MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus agalactiae A909 chromosome

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007432	ATGAAG	2	12	15985	15996	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007432	TAAGGA	2	12	17949	17960	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007432	ACTAAT	2	12	21101	21112	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_007432	TAAGGA	2	12	23781	23792	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007432	ACTAAT	2	12	26933	26944	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_007432	ATTAAT	2	12	28561	28572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007432	ATCAAA	2	12	49596	49607	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_007432	TAAGGA	2	12	92470	92481	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007432	ACTAAT	2	12	95624	95635	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_007432	TTCGGG	2	12	96749	96760	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_007432	TGTTAT	2	12	151938	151949	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007432	TTAAAA	2	12	153309	153320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007432	TTAAAT	2	12	164711	164722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007432	TAAGGA	2	12	176715	176726	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007432	ACTAAT	2	12	179869	179880	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007432	CTTGTT	2	12	189123	189134	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_007432	AAATAA	2	12	238591	238602	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007432	AAAATG	2	12	245146	245157	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007432	TAAGGA	2	12	261304	261315	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007432	ACTAAT	2	12	264456	264467	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_007432	TTCGGG	2	12	265341	265352	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_007432	TAAGGA	2	12	360206	360217	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007432	ACTAAT	2	12	363358	363369	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_007432	ATAGTT	2	12	376766	376777	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007432	AAGTTT	2	12	410966	410977	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007432	TAAGGA	2	12	429349	429360	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007432	ACTAAT	2	12	432501	432512	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_007432	AAATAA	2	12	437604	437615	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007432	GCCATC	2	12	437850	437861	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007432	TCTGCT	2	12	437899	437910	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007432	TGCTAT	2	12	480409	480420	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_007432	CTTTGA	2	12	493824	493835	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007432	TTTATA	2	12	514459	514470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007432	TAGCAA	2	12	583632	583643	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_007432	ATAATG	2	12	587720	587731	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007432	TTTCTG	2	12	597897	597908	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_007432	CTTTTT	2	12	699070	699081	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_007432	TATCGT	2	12	708945	708956	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007432	ATTACC	2	12	720806	720817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007432	CAAGCT	2	12	721317	721328	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007432	TTTAAA	2	12	727599	727610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007432	TAAAAC	2	12	748122	748133	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007432	ATCTTA	2	12	760282	760293	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_007432	AGATAA	2	12	769833	769844	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007432	AGGACT	2	12	864053	864064	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_007432	TTTTTA	2	12	904304	904315	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007432	TTTAGT	2	12	905075	905086	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007432	AAAACA	2	12	910256	910267	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_007432	AAAGAT	2	12	980197	980208	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007432	ACAATA	2	12	1021996	1022007	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_007432	TTAAAA	2	12	1023483	1023494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007432	AAAAAT	2	12	1048467	1048478	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007432	TCATTT	2	12	1116578	1116589	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_007432	AATTAA	2	12	1151843	1151854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007432	ATTTTA	2	12	1176490	1176501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007432	CCCGAA	2	12	1209943	1209954	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007432	TAACCT	2	12	1284432	1284443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007432	ACAGAA	2	12	1311362	1311373	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_007432	ATTCAG	2	12	1311774	1311785	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_007432	ATCATT	2	12	1368970	1368981	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_007432	TTGCAA	2	12	1418577	1418588	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_007432	CAGTTA	2	12	1425661	1425672	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_007432	TTTCTC	2	12	1476465	1476476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007432	TATCCA	2	12	1488004	1488015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007432	TTATCT	2	12	1488233	1488244	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_007432	ACTCCA	2	12	1520868	1520879	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007432	TTTTCT	2	12	1525080	1525091	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_007432	TCTCCT	2	12	1560869	1560880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007432	AAAAAT	2	12	1572002	1572013	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007432	AGCTTT	2	12	1592902	1592913	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_007432	ATTTCA	2	12	1624819	1624830	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_007432	CTTTTT	2	12	1663977	1663988	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_007432	TTTTAT	2	12	1687258	1687269	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007432	AAATAA	2	12	1699317	1699328	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007432	ATATTT	2	12	1699571	1699582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007432	ATAAAA	2	12	1699614	1699625	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007432	ACTATT	2	12	1700079	1700090	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_007432	AATATT	2	12	1700140	1700151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007432	TAATCA	2	12	1701832	1701843	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_007432	CTTTAT	2	12	1712055	1712066	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_007432	TTTCAT	2	12	1732771	1732782	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_007432	CATTTA	2	12	1758567	1758578	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_007432	AAAAGT	2	12	1786956	1786967	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007432	TTCAAT	2	12	1834111	1834122	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_007432	TTTTTG	2	12	1891002	1891013	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007432	ATCTTT	2	12	1893317	1893328	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_007432	GTACTT	2	12	1921003	1921014	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_007432	CTTCTG	2	12	1944488	1944499	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007432	AGAAAC	2	12	1950313	1950324	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_007432	TATCAA	2	12	1951248	1951259	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_007432	GTTTTC	2	12	1960196	1960207	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_007432	TATTCT	2	12	1971349	1971360	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_007432	TCAATC	2	12	2007361	2007372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007432	ATAGTT	2	12	2023942	2023953	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007432	TTCAAG	2	12	2024104	2024115	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_007432	TAAAAA	2	12	2042139	2042150	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007432	TTTTTA	2	12	2052209	2052220	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007432	CTATTT	2	12	2075109	2075120	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_007432	TTGGCG	2	12	2080032	2080043	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_007432	TAAATT	2	12	2111601	2111612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007432	CTATAA	2	12	2125514	2125525	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.