MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 19064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_007384	GAT	2	6	469429	469434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_007384	GCG	2	6	469437	469442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_007384	ATC	2	6	469546	469551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_007384	TCTG	2	8	469647	469654	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_007384	TTA	2	6	470823	470828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_007384	AGG	2	6	470881	470886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_007384	TAG	2	6	471504	471509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_007384	TG	3	6	472190	472195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_007384	TAA	2	6	472244	472249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_007384	ATT	2	6	472276	472281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_007384	TAA	2	6	472520	472525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_007384	CTT	2	6	472913	472918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_007384	A	6	6	472952	472957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_007384	ATT	2	6	473028	473033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_007384	AGGA	2	8	473050	473057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_007384	GCA	2	6	473097	473102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_007384	TAA	2	6	473198	473203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_007384	GAAT	2	8	473209	473216	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_007384	AAT	2	6	473231	473236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_007384	ATT	2	6	473263	473268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_007384	TAAC	2	8	473297	473304	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1522	NC_007384	T	6	6	473313	473318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_007384	TGG	2	6	473367	473372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_007384	A	6	6	473407	473412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_007384	TAA	2	6	477861	477866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_007384	TGC	2	6	477873	477878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_007384	TAT	2	6	477884	477889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_007384	CGT	2	6	477890	477895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_007384	TACA	2	8	477903	477910	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_007384	ATGT	2	8	477918	477925	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_007384	TCG	2	6	478639	478644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_007384	CGT	2	6	478664	478669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_007384	TTC	2	6	478701	478706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_007384	TTCA	2	8	478720	478727	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1535	NC_007384	GTT	2	6	482144	482149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_007384	GCG	2	6	482160	482165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_007384	ATTT	2	8	482295	482302	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_007384	CT	3	6	482467	482472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_007384	ACA	2	6	483064	483069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_007384	CAA	2	6	483458	483463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_007384	ATT	2	6	483475	483480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_007384	CAGGCG	2	12	483515	483526	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_007384	AAC	2	6	483538	483543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_007384	ACC	2	6	483579	483584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_007384	TGC	2	6	484173	484178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_007384	GA	4	8	486251	486258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_007384	ATT	2	6	487234	487239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_007384	TC	3	6	487254	487259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_007384	ATT	2	6	487289	487294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_007384	TCA	2	6	489225	489230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_007384	TGG	2	6	489304	489309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_007384	A	7	7	489329	489335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_007384	GCA	2	6	490015	490020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_007384	TTC	3	9	490080	490088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_007384	CAA	2	6	490111	490116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_007384	CTG	2	6	492120	492125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_007384	CG	3	6	492147	492152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1558	NC_007384	CGC	2	6	492177	492182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_007384	ACC	2	6	492190	492195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_007384	AAC	2	6	492202	492207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_007384	TCG	2	6	493518	493523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_007384	CGC	2	6	493549	493554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_007384	ACC	2	6	493638	493643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_007384	TGG	2	6	495338	495343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_007384	TGA	2	6	495405	495410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_007384	AAT	2	6	495419	495424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_007384	A	7	7	495458	495464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_007384	CAGG	2	8	495580	495587	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1569	NC_007384	TCA	2	6	496433	496438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_007384	TCTG	2	8	496447	496454	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1571	NC_007384	TAA	2	6	496478	496483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_007384	TTG	2	6	496531	496536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_007384	AGGA	2	8	496884	496891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_007384	ATT	2	6	498098	498103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_007384	CGT	2	6	498126	498131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1577	NC_007384	ATG	2	6	498209	498214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_007384	TCAGG	2	10	498246	498255	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1579	NC_007384	GA	3	6	498256	498261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_007384	A	7	7	500455	500461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_007384	AAGC	2	8	500464	500471	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1582	NC_007384	A	8	8	500491	500498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_007384	ATA	3	9	500578	500586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_007384	A	7	7	500586	500592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_007384	GC	3	6	501461	501466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_007384	CGC	2	6	501954	501959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1588	NC_007384	GCC	2	6	502091	502096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1589	NC_007384	AGC	2	6	502101	502106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1596	NC_007384	A	7	7	507179	507185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_007384	AGG	2	6	507224	507229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1600	NC_007384	AG	3	6	509101	509106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_007384	GCA	2	6	510628	510633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_007384	GC	4	8	511576	511583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1603	NC_007384	AT	3	6	516138	516143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_007384	CGC	2	6	516182	516187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_007384	AATA	2	8	516216	516223	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_007384	T	6	6	516245	516250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_007384	GC	3	6	517436	517441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_007384	TCT	2	6	517553	517558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1611	NC_007384	A	6	6	517682	517687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_007384	GCG	2	6	517712	517717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_007384	AAT	2	6	517741	517746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_007384	CCG	2	6	517815	517820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1615	NC_007384	GAT	2	6	517872	517877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_007384	CCG	2	6	517878	517883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1617	NC_007384	GTT	2	6	518104	518109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_007384	CAT	2	6	518139	518144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_007384	CCAG	2	8	518175	518182	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_007384	TCG	2	6	518307	518312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_007384	TGT	2	6	518540	518545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_007384	CAC	2	6	519227	519232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1623	NC_007384	AGG	2	6	519250	519255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_007384	CAT	2	6	519300	519305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_007384	GCA	2	6	519325	519330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_007384	CCT	2	6	519334	519339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_007384	CAT	2	6	519377	519382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_007384	GAAAC	2	10	519459	519468	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1629	NC_007384	GC	3	6	519475	519480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1630	NC_007384	CT	4	8	519535	519542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1631	NC_007384	CAT	2	6	520728	520733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_007384	TTA	2	6	520742	520747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_007384	CGC	2	6	520752	520757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1634	NC_007384	ATC	2	6	520825	520830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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