MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 4626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007513	CGT	2	6	1595650	1595655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_007513	TAA	2	6	1598932	1598937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_007513	CAA	2	6	1598947	1598952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_007513	ACT	2	6	1598985	1598990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_007513	CAA	2	6	1599006	1599011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_007513	CAAT	2	8	1599023	1599030	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3507	NC_007513	CGA	2	6	1600421	1600426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_007513	CAC	2	6	1600624	1600629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_007513	TAAG	2	8	1604171	1604178	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_007513	ACC	2	6	1604182	1604187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_007513	TCT	2	6	1605487	1605492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_007513	AGC	2	6	1608867	1608872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_007513	GGT	2	6	1611664	1611669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_007513	TGA	2	6	1611705	1611710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_007513	CAG	2	6	1611711	1611716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_007513	GCG	2	6	1611720	1611725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_007513	TCA	2	6	1611794	1611799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_007513	CGT	2	6	1611819	1611824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_007513	ATG	2	6	1611837	1611842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_007513	AGG	2	6	1611861	1611866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_007513	AGC	2	6	1611873	1611878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_007513	CG	3	6	1612406	1612411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_007513	ACA	2	6	1614788	1614793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_007513	GCC	2	6	1614856	1614861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3525	NC_007513	AGC	2	6	1618358	1618363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_007513	ACC	2	6	1619122	1619127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_007513	AAC	2	6	1620604	1620609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_007513	GGT	2	6	1620885	1620890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_007513	CTC	2	6	1620917	1620922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3530	NC_007513	CCGA	2	8	1620981	1620988	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_007513	GCT	2	6	1621002	1621007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_007513	ACC	2	6	1624439	1624444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_007513	TG	3	6	1624464	1624469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_007513	TCC	2	6	1624521	1624526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3535	NC_007513	AAT	2	6	1624528	1624533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_007513	C	6	6	1624564	1624569	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3537	NC_007513	AGA	2	6	1624578	1624583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_007513	CACT	2	8	1624632	1624639	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3539	NC_007513	GTT	2	6	1626655	1626660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_007513	GGC	2	6	1626724	1626729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_007513	CAA	2	6	1627712	1627717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_007513	GCAGG	2	10	1627764	1627773	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3543	NC_007513	ATT	2	6	1627799	1627804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_007513	CAAT	2	8	1627879	1627886	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3545	NC_007513	ACG	2	6	1627890	1627895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_007513	CTG	2	6	1629392	1629397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_007513	AAG	2	6	1629424	1629429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_007513	CAAA	2	8	1629448	1629455	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3549	NC_007513	A	7	7	1630434	1630440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_007513	TGAA	2	8	1630461	1630468	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_007513	ATC	2	6	1631114	1631119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_007513	CAT	2	6	1632718	1632723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_007513	CAA	2	6	1633276	1633281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_007513	A	6	6	1633280	1633285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_007513	ACTA	2	8	1633319	1633326	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3556	NC_007513	AATTT	2	10	1633327	1633336	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_007513	AAGCA	2	10	1633352	1633361	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3558	NC_007513	CTT	2	6	1633373	1633378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_007513	ACC	2	6	1633850	1633855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3560	NC_007513	TGT	2	6	1633905	1633910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_007513	TCA	2	6	1633913	1633918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_007513	A	6	6	1635897	1635902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_007513	GC	3	6	1635915	1635920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3564	NC_007513	T	8	8	1636128	1636135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_007513	CCG	2	6	1636207	1636212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3566	NC_007513	GATGA	2	10	1636218	1636227	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_007513	GAA	2	6	1636264	1636269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_007513	GTG	2	6	1641248	1641253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_007513	AGC	2	6	1642416	1642421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_007513	ACAGA	2	10	1644787	1644796	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3571	NC_007513	GAT	2	6	1644821	1644826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_007513	ATA	2	6	1646706	1646711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_007513	CAA	3	9	1646716	1646724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_007513	AGCT	2	8	1648933	1648940	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3575	NC_007513	GCA	2	6	1648981	1648986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_007513	AAG	2	6	1648987	1648992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_007513	GA	3	6	1649035	1649040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_007513	AATA	2	8	1649063	1649070	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_007513	A	6	6	1649078	1649083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_007513	TGC	2	6	1649086	1649091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_007513	TCC	2	6	1649103	1649108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3582	NC_007513	ATC	2	6	1649162	1649167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_007513	GAC	2	6	1649169	1649174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_007513	TGA	2	6	1649305	1649310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_007513	TGG	2	6	1649325	1649330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_007513	ACC	3	9	1649387	1649395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3587	NC_007513	CCA	2	6	1649438	1649443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3588	NC_007513	GCC	2	6	1649575	1649580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3589	NC_007513	C	6	6	1649892	1649897	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3590	NC_007513	T	7	7	1649898	1649904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_007513	TGAAGA	2	12	1649942	1649953	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_007513	ATCA	2	8	1649970	1649977	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3593	NC_007513	CTG	2	6	1650524	1650529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_007513	CCG	2	6	1651541	1651546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3595	NC_007513	GTC	2	6	1652681	1652686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_007513	TCC	2	6	1655608	1655613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_007513	CGG	2	6	1656151	1656156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_007513	ATCA	2	8	1660829	1660836	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3599	NC_007513	CAG	2	6	1660842	1660847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_007513	GAT	2	6	1660882	1660887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_007513	T	6	6	1662250	1662255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_007513	TCG	2	6	1663925	1663930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_007513	T	7	7	1664106	1664112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_007513	TCC	2	6	1668265	1668270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_007513	CTCCC	2	10	1668287	1668296	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3606	NC_007513	CATC	2	8	1670105	1670112	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3607	NC_007513	CTTC	2	8	1670929	1670936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3608	NC_007513	CTT	2	6	1670989	1670994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_007513	CTAA	2	8	1671002	1671009	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3610	NC_007513	A	6	6	1671008	1671013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_007513	A	6	6	1671029	1671034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_007513	AAT	2	6	1671042	1671047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_007513	ATTG	2	8	1671051	1671058	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_007513	ACG	2	6	1673520	1673525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_007513	CCA	2	6	1679093	1679098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3616	NC_007513	ATG	2	6	1680876	1680881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_007513	AGC	2	6	1680904	1680909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_007513	A	6	6	1680962	1680967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_007513	ATC	2	6	1680974	1680979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_007513	TC	3	6	1680991	1680996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3621	NC_007513	TGT	2	6	1681014	1681019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_007513	A	6	6	1681036	1681041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_007513	ACA	2	6	1681043	1681048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_007513	ACA	2	6	1681111	1681116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_007513	G	6	6	1683247	1683252	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_007513	GAA	2	6	1684335	1684340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_007513	GCC	2	6	1686339	1686344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3628	NC_007513	TGGCT	2	10	1686398	1686407	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3629	NC_007513	GGC	2	6	1698379	1698384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3631	NC_007513	ACC	2	6	1705225	1705230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3894	NC_007513	ACT	2	6	1800437	1800442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3897	NC_007513	CGAG	2	8	1800489	1800496	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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