MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella dysenteriae Sd197

Total Repeats: 19042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007606	AATA	2	8	1194828	1194835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_007606	GAT	2	6	1194888	1194893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_007606	GCA	2	6	1194897	1194902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_007606	GAC	2	6	1194960	1194965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_007606	TCT	2	6	1194973	1194978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_007606	ATG	2	6	1195016	1195021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_007606	CAG	2	6	1195130	1195135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_007606	T	6	6	1196396	1196401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_007606	TAAGTG	2	12	1196519	1196530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_007606	AATG	2	8	1196628	1196635	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_007606	CTT	2	6	1196766	1196771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_007606	CGC	2	6	1196804	1196809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_007606	TG	3	6	1196873	1196878	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_007606	ATG	2	6	1196903	1196908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_007606	A	7	7	1196953	1196959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_007606	TGC	2	6	1198175	1198180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_007606	ATG	2	6	1198200	1198205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_007606	GCA	2	6	1198817	1198822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_007606	TGA	2	6	1198977	1198982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_007606	CGA	2	6	1199060	1199065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_007606	CAGT	2	8	1199137	1199144	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5022	NC_007606	ACTG	2	8	1199151	1199158	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5023	NC_007606	T	6	6	1201906	1201911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_007606	ATC	2	6	1201917	1201922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_007606	TGA	2	6	1201953	1201958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_007606	CACT	2	8	1201999	1202006	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_007606	TTA	2	6	1202038	1202043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_007606	CAAAT	2	10	1202111	1202120	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5029	NC_007606	TAA	2	6	1202174	1202179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_007606	GTA	2	6	1202183	1202188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_007606	TGG	2	6	1202194	1202199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_007606	CATT	2	8	1202303	1202310	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5033	NC_007606	CACTTA	2	12	1202408	1202419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_007606	A	6	6	1202537	1202542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_007606	G	7	7	1203054	1203060	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_007606	TGC	2	6	1203062	1203067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_007606	ATG	2	6	1203087	1203092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_007606	AAT	2	6	1203834	1203839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_007606	ATAA	2	8	1203954	1203961	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_007606	CCT	2	6	1204008	1204013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5041	NC_007606	ACT	2	6	1204015	1204020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_007606	T	6	6	1204507	1204512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_007606	TAAGTG	2	12	1204630	1204641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_007606	TTC	2	6	1204925	1204930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_007606	AGTT	2	8	1204940	1204947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_007606	CAT	2	6	1204978	1204983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_007606	CAT	2	6	1204997	1205002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_007606	GAA	2	6	1205018	1205023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_007606	ATA	2	6	1205076	1205081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_007606	ATT	2	6	1205094	1205099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_007606	ACT	2	6	1205109	1205114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_007606	TTGA	2	8	1205159	1205166	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_007606	TGTT	2	8	1205176	1205183	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_007606	AAG	2	6	1205266	1205271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_007606	AAT	2	6	1205324	1205329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_007606	AAT	2	6	1205355	1205360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_007606	AATA	2	8	1205420	1205427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_007606	CAG	2	6	1205467	1205472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_007606	A	6	6	1205552	1205557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_007606	CGGGGG	2	12	1213117	1213128	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
5061	NC_007606	AGT	2	6	1213156	1213161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_007606	AAAC	2	8	1213294	1213301	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5063	NC_007606	ACAT	2	8	1214702	1214709	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5064	NC_007606	TAG	2	6	1214734	1214739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_007606	GAGC	2	8	1214770	1214777	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5066	NC_007606	CAT	2	6	1214819	1214824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_007606	TTA	2	6	1214845	1214850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_007606	TGG	2	6	1214859	1214864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_007606	GAT	2	6	1215312	1215317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_007606	CATG	2	8	1215332	1215339	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5071	NC_007606	CTGATC	2	12	1215375	1215386	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_007606	ACT	2	6	1215603	1215608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_007606	CTA	2	6	1215643	1215648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_007606	AAG	2	6	1215724	1215729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_007606	AAG	2	6	1215782	1215787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_007606	ATC	2	6	1215879	1215884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_007606	ATG	2	6	1215918	1215923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_007606	ATG	2	6	1215975	1215980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_007606	ATG	2	6	1216003	1216008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_007606	TGA	2	6	1216009	1216014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_007606	ACT	2	