MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 19064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007384	TTG	2	6	1124161	1124166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_007384	C	6	6	1124951	1124956	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4003	NC_007384	GT	3	6	1124958	1124963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_007384	A	7	7	1124974	1124980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_007384	CTT	2	6	1125002	1125007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_007384	G	7	7	1125023	1125029	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_007384	TCGCT	2	10	1125036	1125045	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4008	NC_007384	C	6	6	1125131	1125136	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4009	NC_007384	GT	3	6	1125138	1125143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_007384	A	8	8	1125154	1125161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_007384	CTT	2	6	1125183	1125188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_007384	G	7	7	1125204	1125210	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_007384	AC	3	6	1125238	1125243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4014	NC_007384	CAA	2	6	1125343	1125348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_007384	A	6	6	1125357	1125362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_007384	CG	3	6	1125364	1125369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4017	NC_007384	TCAA	2	8	1125382	1125389	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4018	NC_007384	TG	3	6	1125390	1125395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_007384	TAA	2	6	1125400	1125405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_007384	T	7	7	1125417	1125423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_007384	TGG	2	6	1125449	1125454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_007384	GA	3	6	1126500	1126505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_007384	AT	3	6	1127262	1127267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_007384	ATC	2	6	1127830	1127835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_007384	TGT	2	6	1127862	1127867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_007384	ATT	2	6	1128456	1128461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_007384	ATT	2	6	1129317	1129322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_007384	T	6	6	1129775	1129780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_007384	T	6	6	1130223	1130228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_007384	TCT	2	6	1130236	1130241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_007384	TGA	2	6	1130281	1130286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_007384	AACG	2	8	1130289	1130296	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4033	NC_007384	TTA	2	6	1130307	1130312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_007384	AGG	2	6	1130361	1130366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_007384	CGC	2	6	1130446	1130451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4036	NC_007384	ACA	2	6	1130475	1130480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_007384	TCC	2	6	1130490	1130495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4038	NC_007384	A	6	6	1130503	1130508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_007384	CAA	2	6	1130570	1130575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_007384	TTG	2	6	1130586	1130591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_007384	AAT	2	6	1130617	1130622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_007384	CAT	2	6	1130645	1130650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_007384	AGA	2	6	1130655	1130660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_007384	ATA	2	6	1130661	1130666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_007384	AT	3	6	1130677	1130682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_007384	TGC	2	6	1130697	1130702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_007384	ATG	2	6	1130722	1130727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_007384	CCT	2	6	1130772	1130777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4049	NC_007384	GTG	2	6	1130795	1130800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_007384	TGC	2	6	1131519	1131524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_007384	AG	3	6	1131526	1131531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_007384	AAG	2	6	1131544	1131549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_007384	CAA	2	6	1131560	1131565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_007384	ATG	2	6	1131603	1131608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_007384	T	7	7	1131618	1131624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_007384	CTG	2	6	1131689	1131694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_007384	TG	3	6	1131693	1131698	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_007384	TAA	2	6	1131702	1131707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_007384	TTA	2	6	1131842	1131847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_007384	TGC	2	6	1131866	1131871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_007384	ATG	2	6	1131891	1131896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_007384	CCT	2	6	1131941	1131946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_007384	GTG	2	6	1131964	1131969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_007384	A	6	6	1132676	1132681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_007384	TAA	2	6	1132705	1132710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_007384	A	6	6	1132718	1132723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_007384	GTT	3	9	1132756	1132764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_007384	T	6	6	1132763	1132768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_007384	GCA	2	6	1132841	1132846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_007384	AAG	2	6	1132860	1132865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_007384	T	6	6	1132923	1132928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_007384	A	7	7	1132977	1132983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_007384	CG	3	6	1132995	1133000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_007384	TTA	2	6	1133007	1133012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_007384	AAC	2	6	1133075	1133080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_007384	AATC	2	8	1133607	1133614	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4077	NC_007384	CAT	2	6	1134085	1134090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_007384	TGT	2	6	1134157	1134162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_007384	T	7	7	1136255	1136261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_007384	GAA	2	6	1136267	1136272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_007384	TTG	2	6	1136608	1136613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_007384	GA	3	6	1136639	1136644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_007384	CTG	2	6	1136650	1136655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_007384	AAC	2	6	1137046	1137051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_007384	CTG	2	6	1137092	1137097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_007384	AAG	2	6	1137112	1137117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_007384	AGG	2	6	1137123	1137128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_007384	TTG	2	6	1140313	1140318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_007384	CAT	2	6	1140376	1140381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_007384	ATAA	2	8	1140423	1140430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_007384	TGT	2	6	1140552	1140557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_007384	GATCG	2	10	1140585	1140594	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4093	NC_007384	CA	3	6	1140602	1140607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4094	NC_007384	AAC	2	6	1144832	1144837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_007384	T	7	7	1146309	1146315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_007384	TGA	2	6	1146954	1146959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_007384	TAT	2	6	1148133	1148138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_007384	AGA	2	6	1148143	1148148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_007384	A	6	6	1148350	1148355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_007384	AGG	2	6	1148367	1148372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_007384	AG	3	6	1148433	1148438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_007384	CTGAGA	2	12	1148457	1148468	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4103	NC_007384	TACCT	2	10	1148532	1148541	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4104	NC_007384	CT	3	6	1148577	1148582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4105	NC_007384	TTTC	2	8	1148590	1148597	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4106	NC_007384	AAG	2	6	1148703	1148708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_007384	AAC	2	6	1148763	1148768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_007384	CTT	2	6	1148780	1148785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_007384	CCT	2	6	1148852	1148857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4110	NC_007384	AGCC	2	8	1148885	1148892	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4111	NC_007384	TGG	2	6	1148921	1148926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_007384	TGTCT	2	10	1149005	1149014	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4113	NC_007384	TGT	2	6	1149041	1149046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_007384	CTATAG	2	12	1149047	1149058	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4115	NC_007384	CTA	2	6	1149181	1149186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_007384	ACAT	2	8	1149192	1149199	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4117	NC_007384	TTC	2	6	1149228	1149233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_007384	CCTGA	2	10	1150548	1150557	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4119	NC_007384	CCA	2	6	1150582	1150587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4120	NC_007384	C	6	6	1150603	1150608	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4121	NC_007384	GAC	2	6	1150617	1150622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_007384	CTGG	2	8	1150646	1150653	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4123	NC_007384	GGGGTA	2	12	1150690	1150701	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_007384	TA	4	8	1150700	1150707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_007384	G	6	6	1150710	1150715	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_007384	AACTT	2	10	1150797	1150806	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4127	NC_007384	GTT	2	6	1151579	1151584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_007384	CAAT	2	8	1153235	1153242	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4129	NC_007384	CGAT	2	8	1153287	1153294	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4130	NC_007384	AGT	2	6	1153311	1153316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_007384	A	7	7	1153326	1153332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_007384	AAG	2	6	1153344	1153349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_007384	AG	3	6	1153445	1153450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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