MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 plasmid pSB4_227

Total Repeats: 649

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007608	TAA	2	6	92409	92414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_007608	A	6	6	92413	92418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_007608	TTCAT	2	10	92428	92437	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
504	NC_007608	CGG	2	6	94231	94236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_007608	CTC	2	6	94242	94247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_007608	CAA	2	6	94257	94262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_007608	GCC	2	6	94269	94274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_007608	TA	3	6	94322	94327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_007608	TA	3	6	94333	94338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_007608	CAGGA	2	10	94660	94669	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
511	NC_007608	GTA	2	6	94679	94684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_007608	GCC	2	6	94707	94712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_007608	CAGC	2	8	94741	94748	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
514	NC_007608	GGCAG	2	10	94754	94763	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
515	NC_007608	GGAA	2	8	94790	94797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_007608	CA	3	6	94807	94812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
517	NC_007608	TG	3	6	94834	94839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
518	NC_007608	CAC	2	6	95507	95512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_007608	AGGA	2	8	95530	95537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_007608	ATGGAA	2	12	95544	95555	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_007608	CAT	2	6	95580	95585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_007608	GCA	2	6	95605	95610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_007608	T	6	6	95645	95650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_007608	CGT	2	6	95715	95720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_007608	A	6	6	95723	95728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_007608	AAC	2	6	95760	95765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_007608	C	6	6	95779	95784	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
528	NC_007608	GGTGG	2	10	95836	95845	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
529	NC_007608	ATG	2	6	95897	95902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_007608	TAAA	2	8	95947	95954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_007608	T	7	7	95972	95978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_007608	TGT	2	6	95993	95998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_007608	ATA	2	6	96086	96091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_007608	TTG	2	6	96108	96113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_007608	AT	3	6	96131	96136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_007608	GTT	2	6	100172	100177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_007608	GT	3	6	100214	100219	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_007608	GGA	2	6	100234	100239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_007608	ATTTA	2	10	100262	100271	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_007608	GCG	2	6	100928	100933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_007608	CAC	2	6	101629	101634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_007608	AGGA	2	8	101652	101659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_007608	ATGGAA	2	12	101666	101677	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_007608	CAT	2	6	101702	101707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_007608	GCA	2	6	101727	101732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_007608	GAT	2	6	108998	109003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_007608	AG	4	8	109600	109607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_007608	CTTCCG	2	12	109640	109651	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
549	NC_007608	ATT	2	6	109672	109677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_007608	AAT	2	6	109684	109689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_007608	A	6	6	109931	109936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_007608	CTT	2	6	109990	109995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_007608	T	6	6	110063	110068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_007608	TG	3	6	110109	110114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_007608	G	6	6	110127	110132	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
556	NC_007608	TCAT	2	8	110650	110657	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
557	NC_007608	AAT	2	6	110898	110903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_007608	A	6	6	111701	111706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_007608	GTA	2	6	111709	111714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_007608	GAG	2	6	111746	111751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_007608	ACTTT	2	10	112020	112029	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
562	NC_007608	TGGC	2	8	112072	112079	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
563	NC_007608	GATGTA	2	12	112110	112121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_007608	TCT	2	6	112152	112157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_007608	CAA	2	6	112209	112214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_007608	CTT	2	6	112261	112266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_007608	GCTC	2	8	112272	112279	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
568	NC_007608	CCT	2	6	113172	113177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_007608	AAT	2	6	113181	113186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_007608	A	6	6	113234	113239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_007608	TACA	2	8	113247	113254	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
572	NC_007608	A	6	6	113254	113259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_007608	TCA	2	6	113265	113270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_007608	C	6	6	113293	113298	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
575	NC_007608	ACT	2	6	113464	113469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_007608	CATT	2	8	113476	113483	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
577	NC_007608	CCTGT	2	10	113506	113515	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
578	NC_007608	GACA	2	8	113517	113524	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
579	NC_007608	CAC	2	6	113538	113543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_007608	GCG	2	6	113546	113551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_007608	CCGA	2	8	113556	113563	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
582	NC_007608	ACA	2	6	113577	113582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_007608	A	6	6	113600	113605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_007608	CCCT	2	8	113639	113646	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
585	NC_007608	GCCCC	2	10	113662	113671	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
586	NC_007608	TGT	2	6	113711	113716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_007608	TAT	2	6	113722	113727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_007608	CTGG	2	8	113744	113751	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
589	NC_007608	TCA	2	6	114037	114042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_007608	CGG	2	6	114124	114129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_007608	CAT	2	6	114156	114161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_007608	GCC	2	6	114162	114167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_007608	TCA	2	6	114259	114264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_007608	TC	4	8	114571	114578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
595	NC_007608	T	6	6	114611	114616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_007608	GCT	2	6	115893	115898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_007608	GGT	2	6	115941	115946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_007608	AG	3	6	116012	116017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_007608	TTG	2	6	116471	116476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_007608	T	6	6	116510	116515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_007608	ATC	2	6	116521	116526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_007608	TATC	2	8	116562	116569	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
603	NC_007608	AT	4	8	116605	116612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_007608	ATA	2	6	116623	116628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_007608	AAT	2	6	116636	116641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_007608	ACA	2	6	116697	116702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_007608	ATAC	2	8	116724	116731	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
608	NC_007608	ATA	2	6	116750	116755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_007608	AT	3	6	118265	118270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_007608	CAA	2	6	118349	118354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_007608	ACG	2	6	119643	119648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_007608	AGG	2	6	119729	119734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_007608	ATT	2	6	119778	119783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_007608	TG	3	6	119849	119854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
615	NC_007608	GCC	2	6	119918	119923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_007608	ATC	2	6	120004	120009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_007608	TCCT	2	8	120935	120942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
618	NC_007608	ACA	2	6	121289	121294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_007608	TTGA	2	8	124188	124195	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
620	NC_007608	ATGAA	2	10	124216	124225	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
621	NC_007608	TAT	2	6	124303	124308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_007608	CAT	2	6	124348	124353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_007608	CAC	2	6	124354	124359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_007608	CAAC	2	8	124366	124373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
625	NC_007608	AGT	2	6	124406	124411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_007608	ATA	2	6	124526	124531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_007608	AAT	2	6	124532	124537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_007608	TAA	2	6	124545	124550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_007608	TAT	2	6	124570	124575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_007608	A	6	6	124576	124581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_007608	TAG	2	6	124607	124612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_007608	ATA	2	6	124882	124887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_007608	AGG	2	6	124988	124993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_007608	TGA	2	6	125036	125041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_007608	GTT	2	6	125059	125064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_007608	TGAT	2	8	125082	125089	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
637	NC_007608	GA	3	6	125101	125106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
638	NC_007608	AAG	2	6	125109	125114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_007608	AGGT	2	8	125171	125178	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
640	NC_007608	T	7	7	125223	125229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_007608	AATA	2	8	125246	125253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_007608	TAA	2	6	125257	125262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_007608	TTAA	2	8	125294	125301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_007608	AAT	2	6	125302	125307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
645	NC_007608	AAG	2	6	125337	125342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
646	NC_007608	A	6	6	125361	125366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
647	NC_007608	GCC	2	6	126368	126373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
648	NC_007608	A	6	6	126516	126521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
649	NC_007608	CTA	2	6	126651	126656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous 12Next >