MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shigella dysenteriae Sd197 plasmid pSD1_197

Total Repeats: 938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007607	GCCCG	2	10	74429	74438	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
502	NC_007607	AGT	2	6	74771	74776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_007607	C	6	6	74823	74828	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
504	NC_007607	TCA	2	6	74896	74901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_007607	TTAC	2	8	75290	75297	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
506	NC_007607	A	7	7	75326	75332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_007607	GCA	2	6	75335	75340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_007607	A	6	6	75342	75347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_007607	AT	3	6	75414	75419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_007607	TAAC	2	8	76171	76178	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
511	NC_007607	CATT	2	8	76258	76265	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
512	NC_007607	CACTTA	2	12	76363	76374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_007607	A	6	6	76492	76497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_007607	T	7	7	77012	77018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_007607	TTA	2	6	77039	77044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_007607	TAA	2	6	77045	77050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_007607	A	6	6	77049	77054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_007607	TTCAT	2	10	77064	77073	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
519	NC_007607	CGG	2	6	78867	78872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_007607	CTC	2	6	78878	78883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_007607	CAA	2	6	78893	78898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_007607	GCC	2	6	78905	78910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_007607	TA	3	6	78958	78963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_007607	TA	3	6	78969	78974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_007607	CAGGA	2	10	79296	79305	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
526	NC_007607	GTA	2	6	79315	79320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_007607	GCC	2	6	79343	79348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_007607	CAGC	2	8	79377	79384	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
529	NC_007607	GGCAG	2	10	79390	79399	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
530	NC_007607	GGAA	2	8	79426	79433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_007607	CA	3	6	79443	79448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_007607	TG	3	6	79470	79475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_007607	TTG	2	6	80115	80120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_007607	GCA	2	6	80230	80235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_007607	CAA	2	6	80251	80256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_007607	ACC	2	6	80257	80262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_007607	CCG	2	6	80270	80275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_007607	GCA	2	6	80315	80320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_007607	CACG	2	8	80329	80336	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
540	NC_007607	CCAG	2	8	80342	80349	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
541	NC_007607	GTCTG	2	10	80383	80392	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
542	NC_007607	AAT	2	6	80412	80417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_007607	CAT	2	6	80421	80426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_007607	GAA	2	6	80492	80497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_007607	CAC	2	6	82435	82440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_007607	CGT	2	6	85560	85565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_007607	A	6	6	85568	85573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_007607	AAC	2	6	85605	85610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_007607	C	6	6	85624	85629	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
550	NC_007607	GGTGG	2	10	85681	85690	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
551	NC_007607	ATG	2	6	85742	85747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_007607	TAAA	2	8	85792	85799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_007607	T	7	7	85817	85823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_007607	TGT	2	6	85838	85843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_007607	ATA	2	6	85931	85936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_007607	TTG	2	6	85953	85958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_007607	ATC	2	6	86957	86962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_007607	GGT	2	6	86973	86978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_007607	GAA	2	6	87014	87019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_007607	ATG	2	6	89011	89016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_007607	GTT	2	6	90017	90022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_007607	GT	3	6	90059	90064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_007607	GGA	2	6	90079	90084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_007607	ATTTA	2	10	90107	90116	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_007607	GCA	3	9	90834	90842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_007607	GTGG	2	8	90843	90850	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
567	NC_007607	GCCTGC	2	12	90857	90868	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
568	NC_007607	GCA	2	6	90904	90909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_007607	GC	3	6	90938	90943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
570	NC_007607	CAT	2	6	90957	90962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_007607	CGT	2	6	90963	90968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_007607	TGG	2	6	91286	91291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_007607	TGT	2	6	91320	91325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_007607	CGC	2	6	91558	91563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_007607	GC	3	6	91599	91604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
576	NC_007607	GGC	2	6	91610	91615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_007607	TAC	2	6	92350	92355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_007607	TCA	2	6	93106	93111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_007607	TCTG	2	8	93120	93127	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
580	NC_007607	TAA	2	6	93151	93156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_007607	TTG	2	6	93204	93209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_007607	AGGA	2	8	93557	93564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
583	NC_007607	GAT	2	6	102145	102150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_007607	AG	4	8	102747	102754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
585	NC_007607	CTTCCG	2	12	102787	102798	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
586	NC_007607	ATT	2	6	102819	102824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_007607	AAT	2	6	102831	102836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_007607	A	6	6	103078	103083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_007607	CTT	2	6	103137	103142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_007607	T	6	6	103210	103215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_007607	CAGC	2	8	103822	103829	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
592	NC_007607	T	6	6	103936	103941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_007607	GCA	2	6	104237	104242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_007607	GGT	2	6	104276	104281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_007607	C	6	6	104528	104533	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
596	NC_007607	TAAA	2	8	104551	104558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_007607	TCAT	2	8	104574	104581	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
598	NC_007607	AAAAC	2	10	104609	104618	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
599	NC_007607	AAT	2	6	104821	104826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_007607	A	6	6	106398	106403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_007607	GTA	2	6	106406	106411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_007607	GAG	2	6	106443	106448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_007607	ACTTT	2	10	106717	106726	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
604	NC_007607	TGGC	2	8	106769	106776	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
605	NC_007607	TCT	2	6	106849	106854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_007607	CAA	2	6	106906	106911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_007607	CTT	2	6	106958	106963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_007607	CCT	2	6	107869	107874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_007607	AAT	2	6	107878	107883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_007607	A	6	6	107931	107936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_007607	TACA	2	8	107944	107951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
612	NC_007607	A	6	6	107951	107956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_007607	TCA	2	6	107962	107967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_007607	ACT	2	6	108161	108166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_007607	CATT	2	8	108173	108180	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
616	NC_007607	CCTGT	2	10	108203	108212	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
617	NC_007607	AGAC	2	8	108213	108220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
618	NC_007607	GCG	2	6	108243	108248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_007607	CCGA	2	8	108253	108260	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
620	NC_007607	ACA	2	6	108274	108279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_007607	A	6	6	108297	108302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_007607	CTC	2	6	108337	108342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_007607	GCC	3	9	108356	108364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_007607	CCCG	2	8	108365	108372	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
625	NC_007607	TGT	2	6	108406	108411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_007607	CAT	3	9	108417	108425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_007607	TCT	2	6	108435	108440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_007607	TCG	2	6	108523	108528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_007607	AAT	2	6	108712	108717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_007607	AGC	2	6	108721	108726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_007607	TAA	2	6	108753	108758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_007607	TC	4	8	108890	108897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_007607	T	6	6	108930	108935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_007607	TTG	2	6	112215	112220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_007607	AGGA	2	8	112568	112575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
636	NC_007607	A	6	6	113369	113374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_007607	GAT	2	6	113501	113506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_007607	AATGA	2	10	113560	113569	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
639	NC_007607	CCCG	2	8	113672	113679	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
640	NC_007607	AGC	2	6	113705	113710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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642	NC_007607	ACG	2	6	113733	113738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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921	NC_007607	AGG	2	6	181017	181022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
922	NC_007607	TGA	2	6	181065	181070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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