MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 6727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007516	CGA	2	6	1532232	1532237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_007516	CCG	2	6	1532301	1532306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_007516	GCT	2	6	1532398	1532403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_007516	ACG	2	6	1532406	1532411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_007516	GAC	2	6	1532486	1532491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_007516	GTT	2	6	1532543	1532548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_007516	GT	3	6	1532569	1532574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_007516	AG	3	6	1532577	1532582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_007516	AGG	2	6	1532691	1532696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_007516	TGCC	2	8	1532702	1532709	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4011	NC_007516	TGT	2	6	1532775	1532780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_007516	CCAT	2	8	1532783	1532790	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4013	NC_007516	CA	4	8	1532804	1532811	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4014	NC_007516	T	6	6	1532836	1532841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_007516	GCA	2	6	1532889	1532894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_007516	CAAA	2	8	1533352	1533359	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4017	NC_007516	GAAG	2	8	1533755	1533762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_007516	TGGGC	2	10	1533763	1533772	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4019	NC_007516	CGAG	2	8	1533802	1533809	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4020	NC_007516	CAT	2	6	1533821	1533826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_007516	AAAG	2	8	1534206	1534213	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_007516	TTC	2	6	1534265	1534270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_007516	CAG	2	6	1534277	1534282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_007516	T	8	8	1534319	1534326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_007516	GA	3	6	1534335	1534340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_007516	A	6	6	1534353	1534358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_007516	TCAG	2	8	1534841	1534848	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4028	NC_007516	TAA	2	6	1534898	1534903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_007516	CA	3	6	1534940	1534945	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4030	NC_007516	CGC	2	6	1534950	1534955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_007516	AGG	2	6	1534998	1535003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_007516	ACC	2	6	1535064	1535069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_007516	AG	3	6	1535085	1535090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_007516	AGC	3	9	1536233	1536241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_007516	AGT	2	6	1536268	1536273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_007516	A	6	6	1536553	1536558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_007516	TGC	2	6	1536565	1536570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4039	NC_007516	A	6	6	1536590	1536595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_007516	GTA	2	6	1536992	1536997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_007516	TTG	2	6	1537015	1537020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_007516	GCT	2	6	1537034	1537039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_007516	GCCC	2	8	1537071	1537078	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4044	NC_007516	T	6	6	1537079	1537084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_007516	CGG	2	6	1537460	1537465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_007516	GCT	2	6	1537559	1537564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_007516	CTTC	2	8	1538286	1538293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4048	NC_007516	T	6	6	1538297	1538302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_007516	CTA	2	6	1538306	1538311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_007516	A	6	6	1538331	1538336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_007516	A	6	6	1538341	1538346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_007516	GGT	2	6	1538352	1538357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_007516	CAA	2	6	1538426	1538431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_007516	CGG	2	6	1538504	1538509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_007516	GAA	2	6	1538559	1538564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_007516	TC	3	6	1538643	1538648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4057	NC_007516	GAC	2	6	1538673	1538678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_007516	GCTCAG	2	12	1538691	1538702	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_007516	AGG	2	6	1539356	1539361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_007516	AGG	2	6	1539779	1539784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_007516	CTC	2	6	1540081	1540086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_007516	GAA	2	6	1540102	1540107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_007516	AGG	2	6	1540168	1540173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_007516	TCT	2	6	1540537	1540542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_007516	CTT	2	6	1540557	1540562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_007516	AG	3	6	1540633	1540638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_007516	AAT	2	6	1541179	1541184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_007516	TGA	2	6	1541201	1541206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_007516	AGA	2	6	1542084	1542089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_007516	CTT	2	6	1543654	1543659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_007516	CAT	2	6	1543884	1543889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4075	NC_007516	GCC	2	6	1546283	1546288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4076	NC_007516	CCTT	2	8	1546320	1546327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4077	NC_007516	GCA	2	6	1546345	1546350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_007516	CAG	2	6	1546883	1546888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4080	NC_007516	GTC	2	6	1547045	1547050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_007516	T	6	6	1547139	1547144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_007516	TTC	2	6	1547155	1547160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_007516	GTTT	2	8	1547176	1547183	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_007516	GCG	2	6	1547220	1547225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_007516	GC	3	6	1548428	1548433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4086	NC_007516	T	6	6	1548539	1548544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_007516	CAG	2	6	1548571	1548576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_007516	AGC	2	6	1548608	1548613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_007516	CTA	2	6	1548997	1549002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_007516	ATCCG	2	10	1549321	1549330	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4091	NC_007516	CAA	2	6	1549340	1549345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_007516	GTT	2	6	1549402	1549407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_007516	TTGG	2	8	1550039	1550046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_007516	TC	3	6	1552109	1552114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_007516	G	6	6	1552120	1552125	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_007516	CCA	2	6	1552169	1552174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4097	NC_007516	CAC	2	6	1552206	1552211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_007516	TC	3	6	1552287	1552292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4099	NC_007516	CT	4	8	1552299	1552306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4100	NC_007516	ACT	2	6	1552308	1552313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_007516	CT	4	8	1552312	1552319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4102	NC_007516	TC	4	8	1552325	1552332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_007516	G	6	6	1552342	1552347	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_007516	ACGC	2	8	1552367	1552374	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4105	NC_007516	GCCTT	2	10	1552402	1552411	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4106	NC_007516	TAA	2	6	1552420	1552425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_007516	AAC	2	6	1552449	1552454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_007516	CAC	2	6	1553059	1553064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4109	NC_007516	CTG	3	9	1553078	1553086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_007516	CGAA	2	8	1553124	1553131	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4111	NC_007516	GCC	2	6	1553135	1553140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_007516	CGT	2	6	1553164	1553169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_007516	AGC	2	6	1553348	1553353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_007516	C	7	7	1553956	1553962	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4115	NC_007516	GCT	2	6	1554003	1554008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_007516	GCG	2	6	1554055	1554060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_007516	CGC	2	6	1554069	1554074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4119	NC_007516	GAA	2	6	1554175	1554180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_007516	GTT	2	6	1554216	1554221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_007516	GAT	2	6	1555818	1555823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_007516	TGC	2	6	1555950	1555955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_007516	GCT	2	6	1555999	1556004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_007516	G	8	8	1556017	1556024	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_007516	GCT	2	6	1556080	1556085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_007516	AC	3	6	1558010	1558015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4127	NC_007516	T	6	6	1558059	1558064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_007516	GACA	2	8	1559202	1559209	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4129	NC_007516	ACG	2	6	1559243	1559248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4131	NC_007516	TAAA	2	8	1559325	1559332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4258	NC_007516	GCTT	2	8	1579194	1579201	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4261	NC_007516	TCGAGC	2	12	1579252	1579263	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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