MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Shigella dysenteriae Sd197 plasmid pSD1_197

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007607	CATTG	2	10	3402	3411	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007607	AAATT	2	10	3598	3607	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007607	CAGAG	2	10	5405	5414	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_007607	CTGGT	2	10	6815	6824	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_007607	ATGTA	2	10	11696	11705	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007607	TAACA	2	10	13532	13541	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007607	TGGTG	2	10	17355	17364	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007607	ATGAA	2	10	17578	17587	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007607	ATTAC	2	10	18823	18832	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_007607	TAACG	2	10	21510	21519	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_007607	CGAGT	2	10	21612	21621	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_007607	CGAGT	2	10	29394	29403	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007607	GTTTT	2	10	40148	40157	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007607	GGACA	2	10	46978	46987	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007607	TTCAA	2	10	52391	52400	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_007607	TTTAT	2	10	72039	72048	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007607	GCCAG	2	10	74230	74239	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_007607	GCCCG	2	10	74429	74438	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_007607	TTCAT	2	10	77064	77073	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_007607	CAGGA	2	10	79296	79305	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007607	GGCAG	2	10	79390	79399	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_007607	GTCTG	2	10	80383	80392	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_007607	GGTGG	2	10	85681	85690	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007607	ATTTA	2	10	90107	90116	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007607	AAAAC	2	10	104609	104618	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_007607	ACTTT	2	10	106717	106726	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_007607	CCTGT	2	10	108203	108212	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_007607	AATGA	2	10	113560	113569	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007607	GCGCT	2	10	114498	114507	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_007607	CCTGA	2	10	123714	123723	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_007607	GTTAT	2	10	126213	126222	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007607	TTTTA	2	10	127189	127198	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007607	TTTAT	2	10	127224	127233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007607	CTTTA	2	10	135575	135584	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_007607	TATCA	2	10	161631	161640	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_007607	AAACA	2	10	161943	161952	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007607	TTCAT	2	10	165679	165688	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_007607	AATAT	2	10	167838	167847	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007607	ACCTT	2	10	175919	175928	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_007607	ATCAA	2	10	178259	178268	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_007607	ATGAA	2	10	180245	180254	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.