MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 19064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007384	CAT	2	6	1030076	1030081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_007384	T	7	7	1033602	1033608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_007384	GTT	2	6	1033629	1033634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_007384	T	6	6	1033645	1033650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_007384	TTTTC	2	10	1033768	1033777	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3506	NC_007384	TTATT	2	10	1034578	1034587	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_007384	T	6	6	1036401	1036406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_007384	TGT	2	6	1036411	1036416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_007384	TTCTT	2	10	1036511	1036520	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3510	NC_007384	A	8	8	1037062	1037069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_007384	GCA	2	6	1037074	1037079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_007384	ATC	2	6	1038162	1038167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_007384	A	8	8	1038336	1038343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_007384	T	6	6	1038368	1038373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_007384	AGA	2	6	1038390	1038395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_007384	A	7	7	1038469	1038475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_007384	AATC	2	8	1039011	1039018	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3518	NC_007384	GTACA	2	10	1039045	1039054	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3519	NC_007384	ACA	2	6	1039062	1039067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_007384	TTATG	2	10	1039202	1039211	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_007384	GGC	2	6	1042472	1042477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_007384	T	7	7	1042488	1042494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_007384	AAT	2	6	1042535	1042540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_007384	AAT	3	9	1045892	1045900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_007384	CAC	2	6	1046586	1046591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3526	NC_007384	AGG	2	6	1046609	1046614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_007384	CAT	2	6	1046659	1046664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_007384	GCA	2	6	1046684	1046689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_007384	TACT	2	8	1046701	1046708	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3530	NC_007384	GAT	2	6	1047709	1047714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_007384	CGGC	2	8	1047753	1047760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3532	NC_007384	GAT	2	6	1047779	1047784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_007384	AAAT	2	8	1047791	1047798	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_007384	TCA	2	6	1047805	1047810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_007384	TTCA	2	8	1047845	1047852	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3536	NC_007384	CAA	2	6	1047922	1047927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_007384	CGG	2	6	1047932	1047937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_007384	CGCGAT	2	12	1047967	1047978	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_007384	GCA	2	6	1047985	1047990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_007384	CAT	2	6	1048000	1048005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_007384	AGG	2	6	1048081	1048086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_007384	ACC	2	6	1048139	1048144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3543	NC_007384	GCG	2	6	1048187	1048192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_007384	GGC	2	6	1048201	1048206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_007384	GTA	2	6	1048223	1048228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_007384	CCA	2	6	1048255	1048260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3547	NC_007384	TTC	2	6	1048277	1048282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_007384	GCA	2	6	1048288	1048293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_007384	GGC	2	6	1048299	1048304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_007384	CTT	2	6	1048342	1048347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_007384	T	6	6	1048346	1048351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_007384	TAAT	2	8	1048414	1048421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_007384	CG	3	6	1048424	1048429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3554	NC_007384	CAG	2	6	1048451	1048456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_007384	GCA	2	6	1048459	1048464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_007384	CGAT	2	8	1048482	1048489	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3557	NC_007384	CAGT	2	8	1048559	1048566	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3558	NC_007384	TTG	2	6	1048583	1048588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_007384	CGG	2	6	1048593	1048598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_007384	A	8	8	1048600	1048607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_007384	CG	3	6	1048645	1048650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3562	NC_007384	TGA	2	6	1048701	1048706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_007384	CAA	2	6	1048708	1048713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_007384	GGCT	2	8	1048732	1048739	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3565	NC_007384	CGA	2	6	1048785	1048790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_007384	TAAGGA	2	12	1048912	1048923	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3568	NC_007384	ATT	2	6	1049538	1049543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_007384	GGC	2	6	1049561	1049566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_007384	A	6	6	1049575	1049580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_007384	CT	3	6	1050294	1050299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3572	NC_007384	TAAT	2	8	1050310	1050317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_007384	AGC	2	6	1050320	1050325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_007384	ATAATG	2	12	1050326	1050337	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_007384	CTTAT	2	10	1050482	1050491	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3576	NC_007384	GCG	2	6	1050610	1050615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_007384	TTTG	3	12	1050629	1050640	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_007384	CAG	2	6	1050681	1050686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_007384	TCA	2	6	1050697	1050702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3581	NC_007384	TGC	2	6	1050840	1050845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_007384	ATG	2	6	1050865	1050870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_007384	CCT	2	6	1050915	1050920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3584	NC_007384	GTG	2	6	1050938	1050943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_007384	TTA	2	6	1051621	1051626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_007384	ATC	2	6	1054704	1054709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_007384	GCG	2	6	1054849	1054854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_007384	TTG	2	6	1054954	1054959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_007384	TGG	2	6	1055010	1055015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3591	NC_007384	ATC	2	6	1055138	1055143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3593	NC_007384	TGG	2	6	1055205	1055210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_007384	CAT	2	6	1055326	1055331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_007384	CGA	2	6	1055335	1055340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3597	NC_007384	TC	3	6	1057358	1057363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_007384	GCG	2	6	1060197	1060202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_007384	GCATC	2	10	1060208	1060217	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3600	NC_007384	CAAT	2	8	1060221	1060228	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3601	NC_007384	A	6	6	1061564	1061569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_007384	TGA	2	6	1061600	1061605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_007384	GAA	2	6	1061611	1061616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_007384	CGC	2	6	1061649	1061654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_007384	AATGT	2	10	1065466	1065475	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3607	NC_007384	A	7	7	1068999	1069005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_007384	TACG	2	8	1069417	1069424	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3609	NC_007384	TA	3	6	1069496	1069501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_007384	ATT	2	6	1069544	1069549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_007384	ATTA	2	8	1069638	1069645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_007384	TTG	2	6	1069646	1069651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_007384	ATG	2	6	1069773	1069778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3615	NC_007384	TAA	2	6	1070089	1070094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_007384	CCG	2	6	1070118	1070123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3617	NC_007384	CAC	2	6	1070787	1070792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3618	NC_007384	AGG	2	6	1070810	1070815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_007384	CAT	2	6	1070860	1070865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_007384	GCA	2	6	1070885	1070890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_007384	CCG	2	6	1070895	1070900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3622	NC_007384	TAAAA	2	10	1070907	1070916	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_007384	AGAC	2	8	1070964	1070971	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3624	NC_007384	AGT	2	6	1070981	1070986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_007384	CTT	2	6	1071022	1071027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_007384	TC	4	8	1071033	1071040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3627	NC_007384	AGT	2	6	1071051	1071056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_007384	GAAG	2	8	1071095	1071102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_007384	TTA	2	6	1071330	1071335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3631	NC_007384	T	6	6	1071435	1071440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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