MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 17463

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007613	TGC	2	6	1067794	1067799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_007613	ATTA	2	8	1067803	1067810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_007613	TGCG	2	8	1067820	1067827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4004	NC_007613	CGGG	2	8	1067839	1067846	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4005	NC_007613	GGT	2	6	1067849	1067854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_007613	GAG	2	6	1067855	1067860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_007613	TG	3	6	1067864	1067869	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_007613	ACG	2	6	1067963	1067968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_007613	AGC	2	6	1067999	1068004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_007613	AAC	2	6	1068030	1068035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_007613	GCGA	2	8	1068098	1068105	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4012	NC_007613	GAT	2	6	1068953	1068958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_007613	AAT	2	6	1068974	1068979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_007613	GAT	2	6	1068984	1068989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_007613	CCA	2	6	1069020	1069025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_007613	TCAT	2	8	1069068	1069075	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4017	NC_007613	A	7	7	1069100	1069106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_007613	TGA	2	6	1069119	1069124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_007613	T	6	6	1069152	1069157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_007613	CTT	2	6	1069163	1069168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_007613	T	7	7	1069208	1069214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_007613	CGC	2	6	1069366	1069371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_007613	CAG	2	6	1069372	1069377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_007613	CATCGA	2	12	1069380	1069391	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_007613	TCA	2	6	1069437	1069442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_007613	TGT	2	6	1069465	1069470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_007613	GCC	2	6	1069472	1069477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_007613	CG	4	8	1069534	1069541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_007613	AGG	2	6	1069591	1069596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_007613	TGG	2	6	1069808	1069813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_007613	ACC	2	6	1069817	1069822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_007613	CTCA	2	8	1070467	1070474	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_007613	TCA	2	6	1070508	1070513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_007613	AAC	2	6	1070525	1070530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_007613	TGAG	2	8	1070638	1070645	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_007613	CGC	2	6	1070662	1070667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_007613	TAT	2	6	1070695	1070700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_007613	CT	3	6	1071812	1071817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4039	NC_007613	GCCA	2	8	1071857	1071864	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4040	NC_007613	CCA	2	6	1071866	1071871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4041	NC_007613	TGG	2	6	1071905	1071910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_007613	G	6	6	1071912	1071917	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_007613	CAT	3	9	1071920	1071928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_007613	A	6	6	1071972	1071977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_007613	AAC	2	6	1072104	1072109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_007613	GCA	2	6	1072135	1072140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4048	NC_007613	ATA	2	6	1072251	1072256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_007613	A	6	6	1072256	1072261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_007613	ATG	3	9	1072347	1072355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_007613	TCA	3	9	1072369	1072377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_007613	TGA	2	6	1072408	1072413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_007613	GGCT	2	8	1072464	1072471	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4054	NC_007613	CCAG	2	8	1072510	1072517	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4055	NC_007613	ACG	2	6	1072544	1072549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4057	NC_007613	CGC	2	6	1074925	1074930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_007613	TCG	2	6	1074978	1074983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_007613	TGT	2	6	1075029	1075034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_007613	CTG	3	9	1075046	1075054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_007613	GCT	2	6	1075137	1075142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_007613	GCGCG	2	10	1075147	1075156	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4063	NC_007613	ATC	2	6	1075199	1075204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_007613	TTG	2	6	1075265	1075270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_007613	TTG	2	6	1075310	1075315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_007613	GCG	2	6	1075353	1075358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_007613	GGC	2	6	1075403	1075408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_007613	TGA	2	6	1075432	1075437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_007613	CAT	2	6	1075501	1075506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_007613	GCTGT	2	10	1075510	1075519	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4071	NC_007613	TTCA	2	8	1075661	1075668	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4072	NC_007613	ATC	2	6	1075670	1075675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4075	NC_007613	TCG	2	6	1075760	1075765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_007613	TGA	2	6	1075767	1075772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4084	NC_007613	CGG	2	6	1076001	1076006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4089	NC_007613	CG	3	6	1076704	1076709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4093	NC_007613	GGC	2	6	1077111	1077116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_007613	AGGAG	2	10	1077130	1077139	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_007613	CCG	2	6	1077146	1077151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4102	NC_007613	CG	3	6	1077581	1077586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_007613	TCC	2	6	1077608	1077613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4104	NC_007613	CA	3	6	1077700	1077705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4105	NC_007613	TGC	2	6	1077873	1077878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_007613	CGG	2	6	1077935	1077940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_007613	GCC	2	6	1077951	1077956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_007613	GCCA	2	8	1077986	1077993	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4109	NC_007613	ATC	2	6	1078020	1078025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4111	NC_007613	TGC	2	6	1078087	1078092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_007613	AAC	2	6	1078093	1078098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_007613	TGA	2	6	1078112	1078117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_007613	TGC	2	6	1078161	1078166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_007613	AAC	2	6	1078255	1078260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_007613	A	7	7	1078276	1078282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_007613	GTT	2	6	1078324	1078329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4119	NC_007613	AAC	2	6	1078403	1078408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4121	NC_007613	A	6	6	1078524	1078529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_007613	TGC	2	6	1079498	1079503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4125	NC_007613	TGC	2	6	1079669	1079674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4262	NC_007613	TG	3	6	1108393	1108398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_007613	GATT	2	8	1108415	1108422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4267	NC_007613	TGA	2	6	1108614	1108619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4274	NC_007613	TTG	2	6	1109782	1109787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4374	NC_007613	TGCT	2	8	1119124	1119131	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4375	NC_007613	CAAAA	2	10	1119170	1119179	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4382	NC_007613	CAG	2	6	1120440	1120445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4386	NC_007613	CG	3	6	1120482	1120487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4387	NC_007613	GAC	2	6	1120497	1120502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4388	NC_007613	GAT	2	6	1120533	1120538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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