MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 1617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007384	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007384	AT	3	6	5613	5618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007384	CG	3	6	8330	8335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007384	CG	3	6	8522	8527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007384	TA	3	6	8801	8806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007384	AT	3	6	12918	12923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007384	CT	3	6	16496	16501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007384	GA	3	6	21791	21796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007384	TA	3	6	23600	23605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007384	TC	3	6	27279	27284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007384	GT	3	6	27893	27898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007384	TC	3	6	27899	27904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007384	AT	3	6	42156	42161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007384	TC	3	6	56487	56492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007384	AT	3	6	56530	56535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007384	GA	3	6	59040	59045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007384	GT	3	6	66679	66684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007384	AG	3	6	77917	77922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007384	AT	3	6	92629	92634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007384	TG	3	6	93949	93954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007384	CT	3	6	93957	93962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007384	CA	3	6	98643	98648	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007384	GA	3	6	114638	114643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007384	CT	3	6	116862	116867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007384	GT	3	6	125374	125379	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007384	TC	3	6	125451	125456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007384	AG	3	6	129399	129404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007384	GT	3	6	130824	130829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007384	TA	3	6	131170	131175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007384	TA	3	6	132131	132136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007384	AT	3	6	137124	137129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007384	AC	3	6	143512	143517	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007384	TC	3	6	147793	147798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007384	TG	3	6	150261	150266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007384	GA	3	6	157016	157021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007384	TC	3	6	157030	157035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007384	CA	3	6	160371	160376	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007384	TC	3	6	162150	162155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007384	GA	3	6	167232	167237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007384	TA	3	6	168907	168912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007384	AG	3	6	171399	171404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007384	TG	3	6	174916	174921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007384	GC	3	6	178782	178787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007384	GA	3	6	178850	178855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007384	CT	3	6	191138	191143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007384	TG	3	6	194196	194201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007384	TA	3	6	195298	195303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007384	AT	4	8	204461	204468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007384	GC	3	6	204627	204632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007384	AC	4	8	204697	204704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_007384	TA	3	6	204777	204782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007384	GC	3	6	207603	207608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007384	TG	4	8	207743	207750	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007384	AG	3	6	209654	209659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007384	CA	3	6	239823	239828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007384	TG	3	6	239967	239972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007384	AC	3	6	241308	241313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_007384	AC	3	6	241477	241482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007384	CA	3	6	241653	241658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007384	TC	3	6	242016	242021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007384	GT	5	10	242354	242363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007384	GC	3	6	242384	242389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_007384	AC	3	6	243014	243019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007384	GA	3	6	243720	243725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007384	GT	3	6	244915	244920	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007384	GA	3	6	245002	245007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007384	AG	3	6	245237	245242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007384	AT	3	6	253622	253627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007384	TA	4	8	253670	253677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007384	TA	3	6	253711	253716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007384	AT	3	6	254728	254733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007384	AT	3	6	255652	255657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007384	TA	3	6	255702	255707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007384	TC	3	6	255710	255715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007384	TG	3	6	256090	256095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007384	TC	3	6	256126	256131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_007384	TG	3	6	277588	277593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007384	TA	3	6	277666	277671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007384	TA	3	6	277713	277718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007384	AT	4	8	277878	277885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007384	AT	3	6	287550	287555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007384	TA	3	6	287563	287568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007384	TC	3	6	287663	287668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_007384	TA	3	6	288111	288116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007384	AT	3	6	288133	288138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007384	TC	3	6	288155	288160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007384	TA	3	6	288346	288351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007384	AC	3	6	295979	295984	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007384	AT	3	6	296762	296767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007384	AT	3	6	303766	303771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007384	AC	3	6	303847	303852	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_007384	CG	3	6	306291	306296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_007384	CG	3	6	312101	312106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_007384	AT	3	6	312167	312172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007384	AG	4	8	315627	315634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007384	AG	3	6	315674	315679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007384	TG	3	6	315755	315760	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007384	TC	3	6	316179	316184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_007384	TG	3	6	316440	316445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007384	TG	3	6	316479	316484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007384	AG	3	6	318126	318131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007384	CA	4	8	318174	318181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_007384	CT	3	6	318254	318259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_007384	AT	3	6	318281	318286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007384	TA	3	6	319755	319760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007384	GC	6	12	326493	326504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_007384	AG	3	6	326811	326816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007384	CA	3	6	328025	328030	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_007384	CA	3	6	333265	333270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_007384	CA	3	6	333312	333317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007384	CT	3	6	334760	334765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_007384	TC	3	6	335624	335629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007384	GT	3	6	344322	344327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007384	TG	3	6	348428	348433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007384	TA	3	6	348737	348742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007384	AT	3	6	352336	352341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007384	CT	3	6	353337	353342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_007384	GC	3	6	356186	356191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_007384	TA	3	6	364041	364046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007384	CG	3	6	366202	366207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_007384	TA	3	6	367660	367665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007384	AT	3	6	367710	367715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007384	AG	3	6	373909	373914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007384	AT	3	6	383974	383979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007384	TG	3	6	384029	384034	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007384	CT	3	6	391896	391901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_007384	AT	3	6	393385	393390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007384	TA	3	6	404450	404455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007384	AT	3	6	416103	416108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007384	AC	3	6	417270	417275	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_007384	TG	3	6	432508	432513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007384	TG	3	6	432713	432718	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007384	AG	3	6	435598	435603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007384	GT	3	6	440445	440450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007384	GC	3	6	443739	443744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_007384	AG	4	8	447673	447680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007384	GC	3	6	450653	450658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_007384	GC	3	6	452798	452803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_007384	TA	3	6	459555	459560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007384	CT	3	6	464704	464709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_007384	CA	3	6	465141	465146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_007384	TG	3	6	467483	467488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007384	TG	3	6	472190	472195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007384	CT	3	6	482467	482472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_007384	GA	4	8	486251	486258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007384	TC	3	6	487254	487259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_007384	CG	3	6	492147	492152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_007384	GA	3	6	498256	498261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007384	GC	3	6	501461	501466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_007384	TC	3	6	507121	507126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_007384	AG	3	6	509101	509106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007384	GC	4	8	511576	511583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_007384	AT	3	6	516138	516143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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