	10	216324	216333	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_007677	CTGCC	2	10	220278	220287	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
65	NC_007677	ACGGC	2	10	222726	222735	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_007677	CTCGT	2	10	223378	223387	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_007677	AGCCA	2	10	231518	231527	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_007677	TGTTT	2	10	231719	231728	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007677	AGAAA	2	10	235291	235300	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007677	GCCAG	2	10	235781	235790	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_007677	GGGGC	2	10	236927	236936	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
72	NC_007677	TATAG	2	10	241361	241370	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007677	TGGCG	2	10	244672	244681	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_007677	ACCGA	2	10	244740	244749	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_007677	GAATG	2	10	248980	248989	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007677	TGTCG	2	10	251943	251952	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007677	CTGCG	2	10	258825	258834	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_007677	TGGGC	2	10	274001	274010	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
79	NC_007677	GTCCC	2	10	285637	285646	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_007677	TCGAG	2	10	286316	286325	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_007677	GCGTG	2	10	288720	288729	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_007677	CATGC	2	10	289651	289660	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_007677	ATGAA	2	10	290498	290507	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007677	CGCAG	2	10	291248	291257	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_007677	CGCGA	2	10	292168	292177	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_007677	CGCAG	2	10	295953	295962	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_007677	GGAAT	2	10	298961	298970	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007677	GGCTC	2	10	301966	301975	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_007677	GCGAG	2	10	302513	302522	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
90	NC_007677	TTCTC	2	10	302957	302966	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_007677	TCGGC	2	10	303036	303045	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_007677	CGGAA	2	10	303374	303383	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_007677	TCCGC	2	10	306635	306644	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
94	NC_007677	GGTCG	2	10	306917	306926	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_007677	GCCCG	2	10	307809	307818	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
96	NC_007677	TGTCA	2	10	310943	310952	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_007677	AGCTC	2	10	310996	311005	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_007677	GGGCT	2	10	311884	311893	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_007677	CACGG	2	10	313226	313235	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_007677	GATTT	2	10	324349	324358	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007677	CGGCC	2	10	327745	327754	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
102	NC_007677	GAGAA	2	10	328514	328523	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007677	ACCGG	2	10	329458	329467	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_007677	CGATG	2	10	330516	330525	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_007677	GGGGA	2	10	343117	343126	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007677	AGTGC	2	10	346663	346672	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_007677	GGCAA	2	10	352687	352696	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_007677	AAGAA	2	10	352833	352842	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007677	GCCGG	2	10	355950	355959	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
110	NC_007677	GAGGG	2	10	358360	358369	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007677	TAATA	2	10	364766	364775	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007677	CCCCG	2	10	371722	371731	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
113	NC_007677	GACGG	2	10	397413	397422	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
114	NC_007677	GCGCC	2	10	398001	398010	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
115	NC_007677	GCGTC	2	10	402561	402570	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_007677	GCCTC	2	10	406759	406768	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
117	NC_007677	GCCGA	2	10	408893	408902	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_007677	ACGGC	2	10	413947	413956	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_007677	GCCGT	2	10	419387	419396	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_007677	CGAGG	2	10	424527	424536	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_007677	CGAGG	2	10	437204	437213	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_007677	TCCCG	2	10	455349	455358	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
123	NC_007677	GCCCC	2	10	458189	458198	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
124	NC_007677	GGCCG	2	10	465031	465040	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
125	NC_007677	ACCCC	2	10	467849	467858	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
126	NC_007677	GGTAT	2	10	482720	482729	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007677	GCCCC	2	10	510777	510786	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
128	NC_007677	GGGCG	2	10	528912	528921	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
129	NC_007677	TTTCG	2	10	542120	542129	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_007677	CGTCT	2	10	560219	560228	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_007677	CGCGC	2	10	573640	573649	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
132	NC_007677	TGCCT	2	10	580849	580858	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_007677	GAGGT	2	10	599935	599944	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007677	GCGAG	2	10	604413	604422	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
135	NC_007677	ACTCG	2	10	609963	609972	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_007677	CACGC	2	10	614514	614523	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
137	NC_007677	CGAGG	2	10	627098	627107	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
138	NC_007677	TCTTT	2	10	636845	636854	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_007677	TGGGA	2	10	653972	653981	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007677	TCTGC	2	10	658218	658227	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_007677	GGCCG	2	10	658666	658675	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
142	NC_007677	GGTCG	2	10	659496	659505	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
143	NC_007677	GGCCC	2	10	684217	684226	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
144	NC_007677	CGGGG	2	10	687748	687757	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
145	NC_007677	CCGAG	2	10	710678	710687	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_007677	CCTGC	2	10	713053	713062	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
147	NC_007677	TGCGG	2	10	724715	724724	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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162	NC_007677	TCCGG	2	10	827179	827188	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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185	NC_007677	GAGGG	2	10	921227	921236	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
186	NC_007677	GGGAC	2	10	921273	921282	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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264	NC_007677	TGGGC	2	10	1366052	1366061	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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271	NC_007677	GAGAC	2	10	1388743	1388752	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
272	NC_007677	CAAAA	2	10	1391318	1391327	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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275	NC_007677	TCCAT	2	10	1397163	1397172	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
276	NC_007677	TGAAG	2	10	1397618	1397627	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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