MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus RF122

Total Repeats: 264

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007622	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007622	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007622	TAAATC	2	12	17148	17159	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_007622	GTGGGA	2	12	24592	24603	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007622	CTTTTA	2	12	35935	35946	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_007622	ATTTAT	2	12	38721	38732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007622	AATATA	2	12	56132	56143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007622	TTTTTC	2	12	66986	66997	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_007622	TTAAAT	2	12	67081	67092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007622	CATGAA	2	12	83179	83190	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_007622	AATGTA	2	12	92574	92585	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007622	ATTAAT	2	12	132357	132368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007622	TTTATA	2	12	155311	155322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007622	ATTAAT	2	12	155334	155345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007622	TCCTGA	2	12	179689	179700	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007622	AAATTT	2	12	186694	186705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007622	AGTGGA	2	12	221340	221351	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007622	TGGTAT	2	12	232924	232935	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007622	ATATAG	2	12	242572	242583	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007622	ATTTTC	2	12	247889	247900	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_007622	ATAATT	2	12	248839	248850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007622	AACGAT	2	12	256241	256252	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_007622	ATAAGT	2	12	272396	272407	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007622	AAGGTA	2	12	323059	323070	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007622	ATATGA	2	12	325579	325590	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007622	TAAAGA	2	12	374086	374097	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007622	TAAAAT	2	12	401344	401355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007622	AATTAT	2	12	402100	402111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007622	GATTTT	2	12	404809	404820	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007622	TTTTTA	2	12	407542	407553	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007622	TTGAAA	2	12	413413	413424	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007622	TTTAAT	2	12	417151	417162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007622	AAATTA	2	12	422142	422153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007622	TGTATA	2	12	426438	426449	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007622	TTTTTA	2	12	437824	437835	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007622	AAAATG	2	12	443256	443267	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007622	ACGTTG	2	12	463663	463674	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_007622	AAAATA	2	12	464390	464401	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007622	TTATAA	2	12	483524	483535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007622	AAATTT	2	12	490283	490294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007622	AATTTT	2	12	524448	524459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007622	CAGTAG	2	12	546910	546921	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007622	TTATAA	2	12	547299	547310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007622	GTTATA	2	12	547970	547981	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007622	CTTAAA	2	12	556402	556413	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_007622	ACATGT	2	12	566373	566384	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_007622	TTAAAA	2	12	574386	574397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007622	ATTTAA	2	12	574439	574450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007622	GACTCA	2	12	575924	575935	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007622	TCAGAC	2	12	575981	575992	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007622	TCAGAC	2	12	576041	576052	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007622	GATTCA	2	12	576056	576067	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_007622	TCAGAC	2	12	576077	576088	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007622	GATTCA	2	12	576182	576193	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_007622	GACTCA	2	12	576200	576211	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007622	TCAGAT	2	12	576239	576250	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_007622	GATTCA	2	12	576272	576283	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_007622	GATTCA	2	12	576308	576319	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_007622	GACTCA	2	12	576326	576337	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007622	GACTCA	2	12	576380	576391	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007622	GATTCA	2	12	576398	576409	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_007622	GACTCA	2	12	576416	576427	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007622	GACTCA	2	12	576470	576481	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007622	AAAGCA	2	12	576539	576550	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_007622	TAAAAT	2	12	610457	610468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007622	TTTTAA	2	12	618124	618135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007622	TCAAAA	2	12	625945	625956	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_007622	CATTAT	2	12	635629	635640	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_007622	CATCAA	2	12	646027	646038	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007622	TAATTT	2	12	650267	650278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007622	TGAATA	2	12	666739	666750	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007622	GGATTC	2	12	678089	678100	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_007622	ATTAGG	2	12	692719	692730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007622	TTAAAA	2	12	692750	692761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007622	TAGTTA	2	12	