MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 6727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_007516	ATG	2	6	2140484	2140489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_007516	CAG	2	6	2140511	2140516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_007516	GCC	2	6	2140526	2140531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_007516	AAT	2	6	2140550	2140555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_007516	GCT	2	6	2140590	2140595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_007516	TCA	2	6	2140620	2140625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_007516	TCT	2	6	2140638	2140643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_007516	CTG	2	6	2140735	2140740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_007516	ATC	2	6	2140785	2140790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_007516	AGC	2	6	2140908	2140913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_007516	TGT	2	6	2140924	2140929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_007516	CCT	2	6	2140933	2140938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_007516	GTTC	2	8	2140987	2140994	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6014	NC_007516	CGC	2	6	2141014	2141019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6015	NC_007516	CCT	2	6	2141141	2141146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6016	NC_007516	GTT	2	6	2141223	2141228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_007516	CAA	2	6	2141250	2141255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_007516	CTT	2	6	2141292	2141297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_007516	T	6	6	2141308	2141313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_007516	CTC	2	6	2141350	2141355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_007516	ACCTC	2	10	2141356	2141365	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6022	NC_007516	GGTT	2	8	2141466	2141473	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_007516	GAA	2	6	2141501	2141506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_007516	ACA	2	6	2141510	2141515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_007516	GCC	2	6	2141546	2141551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_007516	CAG	2	6	2141594	2141599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_007516	ACACC	2	10	2141631	2141640	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6028	NC_007516	GAGT	2	8	2146555	2146562	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_007516	CGG	2	6	2146582	2146587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_007516	TCT	2	6	2146624	2146629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_007516	TTC	2	6	2146644	2146649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_007516	TGT	2	6	2147910	2147915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_007516	CCG	2	6	2147927	2147932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NC_007516	ACC	2	6	2147934	2147939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6035	NC_007516	T	7	7	2147945	2147951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_007516	GCC	2	6	2153260	2153265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6037	NC_007516	GCGG	2	8	2153300	2153307	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6038	NC_007516	TTG	3	9	2153309	2153317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_007516	TGG	2	6	2153327	2153332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_007516	ACC	2	6	2154678	2154683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6041	NC_007516	TCCA	2	8	2154782	2154789	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6042	NC_007516	CGG	2	6	2160531	2160536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_007516	CAG	2	6	2161926	2161931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_007516	GC	3	6	2161940	2161945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_007516	CCAA	2	8	2164185	2164192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6046	NC_007516	GCCG	2	8	2164233	2164240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6047	NC_007516	CGA	2	6	2166677	2166682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_007516	GCAA	2	8	2166685	2166692	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6049	NC_007516	TATG	2	8	2168626	2168633	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_007516	GCCT	2	8	2169549	2169556	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6051	NC_007516	CGG	2	6	2169647	2169652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_007516	ACG	2	6	2169673	2169678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_007516	GC	3	6	2169694	2169699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6054	NC_007516	A	7	7	2176107	2176113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_007516	ATT	2	6	2177976	2177981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_007516	A	10	10	2178020	2178029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_007516	CA	3	6	2179613	2179618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_007516	GCT	2	6	2179657	2179662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_007516	CGC	2	6	2179677	2179682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_007516	CGA	2	6	2179731	2179736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_007516	CCCG	2	8	2179760	2179767	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6062	NC_007516	GAT	2	6	2179816	2179821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_007516	CAG	2	6	2179860	2179865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_007516	AAC	2	6	2179877	2179882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_007516	CCT	3	9	2179898	2179906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6066	NC_007516	ACC	2	6	2179945	2179950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_007516	C	6	6	2179949	2179954	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6068	NC_007516	GAAG	2	8	2179955	2179962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_007516	TCC	2	6	2188241	2188246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6070	NC_007516	CGAT	2	8	2188320	2188327	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6071	NC_007516	CTG	2	6	2188335	2188340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_007516	A	8	8	2189003	2189010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_007516	GGC	2	6	2190164	2190169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_007516	ACC	2	6	2190542	2190547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6075	NC_007516	CCCG	2	8	2191289	2191296	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6076	NC_007516	A	6	6	2191342	2191347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_007516	CGGAAG	2	12	2191371	2191382	