MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 6727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007516	CA	3	6	1416972	1416977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_007516	GAT	2	6	1417063	1417068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_007516	TGG	2	6	1417103	1417108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_007516	CAA	2	6	1417114	1417119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_007516	CAG	2	6	1417120	1417125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_007516	GCC	2	6	1417126	1417131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3507	NC_007516	CAG	2	6	1417150	1417155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_007516	ATC	2	6	1417172	1417177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_007516	CGG	2	6	1418590	1418595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_007516	TGG	2	6	1420019	1420024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_007516	CAA	2	6	1420046	1420051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_007516	A	7	7	1420062	1420068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_007516	CAG	2	6	1420075	1420080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_007516	TC	3	6	1420088	1420093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_007516	CAA	3	9	1420125	1420133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_007516	CAGG	2	8	1420137	1420144	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3517	NC_007516	TGA	2	6	1420193	1420198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_007516	ACG	2	6	1420207	1420212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_007516	GTC	2	6	1420224	1420229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_007516	TTC	2	6	1420272	1420277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_007516	GCTT	2	8	1420306	1420313	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3522	NC_007516	CAGC	2	8	1420322	1420329	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_007516	A	6	6	1420375	1420380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_007516	TC	4	8	1420400	1420407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3525	NC_007516	CTC	2	6	1420429	1420434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3526	NC_007516	AAAT	2	8	1420478	1420485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_007516	GATG	2	8	1420523	1420530	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_007516	AGC	2	6	1420571	1420576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_007516	CTG	2	6	1420577	1420582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_007516	TCT	2	6	1420593	1420598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_007516	CAGA	2	8	1420642	1420649	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3532	NC_007516	GGAT	2	8	1420710	1420717	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_007516	CGT	2	6	1420759	1420764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_007516	AGC	2	6	1420881	1420886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_007516	ACC	2	6	1421255	1421260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_007516	TTGA	2	8	1421296	1421303	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_007516	CGG	2	6	1421310	1421315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_007516	CAGT	2	8	1421325	1421332	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3539	NC_007516	GTC	2	6	1421338	1421343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_007516	TCC	2	6	1421382	1421387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3541	NC_007516	GA	3	6	1421396	1421401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_007516	GAG	2	6	1421473	1421478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_007516	GAAG	2	8	1421518	1421525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_007516	CGTG	2	8	1421564	1421571	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3545	NC_007516	ACCA	2	8	1421584	1421591	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3546	NC_007516	GGT	2	6	1421602	1421607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_007516	TTC	2	6	1421623	1421628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_007516	CAG	2	6	1421654	1421659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_007516	TGG	2	6	1421776	1421781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_007516	AGA	2	6	1421798	1421803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_007516	G	6	6	1421812	1421817	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_007516	AGG	2	6	1421854	1421859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_007516	AACC	2	8	1421892	1421899	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3554	NC_007516	CCTTT	2	10	1421925	1421934	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3555	NC_007516	CAC	2	6	1421944	1421949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_007516	TCGCT	2	10	1422083	1422092	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3557	NC_007516	TGA	2	6	1422133	1422138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_007516	TGA	2	6	1422194	1422199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_007516	GTT	2	6	1422229	1422234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_007516	AAAGGT	2	12	1422256	1422267	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_007516	ACG	2	6	1422276	1422281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_007516	TCG	2	6	1422436	1422441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_007516	CAGC	2	8	1422770	1422777	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3564	NC_007516	ACT	2	6	1422824	1422829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_007516	CAG	2	6	1422830	1422835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_007516	GTG	2	6	1422862	1422867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_007516	GCA	2	6	1422874	1422879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_007516	CCAC	2	8	1422973	1422980	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3569	NC_007516	GGC	2	6	1423065	1423070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_007516	TCG	2	6	1423078	1423083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_007516	GTT	2	6	1423098	1423103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_007516	GCC	2	6	1423113	1423118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3573	NC_007516	GCA	2	6	1423138	1423143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_007516	ATAC	2	8	1423598	1423605	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3575	NC_007516	CAA	2	6	1423631	1423636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_007516	CCCAAA	2	12	1423747	1423758	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3577	NC_007516	GA	3	6	1423784	1423789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_007516	GCT	2	6	1423794	1423799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_007516	GAA	2	6	1423827	1423832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_007516	GA	3	6	1423834	1423839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_007516	CAG	2	6	1423912	1423917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_007516	CTG	2	6	1423930	1423935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_007516	GAC	2	6	1423994	1423999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_007516	TCC	2	6	1424010	1424015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3585	NC_007516	TTC	2	6	1424386	1424391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_007516	AGT	2	6	1424563	1424568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_007516	ACA	2	6	1424594	1424599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_007516	CT	3	6	1424602	1424607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3589	NC_007516	AAT	2	6	1424657	1424662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_007516	AG	3	6	1424727	1424732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_007516	AGA	2	6	1424807	1424812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_007516	A	7	7	1424880	1424886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_007516	GACC	2	8	1424911	1424918	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3594	NC_007516	GCA	2	6	1424924	1424929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_007516	GCG	2	6	1425001	1425006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_007516	GGT	2	6	1425034	1425039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_007516	CTG	2	6	1425229	1425234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_007516	CCAGCA	2	12	1425371	1425382	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_007516	CATCG	2	10	1425690	1425699	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3600	NC_007516	CAG	2	6	1426110	1426115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_007516	CCA	2	6	1426116	1426121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3602	NC_007516	AGA	2	6	1426208	1426213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_007516	AG	3	6	1426235	1426240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_007516	ACA	2	6	1426258	1426263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_007516	TCA	2	6	1426283	1426288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_007516	CT	3	6	1426290	1426295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3607	NC_007516	AG	3	6	1426328	1426333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_007516	CAA	2	6	1426345	1426350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_007516	GGC	2	6	1426384	1426389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_007516	CCAA	2	8	1426435	1426442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3611	NC_007516	ACCT	2	8	1426500	1426507	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3612	NC_007516	ACC	2	6	1426549	1426554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3613	NC_007516	TAC	2	6	1426573	1426578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_007516	GTC	2	6	1426609	1426614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_007516	TGAGC	2	10	1426656	1426665	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3616	NC_007516	CCA	2	6	1426667	1426672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3617	NC_007516	CATC	2	8	1426714	1426721	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3618	NC_007516	CGC	2	6	1426739	1426744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3619	NC_007516	A	7	7	1426811	1426817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_007516	TTC	2	6	1426908	1426913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_007516	CGTCA	2	10	1426953	1426962	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3622	NC_007516	GCTG	2	8	1427018	1427025	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3623	NC_007516	TTCT	2	8	1427050	1427057	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3624	NC_007516	GAG	2	6	1427163	1427168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_007516	GTCA	2	8	1427233	1427240	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3626	NC_007516	ACC	3	9	1427256	1427264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3627	NC_007516	GCA	2	6	1427347	1427352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_007516	CCA	2	6	1427376	1427381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3630	NC_007516	AAC	2	6	1427398	1427403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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