MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 19064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007384	AGTAA	2	10	886728	886737	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_007384	AT	3	6	886740	886745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_007384	AGG	2	6	886878	886883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_007384	TC	3	6	887558	887563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_007384	AG	3	6	888754	888759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_007384	GC	3	6	890272	890277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3007	NC_007384	CTG	2	6	890289	890294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_007384	ATT	2	6	890315	890320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_007384	T	6	6	890389	890394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_007384	TA	3	6	890446	890451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_007384	GA	3	6	890470	890475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_007384	A	6	6	890502	890507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_007384	CGGG	2	8	891714	891721	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3014	NC_007384	CAC	2	6	891724	891729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3015	NC_007384	CAT	2	6	891749	891754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_007384	CA	3	6	891765	891770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3017	NC_007384	AGC	2	6	891784	891789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_007384	TCG	2	6	895287	895292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_007384	TGA	2	6	895297	895302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_007384	GCG	2	6	896503	896508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_007384	AGCGC	2	10	896577	896586	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3022	NC_007384	TCA	2	6	896607	896612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_007384	AATA	2	8	897436	897443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_007384	AAT	2	6	897450	897455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_007384	A	8	8	897467	897474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_007384	CGC	2	6	897548	897553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_007384	C	7	7	897617	897623	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3028	NC_007384	AAT	2	6	900572	900577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_007384	ATT	2	6	900617	900622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_007384	GGT	2	6	900652	900657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_007384	TTA	2	6	901256	901261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_007384	ATT	2	6	901301	901306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_007384	ACTT	2	8	901402	901409	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3034	NC_007384	TGG	2	6	901506	901511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_007384	TCC	2	6	901518	901523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_007384	AAG	2	6	901546	901551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_007384	GAT	2	6	901645	901650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_007384	ATA	2	6	901714	901719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_007384	TTAT	2	8	901720	901727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_007384	GAA	2	6	901770	901775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_007384	GTT	2	6	901784	901789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_007384	TTAA	2	8	901801	901808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_007384	GAG	2	6	901851	901856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_007384	TGT	2	6	903664	903669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_007384	ATA	2	6	903679	903684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_007384	GAT	2	6	903776	903781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_007384	CTT	2	6	903801	903806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_007384	AACA	2	8	903854	903861	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3049	NC_007384	GATC	2	8	903866	903873	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3050	NC_007384	ATG	2	6	906089	906094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_007384	TC	4	8	907565	907572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_007384	TTA	2	6	908585	908590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_007384	GA	3	6	910399	910404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_007384	AGG	2	6	910406	910411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_007384	ATC	2	6	910444	910449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_007384	GATT	2	8	913190	913197	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_007384	GGC	2	6	913210	913215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_007384	AG	3	6	913230	913235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_007384	TGG	2	6	914309	914314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_007384	GCG	2	6	914447	914452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_007384	G	7	7	914472	914478	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_007384	GCG	3	9	914485	914493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_007384	GCC	2	6	914498	914503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3064	NC_007384	GC	3	6	914508	914513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_007384	CAA	2	6	914559	914564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_007384	GAT	2	6	914565	914570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_007384	AAC	2	6	914583	914588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_007384	A	7	7	914594	914600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_007384	TTAA	2	8	914629	914636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_007384	CAG	2	6	914648	914653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_007384	ACC	2	6	914669	914674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3072	NC_007384	GCC	2	6	914681	914686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3073	NC_007384	CAC	2	6	914696	914701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_007384	AGA	2	6	914704	914709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_007384	GTT	2	6	914716	914721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_007384	GCC	2	6	914732	914737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3077	NC_007384	TGC	2	6	914758	914763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_007384	GC	3	6	914762	914767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_007384	TGC	2	6	914938	914943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_007384	ATG	2	6	914963	914968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_007384	CCT	2	6	915013	915018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3082	NC_007384	GTG	2	6	915036	915041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_007384	TAA	2	6	915773	915778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_007384	A	6	6	915777	915782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_007384	AT	3	6	915785	915790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_007384	ATT	2	6	915798	915803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_007384	TGT	2	6	915810	915815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_007384	ATT	2	6	915852	915857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_007384	TCA	2	6	915897	915902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_007384	TTG	2	6	918673	918678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3092	NC_007384	AG	3	6	922142	922147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_007384	GAT	2	6	922308	922313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3096	NC_007384	TGA	2	6	922472	922477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3099	NC_007384	A	7	7	923825	923831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_007384	TCT	3	9	923840	923848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_007384	ATT	2	6	923872	923877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_007384	T	6	6	923945	923950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_007384	TGGT	2	8	924031	924038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_007384	TGC	2	6	924041	924046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_007384	ATG	2	6	924066	924071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_007384	CCT	2	6	924116	924121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3107	NC_007384	GTG	2	6	924139	924144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_007384	TTTAA	2	10	924818	924827	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_007384	AT	3	6	924862	924867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_007384	TA	3	6	924888	924893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_007384	AAAT	2	8	924925	924932	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_007384	A	6	6	925008	925013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_007384	GCT	2	6	925061	925066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_007384	CAA	2	6	925955	925960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_007384	GAG	2	6	925968	925973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_007384	AC	4	8	926011	926018	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3117	NC_007384	TG	3	6	926029	926034	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_007384	ATC	2	6	926069	926074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_007384	CGC	2	6	926140	926145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3120	NC_007384	AGG	2	6	926157	926162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_007384	AT	3	6	926272	926277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_007384	ATAA	2	8	926486	926493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_007384	TGG	2	6	928290	928295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_007384	TCCT	2	8	928343	928350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3125	NC_007384	ACA	2	6	928697	928702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_007384	TTA	2	6	928751	928756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_007384	CAGA	2	8	928780	928787	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3128	NC_007384	TGA	2	6	928796	928801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_007384	GTC	2	6	929582	929587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_007384	TG	3	6	929593	929598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_007384	ATT	2	6	929625	929630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_007384	AT	3	6	929672	929677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_007384	AGA	2	6	929822	929827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_007384	CAT	2	6	929836	929841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_007384	A	6	6	929868	929873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3137	NC_007384	TAT	2	6	929937	929942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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