MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 4626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_007513	TTA	2	6	1176181	1176186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_007513	A	6	6	1181074	1181079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_007513	GTC	2	6	1181386	1181391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_007513	CGG	2	6	1186203	1186208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_007513	GGA	2	6	1186242	1186247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_007513	AACC	2	8	1187633	1187640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2507	NC_007513	CAG	2	6	1190153	1190158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_007513	AG	3	6	1190157	1190162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_007513	A	9	9	1190173	1190181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_007513	CAG	2	6	1190223	1190228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_007513	GA	3	6	1190241	1190246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_007513	GA	3	6	1190260	1190265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_007513	CA	3	6	1190344	1190349	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2514	NC_007513	CA	4	8	1190388	1190395	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2515	NC_007513	TTA	2	6	1190472	1190477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_007513	TA	3	6	1190490	1190495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_007513	AT	3	6	1190526	1190531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_007513	ACG	2	6	1190672	1190677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_007513	AACC	2	8	1190682	1190689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2520	NC_007513	GCA	2	6	1190726	1190731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_007513	GCA	2	6	1191480	1191485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_007513	CGA	2	6	1191548	1191553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_007513	CAA	2	6	1191590	1191595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_007513	TCAA	2	8	1191636	1191643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2525	NC_007513	TTC	2	6	1191678	1191683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_007513	GAATC	2	10	1191724	1191733	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2527	NC_007513	CATG	2	8	1191762	1191769	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2529	NC_007513	ATT	2	6	1192113	1192118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_007513	TAG	2	6	1192132	1192137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_007513	AC	3	6	1192222	1192227	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2532	NC_007513	T	7	7	1192248	1192254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_007513	TCAG	2	8	1192280	1192287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2534	NC_007513	GCT	2	6	1192362	1192367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_007513	AATA	2	8	1195602	1195609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_007513	T	6	6	1195610	1195615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2542	NC_007513	A	6	6	1201287	1201292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_007513	TCC	2	6	1202684	1202689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2544	NC_007513	TTG	2	6	1202889	1202894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2547	NC_007513	GCA	2	6	1202947	1202952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2551	NC_007513	CGG	2	6	1212117	1212122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2553	NC_007513	ACC	2	6	1213957	1213962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2554	NC_007513	A	6	6	1213976	1213981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_007513	TTTCAA	2	12	1214206	1214217	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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2557	NC_007513	CGTT	2	8	1217805	1217812	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2558	NC_007513	GTT	2	6	1220647	1220652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2562	NC_007513	TC	3	6	1229421	1229426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2563	NC_007513	GTT	2	6	1230881	1230886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2571	NC_007513	ACA	2	6	1241858	1241863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_007513	GCA	2	6	1241864	1241869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2584	NC_007513	TCAT	2	8	1250423	1250430	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2585	NC_007513	TA	3	6	1250441	1250446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2592	NC_007513	TGG	2	6	1250710	1250715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_007513	CA	4	8	1250741	1250748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2594	NC_007513	TTGA	2	8	1250805	1250812	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2596	NC_007513	TCGA	2	8	1250893	1250900	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2597	NC_007513	A	8	8	1250903	1250910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_007513	CAAT	2	8	1250959	1250966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2599	NC_007513	ACT	2	6	1250984	1250989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2601	NC_007513	GATC	2	8	1251156	1251163	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2602	NC_007513	AATA	2	8	1254293	1254300	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_007513	CAAA	2	8	1254304	1254311	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2604	NC_007513	A	6	6	1254309	1254314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_007513	ATCA	2	8	1254321	1254328	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2606	NC_007513	GAT	2	6	1254329	1254334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2608	NC_007513	CGA	2	6	1255565	1255570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_007513	GCC	2	6	1255615	1255620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2610	NC_007513	C	6	6	1255619	1255624	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2611	NC_007513	CGA	2	6	1256327	1256332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_007513	G	6	6	1256340	1256345	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_007513	A	6	6	1256440	1256445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_007513	GCA	2	6	1256473	1256478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2617	NC_007513	A	7	7	1266943	1266949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_007513	CCA	2	6	1267005	1267010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2619	NC_007513	GGCC	2	8	1268848	1268855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2620	NC_007513	TTGGT	2	10	1269975	1269984	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_007513	ACTG	2	8	1269988	1269995	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2622	NC_007513	AATC	2	8	1270075	1270082	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2623	NC_007513	G	6	6	1270083	1270088	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2625	NC_007513	TTTGA	2	10	1270486	1270495	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_007513	ACT	2	6	1270522	1270527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2627	NC_007513	GTA	2	6	1270533	1270538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_007513	CGC	2	6	1270559	1270564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2629	NC_007513	CAA	2	6	1270594	1270599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2630	NC_007513	AAC	2	6	1270646	1270651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2631	NC_007513	A	6	6	1270682	1270687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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