6	1216191	1216196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_007606	CAGT	2	8	1216200	1216207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5083	NC_007606	AT	3	6	1216367	1216372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_007606	GTT	2	6	1216447	1216452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_007606	AT	3	6	1216460	1216465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_007606	CTAT	2	8	1216470	1216477	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5087	NC_007606	CCT	2	6	1216570	1216575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5088	NC_007606	ATC	2	6	1216619	1216624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_007606	AGT	2	6	1218050	1218055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_007606	CTT	2	6	1218114	1218119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_007606	G	8	8	1218121	1218128	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_007606	AAC	2	6	1218747	1218752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_007606	AG	3	6	1219313	1219318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_007606	CAG	2	6	1219337	1219342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_007606	GTG	2	6	1219362	1219367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_007606	TCAAC	2	10	1219942	1219951	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5097	NC_007606	TCA	2	6	1219955	1219960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_007606	CTA	2	6	1219971	1219976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_007606	TTC	3	9	1219991	1219999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_007606	GTC	2	6	1220025	1220030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_007606	CTC	2	6	1220093	1220098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_007606	CTA	2	6	1221387	1221392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_007606	GAG	2	6	1221403	1221408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_007606	GCA	2	6	1222833	1222838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_007606	GCG	2	6	1222917	1222922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_007606	ACG	2	6	1223108	1223113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_007606	ATG	2	6	1224589	1224594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_007606	CGC	2	6	1225351	1225356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_007606	ATT	2	6	1225378	1225383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_007606	CAT	2	6	1225431	1225436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_007606	CATT	2	8	1225510	1225517	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5112	NC_007606	CACTTA	2	12	1225615	1225626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_007606	A	6	6	1225744	1225749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_007606	TCCT	2	8	1226166	1226173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5115	NC_007606	ACA	2	6	1226520	1226525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_007606	TTA	2	6	1226574	1226579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_007606	CAGA	2	8	1226603	1226610	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5118	NC_007606	TGA	2	6	1226619	1226624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_007606	CTA	2	6	1227451	1227456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_007606	ATT	2	6	1227477	1227482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_007606	TTTG	2	8	1227513	1227520	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_007606	AAAG	2	8	1227630	1227637	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_007606	GCC	2	6	1227645	1227650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5124	NC_007606	GGC	2	6	1227660	1227665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_007606	A	8	8	1234225	1234232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_007606	CCA	2	6	1234307	1234312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5127	NC_007606	TAAT	2	8	1234388	1234395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_007606	ATG	2	6	1234434	1234439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_007606	A	6	6	1234447	1234452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_007606	TGC	2	6	1235990	1235995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_007606	ATG	2	6	1236015	1236020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_007606	GTA	2	6	1237236	1237241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5134	NC_007606	CTC	2	6	1239667	1239672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5137	NC_007606	TGT	2	6	1239834	1239839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_007606	GTT	2	6	1239857	1239862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5143	NC_007606	GAA	2	6	1241562	1241567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5145	NC_007606	ATT	2	6	1244248	1244253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5147	NC_007606	T	6	6	1244311	1244316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5148	NC_007606	ATT	2	6	1244317	1244322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5149	NC_007606	A	6	6	1244354	1244359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5150	NC_007606	ATG	2	6	1244367	1244372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5152	NC_007606	AT	3	6	1245416	1245421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5153	NC_007606	TTTC	2	8	1245422	1245429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5154	NC_007606	ATT	2	6	1245562	1245567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5162	NC_007606	CTC	2	6	1246960	1246965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5163	NC_007606	GCG	2	6	1246998	1247003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5165	NC_007606	GTT	2	6	1247053	1247058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5242	NC_007606	ATC	2	6	1256671	1256676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5245	NC_007606	TAA	2	6	1257508	1257513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5246	NC_007606	A	7	7	1257512	1257518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_007606	AAT	2	6	1257775	1257780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5250	NC_007606	TA	4	8	1257872	1257879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5251	NC_007606	GC	3	6	1257893	1257898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5252	NC_007606	CGG	2	6	1257933	1257938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5253	NC_007606	CAAA	2	8	1257951	1257958	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5254	NC_007606	A	6	6	1257992	1257997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_007606	CT	3	6	1258013	1258018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5257	NC_007606	GTT	2	6	1258095	1258100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_007606	ATCG	2	8	1258141	1258148	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5260	NC_007606	ATC	2	6	1258192	1258197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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