697178	697189	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007622	TAATTA	2	12	707984	707995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007622	TTTTTA	2	12	715378	715389	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007622	TGAAAA	2	12	723620	723631	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007622	AATGAT	2	12	752060	752071	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007622	TAAAAA	2	12	816123	816134	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007622	TTAATA	2	12	817660	817671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007622	TATCAA	2	12	822532	822543	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_007622	ATATAA	2	12	823904	823915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007622	TTTTGA	2	12	826338	826349	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007622	TCATTT	2	12	832332	832343	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_007622	TAAAAA	2	12	835418	835429	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007622	AGTGAA	2	12	837030	837041	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007622	AAATTA	2	12	842482	842493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007622	GGTTTT	2	12	848701	848712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007622	TATTTT	2	12	849302	849313	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007622	TAAAAT	2	12	864060	864071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007622	TTGTAA	2	12	896070	896081	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007622	TCAAAA	2	12	924015	924026	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_007622	TTTAAT	2	12	937498	937509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007622	AACGGA	2	12	969428	969439	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_007622	AAAAGC	2	12	974027	974038	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_007622	CATTTA	2	12	1000172	1000183	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_007622	ATCATA	2	12	1002076	1002087	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_007622	TCAAAA	2	12	1008582	1008593	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_007622	TATGTA	2	12	1022272	1022283	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007622	TTTTCT	2	12	1022367	1022378	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_007622	TTTATA	2	12	1058073	1058084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007622	ATTTTT	2	12	1081975	1081986	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007622	ATAATT	2	12	1082772	1082783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007622	TCATTA	2	12	1087863	1087874	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_007622	TAATGA	2	12	1095954	1095965	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007622	ATTTAT	2	12	1114868	1114879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007622	ATTATA	2	12	1118794	1118805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007622	AAATTT	2	12	1119603	1119614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007622	AAGTAA	2	12	1141300	1141311	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007622	TTAATT	2	12	1155555	1155566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007622	TCAAAA	2	12	1156398	1156409	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_007622	AATTAA	2	12	1158491	1158502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007622	TGATTT	2	12	1163457	1163468	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007622	TCATAT	2	12	1164363	1164374	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_007622	ATTTTT	2	12	1194236	1194247	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007622	AATGAT	2	12	1213787	1213798	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007622	TAAAGA	2	12	1228265	1228276	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007622	TTTCAT	2	12	1244074	1244085	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_007622	TATATT	2	12	1248979	1248990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007622	TCAAAA	2	12	1270100	1270111	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_007622	ATGTAT	2	12	1276189	1276200	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007622	AAAGAA	2	12	1276420	1276431	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007622	TCAAAA	2	12	1302105	1302116	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_007622	GGTGTT	2	12	1302683	1302694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007622	ATTAAA	2	12	1307210	1307221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007622	ATATAA	2	12	1314890	1314901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007622	GTTTTA	2	12	1344704	1344715	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007622	TAAAAT	2	12	1360645	1360656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007622	TATCTT	2	12	1382454	1382465	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_007622	TTGATT	2	12	1382517	1382528	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007622	ATTCTA	2	12	1390161	1390172	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_007622	AATAAA	2	12	1393012	1393023	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_007622	CGTTGA	2	12	2685373	2685384	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
252	NC_007622	TGTTGA	2	12	2685667	2685678	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
253	NC_007622	TACAGT	2	12	2686621	2686632	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
254	NC_007622	TTGAAG	2	12	2687795	2687806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
255	NC_007622	TGTTGA	2	12	2688000	2688011	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
256	NC_007622	ATTTCT	2	12	2688250	2688261	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
257	NC_007622	CAGTTA	2	12	2704245	2704256	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
258	NC_007622	ATGGAT	2	12	2708208	2708219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_007622	AATTTT	2	12	2713073	2713084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_007622	CTATTT	2	12	2713622	2713633	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
261	NC_007622	ATTCGA	2	12	2717954	2717965	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
262	NC_007622	AACTAA	2	12	2718810	2718821	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
263	NC_007622	GATTTT	2	12	2733703	2733714	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
264	NC_007622	ATATAA	2	12	2736532	2736543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.