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6078	NC_007516	GCC	2	6	2191395	2191400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6079	NC_007516	A	6	6	2191416	2191421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_007516	AG	3	6	2191494	2191499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_007516	GA	3	6	2191511	2191516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_007516	GCC	2	6	2191572	2191577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6083	NC_007516	CCG	2	6	2196355	2196360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6084	NC_007516	GAA	2	6	2198299	2198304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_007516	TGAA	2	8	2198314	2198321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_007516	TCAA	2	8	2200437	2200444	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6087	NC_007516	ATG	2	6	2205701	2205706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_007516	TTTC	2	8	2205732	2205739	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6089	NC_007516	CGG	2	6	2206235	2206240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_007516	AACC	2	8	2208597	2208604	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6091	NC_007516	GGA	2	6	2210638	2210643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_007516	GCCA	2	8	2210672	2210679	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6093	NC_007516	GCC	2	6	2210701	2210706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6094	NC_007516	CTG	2	6	2211460	2211465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_007516	TG	3	6	2213496	2213501	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_007516	TGA	2	6	2213518	2213523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_007516	GTGA	2	8	2213599	2213606	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_007516	CGATTC	2	12	2215222	2215233	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_007516	GCA	2	6	2215683	2215688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_007516	CAGG	2	8	2219181	2219188	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6101	NC_007516	GCGAA	2	10	2219206	2219215	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6102	NC_007516	ACCA	2	8	2219238	2219245	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6103	NC_007516	GTCC	2	8	2219305	2219312	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6104	NC_007516	GA	3	6	2222376	2222381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_007516	CGAAG	2	10	2222383	2222392	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6106	NC_007516	AGTG	2	8	2223558	2223565	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_007516	CGG	2	6	2229479	2229484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_007516	GCC	2	6	2229907	2229912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6109	NC_007516	TCC	2	6	2232825	2232830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6110	NC_007516	CCG	2	6	2234024	2234029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6111	NC_007516	GC	4	8	2236437	2236444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6112	NC_007516	CCA	2	6	2237045	2237050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6113	NC_007516	GGT	2	6	2237067	2237072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_007516	ACC	2	6	2239911	2239916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6115	NC_007516	GCG	2	6	2241125	2241130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_007516	AAC	2	6	2242222	2242227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_007516	CGC	2	6	2245791	2245796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6118	NC_007516	GCA	2	6	2248388	2248393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_007516	AGC	2	6	2250259	2250264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_007516	GGAGTT	2	12	2250280	2250291	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_007516	ATC	2	6	2257090	2257095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_007516	CGC	2	6	2259323	2259328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6123	NC_007516	CTG	2	6	2259360	2259365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_007516	AACGCA	2	12	2265706	2265717	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_007516	GCCATT	2	12	2265764	2265775	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_007516	ACG	2	6	2269088	2269093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_007516	ACA	2	6	2273355	2273360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_007516	ACAG	2	8	2274145	2274152	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6129	NC_007516	TG	3	6	2274189	2274194	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_007516	T	6	6	2274282	2274287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_007516	A	9	9	2274307	2274315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6253	NC_007516	GCTGA	2	10	2304573	2304582	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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6255	NC_007516	GCTCA	2	10	2304606	2304615	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6256	NC_007516	ACA	2	6	2310738	2310743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6258	NC_007516	CT	3	6	2310836	2310841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6259	NC_007516	AC	3	6	2310842	2310847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6260	NC_007516	CCA	2	6	2310859	2310864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6261	NC_007516	TGA	2	6	2310867	2310872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6263	NC_007516	AATC	2	8	2311054	2311061	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6264	NC_007516	ATCAAC	2	12	2313775	2313786	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6265	NC_007516	GAT	2	6	2313805	2313810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6266	NC_007516	TCT	2	6	2313839	2313844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6268	NC_007516	CT	3	6	2313900	2313905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6376	NC_007516	GGCG	2	8	2339476	2339483	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6377	NC_007516	CAACA	2	10	2339941	2339950	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6378	NC_007516	AGA	2	6	2339951	2339956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6383	NC_007516	CTG	2	6	2349361	2349366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6387	NC_007516	A	6	6	2353339	2353344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6388	NC_007516	CCG	2	6	2356897	2356902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6389	NC_007516	TGA	2	6	2356931	2356936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6391	NC_007516	CGT	2	6	2359733	2359738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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