MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 4626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007513	AGG	2	6	376621	376626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_007513	AGG	2	6	376646	376651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_007513	AGC	2	6	376662	376667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_007513	TCC	2	6	376888	376893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_007513	AGCCA	2	10	377014	377023	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
506	NC_007513	GAG	2	6	377058	377063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_007513	GCT	2	6	377099	377104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_007513	GGTGG	2	10	377190	377199	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
509	NC_007513	CT	4	8	377227	377234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
510	NC_007513	CGG	2	6	377444	377449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_007513	GA	3	6	377540	377545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_007513	CCT	2	6	377802	377807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_007513	GC	3	6	377822	377827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_007513	GAAG	2	8	377876	377883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_007513	CGT	2	6	378133	378138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_007513	GGA	2	6	378211	378216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_007513	GAA	2	6	378358	378363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_007513	GGA	2	6	378409	378414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_007513	TTG	2	6	378472	378477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_007513	TATC	2	8	378540	378547	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
521	NC_007513	ATCC	2	8	378579	378586	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
522	NC_007513	GCG	2	6	378611	378616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_007513	G	6	6	378626	378631	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
524	NC_007513	A	9	9	378675	378683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_007513	ATT	2	6	378708	378713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_007513	GAA	2	6	378719	378724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_007513	ACC	2	6	378725	378730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_007513	GGT	2	6	378739	378744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_007513	CAT	2	6	379752	379757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_007513	T	6	6	379780	379785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_007513	GATG	2	8	381973	381980	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
532	NC_007513	ACG	3	9	381983	381991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_007513	GTT	2	6	381998	382003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_007513	TG	3	6	382010	382015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
535	NC_007513	GCT	2	6	382042	382047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_007513	CAG	3	9	382098	382106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_007513	TAG	2	6	382108	382113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_007513	GCG	2	6	382138	382143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_007513	A	6	6	382154	382159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_007513	C	6	6	382160	382165	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
541	NC_007513	TTG	2	6	382183	382188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_007513	TTG	2	6	382397	382402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_007513	GTG	2	6	384961	384966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_007513	CAG	2	6	384973	384978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_007513	GCT	2	6	384994	384999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_007513	TGT	2	6	385121	385126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_007513	TCC	2	6	385158	385163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_007513	GC	3	6	385165	385170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_007513	TCT	2	6	385945	385950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_007513	GTCA	2	8	385990	385997	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
551	NC_007513	GTC	3	9	387186	387194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_007513	CGT	2	6	387236	387241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_007513	GGA	2	6	387342	387347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_007513	CAT	2	6	387405	387410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_007513	GGCG	2	8	387469	387476	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
556	NC_007513	CTG	2	6	389794	389799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_007513	GAG	2	6	390159	390164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_007513	TAC	2	6	390192	390197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_007513	ACC	2	6	390203	390208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_007513	GGA	2	6	398544	398549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_007513	TGAT	2	8	400537	400544	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
562	NC_007513	TGG	2	6	400619	400624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_007513	AAGTG	2	10	400646	400655	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
564	NC_007513	GTT	2	6	403671	403676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_007513	AAG	2	6	403680	403685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_007513	TCC	2	6	403708	403713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_007513	GC	3	6	403722	403727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
568	NC_007513	GTT	2	6	403797	403802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_007513	TTG	2	6	408758	408763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_007513	TCA	2	6	408785	408790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_007513	TCA	2	6	408799	408804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_007513	CGC	2	6	410553	410558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_007513	AAG	2	6	410987	410992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_007513	GAC	2	6	411002	411007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_007513	AATG	2	8	411483	411490	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
576	NC_007513	TTG	2	6	411516	411521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_007513	TTTAG	2	10	411584	411593	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
578	NC_007513	TGT	2	6	411712	411717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_007513	CAG	2	6	411764	411769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_007513	GCT	2	6	411791	411796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_007513	ATT	2	6	411797	411802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_007513	T	6	6	411801	411806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_007513	AT	3	6	412578	412583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_007513	ATCA	2	8	412600	412607	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
585	NC_007513	T	6	6	412642	412647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_007513	TGG	3	9	412656	412664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_007513	CGT	2	6	412675	412680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_007513	T	6	6	412709	412714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_007513	GTCT	2	8	412732	412739	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
590	NC_007513	GTT	2	6	412803	412808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_007513	AGG	2	6	412920	412925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_007513	TACT	2	8	412941	412948	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
593	NC_007513	ATT	2	6	412953	412958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_007513	GATTT	2	10	412971	412980	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
595	NC_007513	A	7	7	415879	415885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_007513	TCC	2	6	415917	415922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_007513	G	6	6	416731	416736	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
598	NC_007513	TTC	2	6	416744	416749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_007513	AGT	2	6	416794	416799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_007513	TGA	2	6	417421	417426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_007513	CTG	2	6	417434	417439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_007513	GAG	2	6	418424	418429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_007513	TCC	2	6	418436	418441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_007513	GATC	2	8	418456	418463	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
605	NC_007513	TC	3	6	418556	418561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_007513	T	6	6	420389	420394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_007513	GGGC	2	8	426452	426459	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
608	NC_007513	TTGC	2	8	428687	428694	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
609	NC_007513	G	6	6	429056	429061	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
610	NC_007513	GCG	2	6	432281	432286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_007513	GTT	2	6	433363	433368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_007513	CAT	2	6	433511	433516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_007513	TGG	2	6	433557	433562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_007513	GCG	2	6	435286	435291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_007513	CCGG	2	8	435328	435335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
616	NC_007513	TGG	2	6	435386	435391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_007513	TGG	2	6	437218	437223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_007513	TTG	2	6	437226	437231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_007513	TCAC	2	8	437235	437242	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
620	NC_007513	TCAA	2	8	437257	437264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
621	NC_007513	GTTC	2	8	438421	438428	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
622	NC_007513	CAG	2	6	442069	442074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_007513	T	6	6	442519	442524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_007513	TGT	2	6	444488	444493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_007513	GAC	2	6	444500	444505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_007513	TCC	2	6	444596	444601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_007513	AGG	2	6	444636	444641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_007513	AAC	2	6	444684	444689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_007513	AGC	2	6	444710	444715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_007513	TGC	2	6	444722	444727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_007513	C	6	6	444795	444800	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
632	NC_007513	CAA	2	6	444803	444808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_007513	CGC	2	6	444943	444948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_007513	CGA	2	6	445881	445886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_007513	CTTTC	2	10	445942	445951	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
636	NC_007513	T	7	7	445982	445988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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638	NC_007513	A	6	6	446050	446055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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