MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella dysenteriae Sd197

Total Repeats: 19042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007606	TTC	2	6	260375	260380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_007606	GCC	2	6	260415	260420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_007606	TCC	2	6	260466	260471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_007606	TCA	2	6	260490	260495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_007606	CTG	2	6	260555	260560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_007606	TA	3	6	260564	260569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_007606	TCG	2	6	260595	260600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_007606	ATAA	2	8	260639	260646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_007606	CAG	2	6	260732	260737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_007606	ATG	2	6	262876	262881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_007606	CCT	2	6	262926	262931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_007606	GTG	2	6	262949	262954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_007606	A	6	6	263152	263157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_007606	ACG	2	6	263633	263638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_007606	A	7	7	263702	263708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_007606	ATTT	2	8	263719	263726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_007606	CT	3	6	263736	263741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_007606	AAC	2	6	263759	263764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_007606	TTA	2	6	263770	263775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_007606	A	6	6	263775	263780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_007606	TAA	2	6	263820	263825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_007606	TG	3	6	263830	263835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_007606	TCA	2	6	263840	263845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_007606	GTT	2	6	263928	263933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_007606	TGC	2	6	265640	265645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_007606	TCG	2	6	265661	265666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_007606	CTGG	2	8	265679	265686	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_007606	CTT	2	6	265699	265704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_007606	GCGT	2	8	265794	265801	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_007606	GC	3	6	267804	267809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_007606	GCT	2	6	267863	267868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_007606	TGG	2	6	267922	267927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_007606	GAT	2	6	267941	267946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_007606	CAT	2	6	268685	268690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_007606	GCA	2	6	268710	268715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_007606	GCC	2	6	268766	268771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_007606	ACG	2	6	268776	268781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_007606	TGA	2	6	268808	268813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_007606	GTG	2	6	268932	268937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_007606	GTT	2	6	268982	268987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_007606	GCG	2	6	269023	269028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_007606	TGAT	2	8	269068	269075	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_007606	CGC	2	6	269084	269089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_007606	GGCG	2	8	269333	269340	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_007606	TGA	2	6	269367	269372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_007606	CGC	2	6	269474	269479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_007606	AG	3	6	271142	271147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_007606	AT	3	6	272463	272468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_007606	GTG	2	6	272472	272477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_007606	ATC	2	6	272501	272506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_007606	CG	3	6	272525	272530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_007606	TAT	2	6	272542	272547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_007606	CA	3	6	272564	272569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_007606	CCA	2	6	274022	274027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_007606	AAT	2	6	274079	274084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_007606	AG	4	8	275721	275728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_007606	GC	3	6	275783	275788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_007606	GTTTC	2	10	275795	275804	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1059	NC_007606	ATG	2	6	275890	275895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_007606	TGC	2	6	276019	276024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_007606	GCCA	2	8	276113	276120	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_007606	TCCG	2	8	276121	276128	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_007606	CAG	2	6	276140	276145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_007606	CAA	2	6	276196	276201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_007606	CAGC	2	8	276233	276240	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_007606	CAT	2	6	276623	276628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_007606	GCA	2	6	276648	276653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_007606	CAC	2	6	276655	276660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_007606	TCA	2	6	277450	277455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_007606	TCTG	2	8	277464	277471	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_007606	TAA	2	6	277495	277500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_007606	TTG	2	6	277548	277553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_007606	AGGA	2	8	277901	277908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_007606	AG	3	6	277962	277967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_007606	ATG	2	6	277983	277988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_007606	CCAT	2	8	278008	278015	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_007606	TGC	2	6	278022	278027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_007606	TTTC	2	8	278039	278046	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_007606	AT	3	6	278088	278093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_007606	ATA	2	6	278118	278123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_007606	CCG	2	6	278188	278193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_007606	ACCGTC	2	12	278205	278216	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_007606	AAT	2	6	279644	279649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_007606	TGA	2	6	279653	279658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_007606	GACGC	2	10	279708	279717	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1086	NC_007606	CGC	2	6	279721	279726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_007606	ACTATC	2	12	279733	279744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_007606	CG	3	6	279787	279792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_007606	CAA	2	6	280640	280645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_007606	GTT	2	6	281066	281071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_007606	TCA	2	6	281458	281463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_007606	T	6	6	281529	281534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_007606	TAAGTG	2	12	281652	281663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_007606	TTGT	2	8	282314	282321	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_007606	T	7	7	282428	282434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_007606	GGC	2	6	282439	282444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_007606	AAC	2	6	284329	284334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_007606	GC	3	6	284377	284382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_007606	A	6	6	284454	284459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_007606	GCA	2	6	284844	284849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_007606	GCCA	2	8	284860	284867	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_007606	CT	3	6	284887	284892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_007606	TAG	2	6	284894	284899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_007606	CT	4	8	287364	287371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_007606	C	6	6	287508	287513	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1106	NC_007606	ACTG	2	8	287524	287531	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_007606	CTT	2	6	288834	288839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_007606	ACG	3	9	288857	288865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_007606	GCC	2	6	288905	288910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_007606	A	6	6	289593	289598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_007606	CTG	2	6	289600	289605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_007606	TGT	2	6	289692	289697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_007606	A	7	7	289750	289756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_007606	CAC	2	6	289760	289765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_007606	TGC	2	6	289804	289809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_007606	A	6	6	291125	291130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_007606	GTT	2	6	291168	291173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_007606	AATC	2	8	291201	291208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_007606	ATC	2	6	291227	291232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_007606	TCC	2	6	291783	291788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_007606	CATC	2	8	291805	291812	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_007606	AAC	2	6	291854	291859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_007606	ATT	2	6	291963	291968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_007606	ATG	2	6	291977	291982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_007606	ATG	2	6	292026	292031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_007606	ATT	2	6	294186	294191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_007606	GTA	2	6	294197	294202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_007606	ATT	2	6	294216	294221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_007606	TAAA	2	8	294227	294234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_007606	TTA	2	6	294247	294252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_007606	T	6	6	294714	294719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_007606	AGC	2	6	294804	294809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_007606	TAAGTG	2	12	294837	294848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_007606	CTG	2	6	296450	296455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_007606	ATA	2	6	297084	297089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_007606	GAG	2	6	297208	297213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_007606	GGC	2	6	300186	300191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1406	NC_007606	AGC	2	6	350208	350213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1408	NC_007606	CACTTA	2	12	350496	350507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1410	NC_007606	A	6	6	351111	351116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_007606	T	6	6	351937	351942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1457	NC_007606	A	6	6	361957	361962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1477	NC_007606	CTT	2	6	372830	372835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1478	NC_007606	A	6	6	374543	374548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1481	NC_007606	TG	3	6	375566	375571	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1482	NC_007606	TTG	2	6	375578	375583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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