MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus agalactiae A909 chromosome

Total Repeats: 945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007432	TTGA	2	8	4443	4450	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007432	TAGA	2	8	10009	10016	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007432	GTTA	2	8	16074	16081	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007432	ACGA	2	8	16302	16309	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007432	GTTA	2	8	16595	16602	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007432	GTGA	2	8	16808	16815	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007432	TAAC	2	8	16891	16898	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_007432	AGCG	2	8	16979	16986	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007432	TGGT	2	8	17644	17651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007432	AGCC	2	8	17861	17868	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007432	GTAA	2	8	18316	18323	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007432	GAAG	2	8	18398	18405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007432	GCGA	2	8	18472	18479	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007432	ATTC	2	8	19338	19345	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007432	CTAA	2	8	19694	19701	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007432	TAGG	2	8	20349	20356	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007432	ACGA	2	8	22134	22141	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007432	GTTA	2	8	22427	22434	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007432	GTGA	2	8	22640	22647	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007432	TAAC	2	8	22723	22730	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007432	AGCG	2	8	22811	22818	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007432	TGGT	2	8	23476	23483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007432	AGCC	2	8	23693	23700	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007432	GTAA	2	8	24148	24155	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007432	GAAG	2	8	24230	24237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007432	GCGA	2	8	24304	24311	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_007432	ATTC	2	8	25170	25177	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007432	CTAA	2	8	25526	25533	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_007432	TAGG	2	8	26181	26188	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007432	TATT	2	8	28005	28012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007432	GCGT	2	8	28174	28181	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007432	ATTA	2	8	30239	30246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007432	AATT	2	8	33392	33399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007432	TAAA	2	8	35633	35640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007432	TTAA	2	8	36430	36437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007432	AGAA	2	8	40509	40516	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007432	TAGT	2	8	43064	43071	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007432	ACTA	2	8	47225	47232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007432	AGAA	2	8	59123	59130	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007432	AGTT	2	8	63814	63821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007432	GAAA	2	8	74443	74450	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007432	TAAA	2	8	82507	82514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007432	ATTA	2	8	82803	82810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007432	ATTT	2	8	87017	87024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007432	ACAA	2	8	88143	88150	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_007432	AATC	2	8	90370	90377	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007432	ACGA	2	8	90823	90830	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007432	GTTA	2	8	91116	91123	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007432	GTGA	2	8	91329	91336	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007432	TAAC	2	8	91412	91419	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_007432	AGCG	2	8	91500	91507	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007432	TGGT	2	8	92165	92172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007432	AGCC	2	8	92382	92389	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007432	GTAA	2	8	92839	92846	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007432	GAAG	2	8	92921	92928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007432	GCGA	2	8	92995	93002	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_007432	ATTC	2	8	93861	93868	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007432	CTAA	2	8	94217	94224	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_007432	TAGG	2	8	94872	94879	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007432	GCGT	2	8	96501	96508	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007432	GATA	2	8	97360	97367	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007432	TTGT	2	8	98732	98739	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007432	TTCT	2	8	98771	98778	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_007432	ATTA	2	8	98791	98798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007432	TAAA	2	8	107016	107023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007432	TCTA	2	8	114705	114712	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_007432	ATCA	2	8	115544	115551	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007432	AACT	2	8	115574	115581	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007432	ACTT	2	8	118928	118935	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007432	CAGA	2	8	121145	121152	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007432	AAGT	2	8	122589	122596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007432	AGTT	2	8	122818	122825	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007432	ACTT	2	8	124095	124102	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007432	CTTT	2	8	131509	131516	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007432	TATT	2	8	135261	135268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007432	AAAT	2	8	135272	135279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007432	AATA	2	8	135317	135324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007432	GAAA	2	8	140038	140045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007432	GAAG	2	8	140068	140075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007432	TTAT	2	8	143676	143683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007432	ATGA	2	8	143735	143742	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007432	AAAT	2	8	143916	143923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007432	ATTG	2	8	145191	145198	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007432	CAAC	2	8	145544	145551	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_007432	TTTA	2	8	149203	149210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007432	CTTT	2	8	149801	149808	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_007432	TGAA	2	8	152945	152952	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007432	ACAA	2	8	155923	155930	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_007432	AGGA	2	8	155931	155938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007432	AAAG	2	8	164726	164733	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007432	TAAA	2	8	168894	168901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007432	AAAG	2	8	170768	170775	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007432	ACGA	2	8	175069	175076	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_007432	GTTA	2	8	175361	175368	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007432	GTGA	2	8	175574	175581	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007432	TAAC	2	8	175657	175664	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_007432	AGCG	2	8	175745	175752	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_007432	TGGT	2	8	176410	176417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007432	AGCC	2	8	176627	176634	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007432	GTAA	2	8	177084	177091	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007432	GAAG	2	8	177166	177173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007432	GCGA	2	8	177240	177247	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_007432	ATTC	2	8	178106	178113	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_007432	CTAA	2	8	178462	178469	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_007432	TAGG	2	8	179117	179124	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007432	CTAT	2	8	181179	181186	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_007432	GATT	2	8	181187	181194	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007432	AGAC	2	8	184759	184766	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_007432	TGTT	2	8	184855	184862	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007432	ATGT	2	8	188943	188950	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007432	TTTG	2	8	200921	200928	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007432	TTAA	2	8	206930	206937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007432	TGAC	2	8	207014	207021	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_007432	AAGG	2	8	213399	213406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007432	ATTT	2	8	219938	219945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007432	TTTC	2	8	224052	224059	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007432	ATTC	2	8	224090	224097	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007432	ATTT	2	8	231538	231545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007432	AATG	2	8	231606	231613	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007432	AGCC	2	8	238542	238549	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_007432	TTTA	2	8	239749	239756	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007432	TAAA	2	8	243135	243142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007432	AAAT	2	8	243240	243247	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007432	ATTC	2	8	248875	248882	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_007432	TTGA	2	8	248981	248988	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007432	ATTT	2	8	249772	249779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007432	ATTG	2	8	249822	249829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007432	ACGA	2	8	259658	259665	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_007432	GTTA	2	8	259950	259957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007432	GTGA	2	8	260163	260170	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007432	TAAC	2	8	260246	260253	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_007432	AGCG	2	8	260334	260341	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_007432	TGGT	2	8	260999	261006	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007432	AGCC	2	8	261216	261223	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007432	GTAA	2	8	261671	261678	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007432	GAAG	2	8	261753	261760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007432	GCGA	2	8	261827	261834	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_007432	ATTC	2	8	262693	262700	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_007432	CTAA	2	8	263049	263056	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_007432	TAGG	2	8	263704	263711	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007432	GCGT	2	8	265093	265100	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_007432	ATTA	2	8	267393	267400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007432	AATT	2	8	267496	267503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007432	CAAG	2	8	268079	268086	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_007432	TATT	2	8	270449	270456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007432	TGTT	2	8	270549	270556	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007432	ATTT	2	8	270858	270865	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007432	ATAA	2	8	270889	270896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007432	TAAA	2	8	271042	271049	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007432	GAAG	2	8	272056	272063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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