MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 plasmid pSB4_227

Total Repeats: 374

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007608	TGA	2	6	5	10	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007608	TTG	2	6	773	778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007608	AGC	2	6	2123	2128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007608	TCA	2	6	2141	2146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007608	GAT	2	6	2263	2268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007608	TAT	2	6	2297	2302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007608	AAT	2	6	2347	2352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007608	AAG	2	6	2433	2438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007608	ATG	2	6	2474	2479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007608	TAG	2	6	3437	3442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007608	ATC	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007608	ATA	2	6	3480	3485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007608	CAT	2	6	3521	3526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007608	TAC	2	6	3532	3537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007608	ATT	2	6	3538	3543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007608	TTA	2	6	3567	3572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007608	ATC	2	6	3675	3680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007608	AGG	2	6	4509	4514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007608	CAC	2	6	4527	4532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_007608	TTA	2	6	4603	4608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007608	TGC	2	6	4609	4614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007608	GAT	2	6	4625	4630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007608	CAC	2	6	4688	4693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_007608	ATT	2	6	4945	4950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007608	CAC	2	6	5630	5635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_007608	CAT	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007608	GCA	2	6	5728	5733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007608	TAA	3	9	5769	5777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007608	GAA	2	6	5801	5806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007608	TAT	2	6	5824	5829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007608	ATG	2	6	5880	5885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007608	GCT	2	6	5969	5974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007608	AGA	3	9	6040	6048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007608	TTG	2	6	6086	6091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007608	CAA	2	6	6116	6121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007608	ATT	2	6	7465	7470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007608	TAT	2	6	7586	7591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007608	TGT	2	6	7615	7620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007608	CCT	2	6	7658	7663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_007608	ATT	2	6	7676	7681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007608	TAT	2	6	7689	7694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007608	CAT	2	6	7787	7792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007608	AAT	2	6	7803	7808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007608	CAA	2	6	7841	7846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007608	TCC	2	6	8258	8263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_007608	CCG	2	6	8299	8304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_007608	TTG	2	6	8774	8779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007608	GGA	3	9	9314	9322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007608	GAC	2	6	9336	9341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007608	CGG	2	6	9364	9369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007608	CTC	2	6	9375	9380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_007608	TTG	2	6	9733	9738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007608	AGA	2	6	11496	11501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007608	CCT	2	6	11554	11559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_007608	AGG	2	6	11564	11569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007608	GAT	2	6	11619	11624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007608	GTG	2	6	11768	11773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007608	CAG	2	6	11804	11809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007608	GGT	2	6	11905	11910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007608	TCT	2	6	11921	11926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007608	ATC	2	6	12695	12700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007608	TCT	2	6	12746	12751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007608	TGG	2	6	12759	12764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007608	TGA	2	6	13519	13524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007608	ATC	2	6	13538	13543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007608	ACC	3	9	13563	13571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_007608	CTG	2	6	13624	13629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007608	TTG	2	6	13653	13658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007608	GCA	2	6	14374	14379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007608	ACT	2	6	14441	14446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007608	CTG	2	6	14450	14455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007608	CCG	2	6	14537	14542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_007608	TGA	2	6	14593	14598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007608	CCT	2	6	14611	14616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_007608	CCA	2	6	14704	14709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_007608	TCA	3	9	14712	14720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007608	AGC	2	6	14806	14811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007608	ATG	2	6	14890	14895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007608	GAA	2	6	14961	14966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007608	ATC	2	6	14991	14996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007608	CAC	2	6	15115	15120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_007608	CAT	2	6	15144	15149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007608	CTT	2	6	15842	15847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007608	TCC	2	6	15881	15886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_007608	AAT	2	6	15898	15903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007608	CAT	2	6	15907	15912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007608	CGG	2	6	17643	17648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007608	GAA	2	6	18639	18644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007608	CGT	2	6	19029	19034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007608	TAT	2	6	19967	19972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007608	CAT	2	6	20012	20017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007608	CAC	2	6	20018	20023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_007608	TAG	2	6	20075	20080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007608	TTC	2	6	20089	20094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007608	ATT	2	6	20136	20141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007608	TAA	2	6	20313	20318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007608	CTG	2	6	20658	20663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007608	ATC	2	6	20704	20709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007608	GCA	2	6	20865	20870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007608	GCT	2	6	20917	20922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007608	TTA	2	6	20923	20928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007608	ATT	2	6	20999	21004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007608	TAC	2	6	21960	21965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007608	CAT	2	6	22122	22127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007608	GAC	2	6	22224	22229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007608	CAT	2	6	22741	22746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007608	CAT	2	6	22859	22864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007608	AAT	2	6	22920	22925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007608	TTG	2	6	23630	23635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007608	AAC	2	6	23872	23877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007608	GCT	2	6	23947	23952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007608	GTA	2	6	24012	24017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007608	TGT	2	6	24684	24689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007608	TCC	2	6	24709	24714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_007608	TCT	2	6	24767	24772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007608	ATA	2	6	24813	24818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007608	CAC	2	6	25507	25512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_007608	CAT	2	6	25580	25585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007608	GCA	2	6	25605	25610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007608	CGG	2	6	25988	25993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007608	GCA	2	6	26067	26072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007608	CAA	2	6	26078	26083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007608	CTG	2	6	27467	27472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007608	CAT	2	6	27563	27568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007608	GAA	2	6	27610	27615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007608	GTT	2	6	27675	27680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007608	TGG	2	6	29135	29140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007608	GAT	2	6	29710	29715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007608	TAA	2	6	29716	29721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007608	TAA	2	6	29802	29807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007608	TTA	2	6	32082	32087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007608	TCT	2	6	32137	32142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007608	ATG	2	6	32232	32237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007608	ACA	2	6	32923	32928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007608	CCG	2	6	32929	32934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_007608	GCT	2	6	32997	33002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007608	TGT	2	6	34432	34437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007608	GGC	2	6	34494	34499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007608	GCA	2	6	34513	34518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_007608	GTC	2	6	34558	34563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_007608	GCG	2	6	34578	34583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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145	NC_007608	CAT	2	6	35872	35877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.